RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000455321.1

PGGT1BP1-201, Transcript of protein geranylgeranyltransferase type I subunit beta pseudogene 1, humanhuman

BASIC

Gene PGGT1BP1, Length 1,023 nt, Biotype processed pseudogene.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP1-201ENST00000455321 J3KT08 172 aa4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ETDBQ3ZM63 59 aa4.26□□□□□ -1.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1B0GW54 56 aa4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HRES1P13985 223 aa4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.25□□□□□ -1.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A1B0GV90 55 aa4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 F8W1H4 67 aa4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 K7EQZ3 153 aa4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 NDUFB1O75438 58 aa4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00846Q9NV44 126 aa4.24□□□□□ -1.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP5-11Q6L8G4 156 aa4.23□□□□□ -1.73
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRR15Q8IV56 129 aa4.23□□□□□ -1.73
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 A8MUN3 132 aa4.21□□□□□ -1.74
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP1-201ENST00000455321 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.19□□□□□ -1.74
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MT1HP80294 61 aa4.18□□□□□ -1.74
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.18□□□□□ -1.74
PGGT1BP1-201ENST00000455321 UBL5Q9BZL1 73 aa4.18□□□□□ -1.74
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.16□□□□□ -1.74
PGGT1BP1-201ENST00000455321 hDV103S1A0JD37 113 aa4.16□□□□□ -1.74
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.16□□□□□ -1.74
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.16□□□□□ -1.74
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM236CP0DP71 79 aa4.15□□□□□ -1.75
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CASC2Q6XLA1 102 aa4.14□□□□□ -1.75
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPINK7P58062 85 aa4.13□□□□□ -1.75
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HCG22E2RYF7 251 aa4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H3BPC8 53 aa4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP1-201ENST00000455321 M0R2T5 61 aa4.12□□□□□ -1.75
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP5-6Q6L8G9 129 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.05□□□□□ -1.76
PGGT1BP1-201ENST00000455321 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP4.05□□□□□ -1.76
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A0A087WVE0 104 aa4.04□□□□□ -1.76
PGGT1BP1-201ENST00000455321 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.02□□□□□ -1.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa4.01□□□□□ -1.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC00643Q86TS7 51 aa4.01□□□□□ -1.77
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 J3QR89 54 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa3.97□□□□□ -1.77
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TRAV22A0A0B4J277 110 aa3.94□□□□□ -1.78
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.94□□□□□ -1.78
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.93□□□□□ -1.78
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa3.92□□□□□ -1.78
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.83□□□□□ -1.8
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.82□□□□□ -1.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRCT1Q9UGL9 99 aa3.82□□□□□ -1.8
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 LINC01554Q52M75 96 aa3.8□□□□□ -1.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 TMEM258P61165 79 aa3.78□□□□□ -1.8
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CSAG1Q6PB30 78 aa3.78□□□□□ -1.8
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 SERP2Q8N6R1 65 aa3.68□□□□□ -1.82
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 ACYP2P14621 99 aa3.62□□□□□ -1.83
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 H0YAA0 97 aa3.6□□□□□ -1.83
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PGGT1BP1-201ENST00000455321 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 Q5VV11 94 aa3.59□□□□□ -1.83
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CRIPTQ9P021 101 aa3.57□□□□□ -1.84
PGGT1BP1-201ENST00000455321 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.56□□□□□ -1.84
PGGT1BP1-201ENST00000455321 CCDC179H3BU77 68 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP1-201ENST00000455321 H7BZZ5 65 aa3.54□□□□□ -1.84
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP1-201ENST00000455321 M0QZ58 72 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP1-201ENST00000455321 COA5Q86WW8 74 aa3.53□□□□□ -1.84
PGGT1BP1-201ENST00000455321 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.52□□□□□ -1.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 A6NN06 94 aa3.51□□□□□ -1.85
PGGT1BP1-201ENST00000455321 PP632Q6XCG6 107 aa3.51□□□□□ -1.85
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