RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000471880.5

SSR4-208, Transcript of signal sequence receptor subunit 4, human

TSL 5

Gene SSR4, Length 785 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
SSR4-208	ENST00000471880	SCGB1A1	P11684	91 aa		6.75	□□□□□ -1.33
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		6.74	□□□□□ -1.33
SSR4-208	ENST00000471880	NDUFC1	O43677	76 aa		6.73	□□□□□ -1.33
SSR4-208	ENST00000471880	KLKP1	Q107X0	134 aa		6.73	□□□□□ -1.33
SSR4-208	ENST00000471880	OCR1	Q9BZK8	76 aa		6.73	□□□□□ -1.33
SSR4-208	ENST00000471880	MACF1	Q9UPN3	7388 aa	Known RBP	6.73	□□□□□ -1.33
SSR4-208	ENST00000471880		A8MUN3	132 aa		6.68	□□□□□ -1.34
SSR4-208	ENST00000471880		Q5VV11	94 aa		6.67	□□□□□ -1.34
SSR4-208	ENST00000471880	IMUP	Q9GZP8	106 aa		6.66	□□□□□ -1.34
SSR4-208	ENST00000471880	SPRR2G	Q9BYE4	73 aa		6.63	□□□□□ -1.35
SSR4-208	ENST00000471880		H3BPC8	53 aa		6.62	□□□□□ -1.35
SSR4-208	ENST00000471880	SYNE2	Q8WXH0	6885 aa	Known RBP	6.61	□□□□□ -1.35
SSR4-208	ENST00000471880	MT1B	P07438	61 aa		6.61	□□□□□ -1.35
SSR4-208	ENST00000471880		K7ERU9	68 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SSR4-208	ENST00000471880	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		6.59	□□□□□ -1.35
SSR4-208	ENST00000471880		A6NN06	94 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SSR4-208	ENST00000471880	CRIPT	Q9P021	101 aa		6.58	□□□□□ -1.36
SSR4-208	ENST00000471880	MT-ATP8	P03928	68 aa		6.57	□□□□□ -1.36
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP19-8	Q3LI54	63 aa		6.56	□□□□□ -1.36
SSR4-208	ENST00000471880		H0YAA0	97 aa		6.54	□□□□□ -1.36
SSR4-208	ENST00000471880	DMAC1	Q96GE9	116 aa		6.51	□□□□□ -1.37
SSR4-208	ENST00000471880	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		6.49	□□□□□ -1.37
SSR4-208	ENST00000471880	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		6.48	□□□□□ -1.37
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP6-3	Q3LI67	103 aa		6.45	□□□□□ -1.38
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP10-5	P60370	271 aa		6.43	□□□□□ -1.38
SSR4-208	ENST00000471880	C20orf197	Q8N268	126 aa		6.43	□□□□□ -1.38
SSR4-208	ENST00000471880		R4GN34	69 aa		6.43	□□□□□ -1.38
SSR4-208	ENST00000471880	ACYP2	P14621	99 aa		6.41	□□□□□ -1.38
SSR4-208	ENST00000471880		P0C880	135 aa		6.4	□□□□□ -1.38
SSR4-208	ENST00000471880	SNURF	Q9Y675	71 aa		6.4	□□□□□ -1.38
SSR4-208	ENST00000471880	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		6.38	□□□□□ -1.39
SSR4-208	ENST00000471880		M0QZ58	72 aa		6.38	□□□□□ -1.39
SSR4-208	ENST00000471880	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SSR4-208	ENST00000471880	PLAC4	Q8WY50	150 aa		6.36	□□□□□ -1.39
SSR4-208	ENST00000471880	LINC01554	Q52M75	96 aa		6.35	□□□□□ -1.39
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SSR4-208	ENST00000471880	PRO2289	Q9P1D8	64 aa		6.29	□□□□□ -1.4
SSR4-208	ENST00000471880	SERP2	Q8N6R1	65 aa		6.28	□□□□□ -1.4
SSR4-208	ENST00000471880	NEB	P20929	6669 aa		6.23	□□□□□ -1.41
SSR4-208	ENST00000471880	SPANXA2-OT1	Q8N9U9	137 aa		6.21	□□□□□ -1.42
SSR4-208	ENST00000471880	MT1X	P80297	61 aa		6.2	□□□□□ -1.42
SSR4-208	ENST00000471880	MUC12	Q9UKN1	5478 aa		6.18	□□□□□ -1.42
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP5-9	P26371	169 aa		6.17	□□□□□ -1.42
SSR4-208	ENST00000471880	COX7C	P15954	63 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SSR4-208	ENST00000471880	COA5	Q86WW8	74 aa		6.11	□□□□□ -1.43
SSR4-208	ENST00000471880	KMT2D	O14686	5537 aa		6.09	□□□□□ -1.43
SSR4-208	ENST00000471880	SEC61G	P60059	68 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP8-1	Q8IUC2	63 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SSR4-208	ENST00000471880	SPRR2F	Q96RM1	72 aa		6.04	□□□□□ -1.44
SSR4-208	ENST00000471880	MDN1	Q9NU22	5596 aa		6.03	□□□□□ -1.44
