RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000428394.6

HCLS1-202, Transcript of hematopoietic cell-specific Lyn substrate 1, humanhuman

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Gene HCLS1, Length 1,560 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HCLS1-202ENST00000428394 CSAG1Q6PB30 78 aa8.94□□□□□ -0.98
HCLS1-202ENST00000428394 K7ERS5 55 aa8.93□□□□□ -0.98
HCLS1-202ENST00000428394 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa8.91□□□□□ -0.98
HCLS1-202ENST00000428394 HERC1Q15751 4861 aa8.9□□□□□ -0.98
HCLS1-202ENST00000428394 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP8.89□□□□□ -0.99
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.82□□□□□ -1
HCLS1-202ENST00000428394 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.81□□□□□ -1
HCLS1-202ENST00000428394 FAT1Q14517 4588 aa8.79□□□□□ -1
HCLS1-202ENST00000428394 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.77□□□□□ -1.01
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP10-8P60410 259 aa8.74□□□□□ -1.01
HCLS1-202ENST00000428394 Q5VSD8 79 aa8.74□□□□□ -1.01
HCLS1-202ENST00000428394 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP8.73□□□□□ -1.01
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP8.65□□□□□ -1.02
HCLS1-202ENST00000428394 ROMO1P60602 79 aa8.65□□□□□ -1.02
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa8.65□□□□□ -1.02
HCLS1-202ENST00000428394 S4R3F8 94 aa8.65□□□□□ -1.02
HCLS1-202ENST00000428394 MYCBP2O75592 4640 aa8.62□□□□□ -1.03
HCLS1-202ENST00000428394 XP32Q5T750 250 aa8.61□□□□□ -1.03
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa8.58□□□□□ -1.04
HCLS1-202ENST00000428394 TNXBP22105 4242 aa8.53□□□□□ -1.04
HCLS1-202ENST00000428394 FAT3Q8TDW7 4589 aa8.51□□□□□ -1.05
HCLS1-202ENST00000428394 J3QL48 77 aa8.51□□□□□ -1.05
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa8.47□□□□□ -1.05
HCLS1-202ENST00000428394 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.46□□□□□ -1.05
HCLS1-202ENST00000428394 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP8.46□□□□□ -1.06
HCLS1-202ENST00000428394 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.41□□□□□ -1.06
HCLS1-202ENST00000428394 M0QZ58 72 aa8.4□□□□□ -1.06
HCLS1-202ENST00000428394 TPRXLQ17RH7 258 aa8.38□□□□□ -1.07
HCLS1-202ENST00000428394 A0A0D9SG42 100 aa8.37□□□□□ -1.07
HCLS1-202ENST00000428394 P0C880 135 aa8.37□□□□□ -1.07
HCLS1-202ENST00000428394 MT1HL1P0DM35 61 aa8.36□□□□□ -1.07
HCLS1-202ENST00000428394 CRIPTQ9P021 101 aa8.3□□□□□ -1.08
HCLS1-202ENST00000428394 H3BS24 57 aa8.28□□□□□ -1.08
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP12-1P59990 96 aa8.27□□□□□ -1.09
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP12-2P59991 146 aa8.24□□□□□ -1.09
HCLS1-202ENST00000428394 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.15□□□□□ -1.1
HCLS1-202ENST00000428394 RNF213Q63HN8 5207 aa8.11□□□□□ -1.11
HCLS1-202ENST00000428394 LRP2P98164 4655 aa8.08□□□□□ -1.12
HCLS1-202ENST00000428394 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.07□□□□□ -1.12
HCLS1-202ENST00000428394 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.05□□□□□ -1.12
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.03□□□□□ -1.12
HCLS1-202ENST00000428394 R4GN34 69 aa8□□□□□ -1.13
HCLS1-202ENST00000428394 LPAP08519 4548 aa7.83□□□□□ -1.16
HCLS1-202ENST00000428394 PP632Q6XCG6 107 aa7.81□□□□□ -1.16
HCLS1-202ENST00000428394 NDUFAF8A1L188 74 aa7.75□□□□□ -1.17
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa7.71□□□□□ -1.17
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.69□□□□□ -1.18
HCLS1-202ENST00000428394 MUC2Q02817 5179 aa7.65□□□□□ -1.18
