RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000468164.1

C9orf3-212, Transcript of chromosome 9 open reading frame 3, humanhuman

TSL 5

Gene C9orf3, Length 849 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf3-212ENST00000468164 CSAG1Q6PB30 78 aa6.13□□□□□ -1.43
C9orf3-212ENST00000468164 LCA10Q71F78 164 aa6.13□□□□□ -1.43
C9orf3-212ENST00000468164 K7ERU9 68 aa6.11□□□□□ -1.43
C9orf3-212ENST00000468164 SCGB1A1P11684 91 aa6.1□□□□□ -1.43
C9orf3-212ENST00000468164 MP68P56378 58 aa6.09□□□□□ -1.43
C9orf3-212ENST00000468164 Q5VV11 94 aa6.06□□□□□ -1.44
C9orf3-212ENST00000468164 LINC00208Q96KT6 92 aa6.06□□□□□ -1.44
C9orf3-212ENST00000468164 A6NN06 94 aa6.05□□□□□ -1.44
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.05□□□□□ -1.44
C9orf3-212ENST00000468164 OCR1Q9BZK8 76 aa6.05□□□□□ -1.44
C9orf3-212ENST00000468164 MT1BP07438 61 aa6.03□□□□□ -1.44
C9orf3-212ENST00000468164 IMUPQ9GZP8 106 aa6.03□□□□□ -1.44
C9orf3-212ENST00000468164 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.01□□□□□ -1.45
C9orf3-212ENST00000468164 H3BPC8 53 aa6□□□□□ -1.45
C9orf3-212ENST00000468164 KLKP1Q107X0 134 aa6□□□□□ -1.45
C9orf3-212ENST00000468164 MT-ATP8P03928 68 aa5.99□□□□□ -1.45
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa5.98□□□□□ -1.45
C9orf3-212ENST00000468164 A8MUN3 132 aa5.96□□□□□ -1.46
C9orf3-212ENST00000468164 SMIM20Q8N5G0 67 aa5.94□□□□□ -1.46
C9orf3-212ENST00000468164 NDUFC1O43677 76 aa5.93□□□□□ -1.46
C9orf3-212ENST00000468164 MUC12Q9UKN1 5478 aa5.92□□□□□ -1.46
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP10-5P60370 271 aa5.91□□□□□ -1.46
C9orf3-212ENST00000468164 TRAV7A0A075B6U4 112 aa5.9□□□□□ -1.46
C9orf3-212ENST00000468164 NEBP20929 6669 aa5.89□□□□□ -1.47
C9orf3-212ENST00000468164 CRIPTQ9P021 101 aa5.88□□□□□ -1.47
C9orf3-212ENST00000468164 DMAC1Q96GE9 116 aa5.82□□□□□ -1.48
C9orf3-212ENST00000468164 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.81□□□□□ -1.48
C9orf3-212ENST00000468164 H0YAA0 97 aa5.78□□□□□ -1.48
C9orf3-212ENST00000468164 SERP2Q8N6R1 65 aa5.76□□□□□ -1.49
C9orf3-212ENST00000468164 MDN1Q9NU22 5596 aa5.75□□□□□ -1.49
C9orf3-212ENST00000468164 ACYP2P14621 99 aa5.75□□□□□ -1.49
C9orf3-212ENST00000468164 SNURFQ9Y675 71 aa5.75□□□□□ -1.49
C9orf3-212ENST00000468164 KMT2DO14686 5537 aa5.75□□□□□ -1.49
C9orf3-212ENST00000468164 C20orf197Q8N268 126 aa5.73□□□□□ -1.49
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP5-9P26371 169 aa5.72□□□□□ -1.49
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa5.7□□□□□ -1.5
C9orf3-212ENST00000468164 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.7□□□□□ -1.5
C9orf3-212ENST00000468164 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.69□□□□□ -1.5
C9orf3-212ENST00000468164 PLAC4Q8WY50 150 aa5.69□□□□□ -1.5
C9orf3-212ENST00000468164 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.68□□□□□ -1.5
C9orf3-212ENST00000468164 R4GN34 69 aa5.67□□□□□ -1.5
C9orf3-212ENST00000468164 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.66□□□□□ -1.5
C9orf3-212ENST00000468164 P0C880 135 aa5.65□□□□□ -1.5
C9orf3-212ENST00000468164 M0QZ58 72 aa5.64□□□□□ -1.51
C9orf3-212ENST00000468164 MT1XP80297 61 aa5.63□□□□□ -1.51
C9orf3-212ENST00000468164 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.63□□□□□ -1.51
C9orf3-212ENST00000468164 COX7CP15954 63 aa5.61□□□□□ -1.51
C9orf3-212ENST00000468164 LINC01554Q52M75 96 aa5.61□□□□□ -1.51
C9orf3-212ENST00000468164 SPRR2EP22531 72 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-212ENST00000468164 SPRR2BP35325 72 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-212ENST00000468164 SPRR2AP35326 72 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.56□□□□□ -1.52