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP12-2	P59991	146 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SSR4-208	ENST00000471880	SERP1	Q9Y6X1	66 aa		6.01	□□□□□ -1.45
SSR4-208	ENST00000471880	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		5.99	□□□□□ -1.45
SSR4-208	ENST00000471880		H7BZZ5	65 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP13-4	Q3LI77	160 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SSR4-208	ENST00000471880	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		5.98	□□□□□ -1.45
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP20-1	Q3LI63	56 aa		5.97	□□□□□ -1.45
SSR4-208	ENST00000471880	CAMK2N1	Q7Z7J9	78 aa		5.96	□□□□□ -1.46
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP4-8	A0A0G2JLE6	195 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP10-7	P60409	375 aa	Predicted RBP	5.95	□□□□□ -1.46
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP4-8	Q9BYQ9	185 aa		5.95	□□□□□ -1.46
SSR4-208	ENST00000471880	SPRR2E	P22531	72 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SSR4-208	ENST00000471880	SPRR2B	P35325	72 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SSR4-208	ENST00000471880	SPRR2A	P35326	72 aa		5.94	□□□□□ -1.46
SSR4-208	ENST00000471880		A0A0D9SG42	100 aa		5.93	□□□□□ -1.46
SSR4-208	ENST00000471880	SPATA8	Q6RVD6	105 aa		5.88	□□□□□ -1.47
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GU33	70 aa		5.87	□□□□□ -1.47
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP10-12	P60413	245 aa		5.86	□□□□□ -1.47
SSR4-208	ENST00000471880	LCE1A	Q5T7P2	110 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SSR4-208	ENST00000471880	SPINT4	Q6UDR6	99 aa		5.85	□□□□□ -1.47
SSR4-208	ENST00000471880		A0A1B0GU69	56 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SSR4-208	ENST00000471880	CCDC179	H3BU77	68 aa		5.83	□□□□□ -1.48
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		5.79	□□□□□ -1.48
SSR4-208	ENST00000471880	SPRR2D	P22532	72 aa		5.75	□□□□□ -1.49
SSR4-208	ENST00000471880	SMIM26	A0A096LP01	95 aa		5.72	□□□□□ -1.49
SSR4-208	ENST00000471880	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	5.72	□□□□□ -1.49
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP12-1	P59990	96 aa		5.7	□□□□□ -1.5
SSR4-208	ENST00000471880		A8MU10	97 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SSR4-208	ENST00000471880	PRR15L	Q9BU68	103 aa		5.68	□□□□□ -1.5
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP2-2	Q9BYT5	123 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		5.61	□□□□□ -1.51
SSR4-208	ENST00000471880	TMEM258	P61165	79 aa		5.59	□□□□□ -1.51
SSR4-208	ENST00000471880	LCE3B	Q5TA77	95 aa		5.56	□□□□□ -1.52
SSR4-208	ENST00000471880	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		5.55	□□□□□ -1.52
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP19-7	Q3SYF9	63 aa		5.53	□□□□□ -1.52
SSR4-208	ENST00000471880	MT1E	P04732	61 aa		5.49	□□□□□ -1.53
SSR4-208	ENST00000471880	TNP1	P09430	55 aa		5.47	□□□□□ -1.53
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP19-5	Q3LI72	72 aa		5.46	□□□□□ -1.54
SSR4-208	ENST00000471880	UQCR11	O14957	56 aa		5.45	□□□□□ -1.54
SSR4-208	ENST00000471880	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SSR4-208	ENST00000471880	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		5.44	□□□□□ -1.54
SSR4-208	ENST00000471880	LCE5A	Q5TCM9	118 aa		5.42	□□□□□ -1.54
SSR4-208	ENST00000471880	LCE3A	Q5TA76	89 aa		5.39	□□□□□ -1.55
SSR4-208	ENST00000471880	MIR22HG	Q0VDD5	57 aa		5.36	□□□□□ -1.55
SSR4-208	ENST00000471880	DST	Q03001	7570 aa	Known RBP	5.36	□□□□□ -1.55
SSR4-208	ENST00000471880	PSPHP1	O15172	72 aa		5.32	□□□□□ -1.56
SSR4-208	ENST00000471880	PP632	Q6XCG6	107 aa		5.32	□□□□□ -1.56
SSR4-208	ENST00000471880	MT1G	P13640	62 aa		5.31	□□□□□ -1.56
SSR4-208	ENST00000471880		V9GYY9	64 aa		5.3	□□□□□ -1.56

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