RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000442447.5

RBM39-215, Transcript of RNA binding motif protein 39, humanhuman

TSL 2

Gene RBM39, Length 644 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBM39-215ENST00000442447 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa7.44□□□□□ -1.22
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RBM39-215ENST00000442447 H0Y9P7 68 aa7.39□□□□□ -1.23
RBM39-215ENST00000442447 OCR1Q9BZK8 76 aa7.39□□□□□ -1.23
RBM39-215ENST00000442447 IMUPQ9GZP8 106 aa7.39□□□□□ -1.23
RBM39-215ENST00000442447 ATOX1O00244 68 aa7.35□□□□□ -1.23
RBM39-215ENST00000442447 SCGB1A1P11684 91 aa7.35□□□□□ -1.23
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RBM39-215ENST00000442447 KLKP1Q107X0 134 aa7.28□□□□□ -1.24
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RBM39-215ENST00000442447 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP7.22□□□□□ -1.25
RBM39-215ENST00000442447 TRAV7A0A075B6U4 112 aa7.2□□□□□ -1.26
RBM39-215ENST00000442447 A8MUN3 132 aa7.2□□□□□ -1.26
RBM39-215ENST00000442447 SMIM20Q8N5G0 67 aa7.18□□□□□ -1.26
RBM39-215ENST00000442447 H3BPC8 53 aa7.17□□□□□ -1.26
RBM39-215ENST00000442447 A6NN06 94 aa7.16□□□□□ -1.26
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RBM39-215ENST00000442447 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa7.08□□□□□ -1.28
RBM39-215ENST00000442447 C20orf197Q8N268 126 aa7.05□□□□□ -1.28
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RBM39-215ENST00000442447 P0C880 135 aa6.94□□□□□ -1.3
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RBM39-215ENST00000442447 M0QZ58 72 aa6.85□□□□□ -1.31
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RBM39-215ENST00000442447 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.85□□□□□ -1.31
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RBM39-215ENST00000442447 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.83□□□□□ -1.32
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RBM39-215ENST00000442447 MT1XP80297 61 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-215ENST00000442447 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.81□□□□□ -1.32
RBM39-215ENST00000442447 NEBP20929 6669 aa6.8□□□□□ -1.32
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RBM39-215ENST00000442447 LINC01554Q52M75 96 aa6.77□□□□□ -1.33
RBM39-215ENST00000442447 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.76□□□□□ -1.33
RBM39-215ENST00000442447 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.75□□□□□ -1.33
RBM39-215ENST00000442447 KMT2DO14686 5537 aa6.71□□□□□ -1.33
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RBM39-215ENST00000442447 MDN1Q9NU22 5596 aa6.67□□□□□ -1.34
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RBM39-215ENST00000442447 KRTAP12-2P59991 146 aa6.62□□□□□ -1.35
RBM39-215ENST00000442447 SPRR2FQ96RM1 72 aa6.6□□□□□ -1.35
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RBM39-215ENST00000442447 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.51□□□□□ -1.37
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RBM39-215ENST00000442447 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.51□□□□□ -1.37
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RBM39-215ENST00000442447 SPRR2BP35325 72 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-215ENST00000442447 SPRR2AP35326 72 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.5□□□□□ -1.37
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP10-12P60413 245 aa6.45□□□□□ -1.38
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.41□□□□□ -1.38
RBM39-215ENST00000442447 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.41□□□□□ -1.38
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa6.38□□□□□ -1.39
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.38□□□□□ -1.39
RBM39-215ENST00000442447 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.38□□□□□ -1.39
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RBM39-215ENST00000442447 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.08□□□□□ -1.44
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RBM39-215ENST00000442447 Q1T7F1 81 aa6.07□□□□□ -1.44
RBM39-215ENST00000442447 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.05□□□□□ -1.44
RBM39-215ENST00000442447 V9GYY9 64 aa6.05□□□□□ -1.44
RBM39-215ENST00000442447 MT1EP04732 61 aa6.03□□□□□ -1.44
RBM39-215ENST00000442447 UQCR11O14957 56 aa6.01□□□□□ -1.45
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.98□□□□□ -1.45
RBM39-215ENST00000442447 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.98□□□□□ -1.45
RBM39-215ENST00000442447 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.97□□□□□ -1.45
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