C9orf3-212ENST00000468164 ANAPC13Q9BS18 74 aa5.53□□□□□ -1.52
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.5□□□□□ -1.53
C9orf3-212ENST00000468164 COA5Q86WW8 74 aa5.5□□□□□ -1.53
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.5□□□□□ -1.53
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP12-2P59991 146 aa5.48□□□□□ -1.53
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.46□□□□□ -1.54
C9orf3-212ENST00000468164 H7BZZ5 65 aa5.46□□□□□ -1.54
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.46□□□□□ -1.54
C9orf3-212ENST00000468164 SEC61GP60059 68 aa5.43□□□□□ -1.54
C9orf3-212ENST00000468164 CYSTM1Q9H1C7 97 aa5.43□□□□□ -1.54
C9orf3-212ENST00000468164 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.42□□□□□ -1.54
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
C9orf3-212ENST00000468164 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.39□□□□□ -1.55
C9orf3-212ENST00000468164 SPRR2DP22532 72 aa5.37□□□□□ -1.55
C9orf3-212ENST00000468164 CCDC179H3BU77 68 aa5.36□□□□□ -1.55
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP10-12P60413 245 aa5.33□□□□□ -1.56
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.32□□□□□ -1.56
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.32□□□□□ -1.56
C9orf3-212ENST00000468164 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.31□□□□□ -1.56
C9orf3-212ENST00000468164 A0A1B0GU33 70 aa5.26□□□□□ -1.57
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.26□□□□□ -1.57
C9orf3-212ENST00000468164 A0A1B0GU69 56 aa5.25□□□□□ -1.57
C9orf3-212ENST00000468164 LCE3BQ5TA77 95 aa5.23□□□□□ -1.57
C9orf3-212ENST00000468164 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.23□□□□□ -1.57
C9orf3-212ENST00000468164 A0A0D9SG42 100 aa5.21□□□□□ -1.58
C9orf3-212ENST00000468164 TMEM258P61165 79 aa5.21□□□□□ -1.58
C9orf3-212ENST00000468164 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.19□□□□□ -1.58
C9orf3-212ENST00000468164 PRR15LQ9BU68 103 aa5.17□□□□□ -1.58
C9orf3-212ENST00000468164 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.13□□□□□ -1.59
C9orf3-212ENST00000468164 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.13□□□□□ -1.59
C9orf3-212ENST00000468164 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.08□□□□□ -1.6
C9orf3-212ENST00000468164 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP12-1P59990 96 aa5.05□□□□□ -1.6
C9orf3-212ENST00000468164 A8MU10 97 aa5.03□□□□□ -1.6
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa5.03□□□□□ -1.6
C9orf3-212ENST00000468164 MT1EP04732 61 aa5□□□□□ -1.61
C9orf3-212ENST00000468164 LCE5AQ5TCM9 118 aa4.98□□□□□ -1.61
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa4.98□□□□□ -1.61
C9orf3-212ENST00000468164 UQCR11O14957 56 aa4.97□□□□□ -1.61
C9orf3-212ENST00000468164 V9GYY9 64 aa4.94□□□□□ -1.62
C9orf3-212ENST00000468164 SVIPQ8NHG7 77 aa4.93□□□□□ -1.62
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa4.92□□□□□ -1.62
C9orf3-212ENST00000468164 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa4.91□□□□□ -1.62
C9orf3-212ENST00000468164 GPR98Q8WXG9 6306 aa4.88□□□□□ -1.63
C9orf3-212ENST00000468164 PSPHP1O15172 72 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf3-212ENST00000468164 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.86□□□□□ -1.63
C9orf3-212ENST00000468164 PCP4P48539 62 aa4.85□□□□□ -1.63
C9orf3-212ENST00000468164 Q1T7F1 81 aa4.85□□□□□ -1.63
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