HCLS1-202ENST00000428394 LORP23490 312 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa7.65□□□□□ -1.18
HCLS1-202ENST00000428394 PLAC4Q8WY50 150 aa7.64□□□□□ -1.19
HCLS1-202ENST00000428394 MUC17Q685J3 4493 aa7.63□□□□□ -1.19
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.62□□□□□ -1.19
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa7.6□□□□□ -1.19
HCLS1-202ENST00000428394 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa7.59□□□□□ -1.19
HCLS1-202ENST00000428394 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.59□□□□□ -1.19
HCLS1-202ENST00000428394 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.51□□□□□ -1.21
HCLS1-202ENST00000428394 TNP1P09430 55 aa7.42□□□□□ -1.22
HCLS1-202ENST00000428394 LUZP6Q538Z0 58 aa7.4□□□□□ -1.22
HCLS1-202ENST00000428394 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.37□□□□□ -1.23
HCLS1-202ENST00000428394 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP7.27□□□□□ -1.25
HCLS1-202ENST00000428394 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.26□□□□□ -1.25
HCLS1-202ENST00000428394 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.24□□□□□ -1.25
HCLS1-202ENST00000428394 CRCT1Q9UGL9 99 aa7.24□□□□□ -1.25
HCLS1-202ENST00000428394 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.22□□□□□ -1.25
HCLS1-202ENST00000428394 LCE2CQ5TA81 110 aa7.19□□□□□ -1.26
HCLS1-202ENST00000428394 A0A0A0MQY5 61 aa7.16□□□□□ -1.26
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.08□□□□□ -1.28
HCLS1-202ENST00000428394 MT1HP80294 61 aa7.07□□□□□ -1.28
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.95□□□□□ -1.3
HCLS1-202ENST00000428394 M0R2T5 61 aa6.94□□□□□ -1.3
HCLS1-202ENST00000428394 MT2AP02795 61 aa6.88□□□□□ -1.31
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.88□□□□□ -1.31
HCLS1-202ENST00000428394 LCE3AQ5TA76 89 aa6.86□□□□□ -1.31
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP10-10P60014 251 aa6.85□□□□□ -1.31
HCLS1-202ENST00000428394 MT1FP04733 61 aa6.83□□□□□ -1.32
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa6.81□□□□□ -1.32
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.79□□□□□ -1.32
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
HCLS1-202ENST00000428394 MT1BP07438 61 aa6.69□□□□□ -1.34
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP10-5P60370 271 aa6.69□□□□□ -1.34
HCLS1-202ENST00000428394 MT1XP80297 61 aa6.68□□□□□ -1.34
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP10-12P60413 245 aa6.65□□□□□ -1.35
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP12-3P60328 96 aa6.61□□□□□ -1.35
HCLS1-202ENST00000428394 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.61□□□□□ -1.35
HCLS1-202ENST00000428394 SSPOA2VEC9 5147 aa6.6□□□□□ -1.35
HCLS1-202ENST00000428394 USH2AO75445 5202 aa6.58□□□□□ -1.36
HCLS1-202ENST00000428394 INE1O15225 51 aa6.57□□□□□ -1.36
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa6.54□□□□□ -1.36
HCLS1-202ENST00000428394 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.39
HCLS1-202ENST00000428394 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.39□□□□□ -1.39
HCLS1-202ENST00000428394 LCE2BO14633 110 aa6.39□□□□□ -1.39
HCLS1-202ENST00000428394 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.38□□□□□ -1.39
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.33□□□□□ -1.4
HCLS1-202ENST00000428394 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.25□□□□□ -1.41
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.21□□□□□ -1.42
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.2□□□□□ -1.42
HCLS1-202ENST00000428394 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.2□□□□□ -1.42
HCLS1-202ENST00000428394 NEBP20929 6669 aa6.07□□□□□ -1.44
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