RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000417536.5

SH3BP1-202, Transcript of SH3 domain binding protein 1, humanhuman

TSL 2

Gene SH3BP1, Length 2,858 nt, Biotype nonsense mediated decay.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa10.03□□□□□ -0.8
SH3BP1-202ENST00000417536 H0YAA0 97 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa9.94□□□□□ -0.82
SH3BP1-202ENST00000417536 ABCA13Q86UQ4 5058 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A1B0GU33 70 aa9.89□□□□□ -0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 CSAG1Q6PB30 78 aa9.87□□□□□ -0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP10-8P60410 259 aa9.84□□□□□ -0.83
SH3BP1-202ENST00000417536 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 LINC01554Q52M75 96 aa9.83□□□□□ -0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 COX6B2Q6YFQ2 88 aa9.82□□□□□ -0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 MT1HL1P0DM35 61 aa9.77□□□□□ -0.84
SH3BP1-202ENST00000417536 HERC2O95714 4834 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 LPAP08519 4548 aa9.74□□□□□ -0.85
SH3BP1-202ENST00000417536 LRP2P98164 4655 aa9.67□□□□□ -0.86
SH3BP1-202ENST00000417536 BIRC6Q9NR09 4857 aa9.65□□□□□ -0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 CRIPTQ9P021 101 aa9.62□□□□□ -0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 RPL37P61927 97 aaKnown RBP9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.59□□□□□ -0.87
SH3BP1-202ENST00000417536 K7ERS5 55 aa9.57□□□□□ -0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 XP32Q5T750 250 aa9.56□□□□□ -0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa9.55□□□□□ -0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP9.54□□□□□ -0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 PCLOQ9Y6V0 5065 aa9.53□□□□□ -0.88
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 S4R3F8 94 aa9.49□□□□□ -0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0D9SG42 100 aa9.47□□□□□ -0.89
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 HERC1Q15751 4861 aa9.46□□□□□ -0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 H3BS24 57 aa9.43□□□□□ -0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 J3QL48 77 aa9.42□□□□□ -0.9
SH3BP1-202ENST00000417536 P0C880 135 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 ROMO1P60602 79 aa9.38□□□□□ -0.91
SH3BP1-202ENST00000417536 MUC2Q02817 5179 aa9.3□□□□□ -0.92
SH3BP1-202ENST00000417536 TPRXLQ17RH7 258 aa9.24□□□□□ -0.93
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP12-2P59991 146 aa9.18□□□□□ -0.94
SH3BP1-202ENST00000417536 SPINT4Q6UDR6 99 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 C10orf95Q9H7T3 257 aa9.13□□□□□ -0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP12-1P59990 96 aa9.1□□□□□ -0.95
SH3BP1-202ENST00000417536 HMCN2Q8NDA2 5059 aa9.08□□□□□ -0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 MUC17Q685J3 4493 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa9.06□□□□□ -0.96
SH3BP1-202ENST00000417536 M0QZ58 72 aa9□□□□□ -0.97
SH3BP1-202ENST00000417536 RNF213Q63HN8 5207 aa8.98□□□□□ -0.97
SH3BP1-202ENST00000417536 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.94□□□□□ -0.98
SH3BP1-202ENST00000417536 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.92□□□□□ -0.98
SH3BP1-202ENST00000417536 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.87□□□□□ -0.99
SH3BP1-202ENST00000417536 R4GN34 69 aa8.84□□□□□ -0.99
SH3BP1-202ENST00000417536 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.74□□□□□ -1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa8.72□□□□□ -1.01
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa8.65□□□□□ -1.02
SH3BP1-202ENST00000417536 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
SH3BP1-202ENST00000417536 NDUFAF8A1L188 74 aa8.59□□□□□ -1.04
SH3BP1-202ENST00000417536 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.41□□□□□ -1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 LCE2CQ5TA81 110 aa8.4□□□□□ -1.06
SH3BP1-202ENST00000417536 PLAC4Q8WY50 150 aa8.34□□□□□ -1.07
SH3BP1-202ENST00000417536 M0R2T5 61 aa8.31□□□□□ -1.08
SH3BP1-202ENST00000417536 MT1HP80294 61 aa8.23□□□□□ -1.09
SH3BP1-202ENST00000417536 PP632Q6XCG6 107 aa8.22□□□□□ -1.09
SH3BP1-202ENST00000417536 A0A0A0MQY5 61 aa8.08□□□□□ -1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 TNP1P09430 55 aa8.07□□□□□ -1.12
SH3BP1-202ENST00000417536 MT1FP04733 61 aa7.99□□□□□ -1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP10-10P60014 251 aa7.97□□□□□ -1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 MT2AP02795 61 aa7.96□□□□□ -1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 LUZP6Q538Z0 58 aa7.96□□□□□ -1.13
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.94□□□□□ -1.14
SH3BP1-202ENST00000417536 SPRR2GQ9BYE4 73 aa7.89□□□□□ -1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.88□□□□□ -1.15
SH3BP1-202ENST00000417536 USH2AO75445 5202 aa7.81□□□□□ -1.16
SH3BP1-202ENST00000417536 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.69□□□□□ -1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 LCE3AQ5TA76 89 aa7.67□□□□□ -1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP7.65□□□□□ -1.18
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.61□□□□□ -1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 FSIP2Q5CZC0 6907 aa7.6□□□□□ -1.19
SH3BP1-202ENST00000417536 MT1BP07438 61 aa7.54□□□□□ -1.2
SH3BP1-202ENST00000417536 KMT2DO14686 5537 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa7.51□□□□□ -1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 LCE2BO14633 110 aa7.49□□□□□ -1.21
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP10-5P60370 271 aa7.44□□□□□ -1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 MT1XP80297 61 aa7.43□□□□□ -1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.41□□□□□ -1.22
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP10-12P60413 245 aa7.32□□□□□ -1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP12-3P60328 96 aa7.28□□□□□ -1.24
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.26□□□□□ -1.25
SH3BP1-202ENST00000417536 SSPOA2VEC9 5147 aa7.25□□□□□ -1.25
SH3BP1-202ENST00000417536 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.11□□□□□ -1.27
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.98□□□□□ -1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa6.96□□□□□ -1.29
SH3BP1-202ENST00000417536 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.85□□□□□ -1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.84□□□□□ -1.31
SH3BP1-202ENST00000417536 INE1O15225 51 aa6.82□□□□□ -1.32
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.73□□□□□ -1.33
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.71□□□□□ -1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.67□□□□□ -1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP6.66□□□□□ -1.34
SH3BP1-202ENST00000417536 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa6.64□□□□□ -1.35
SH3BP1-202ENST00000417536 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.62□□□□□ -1.35
SH3BP1-202ENST00000417536 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP6.6□□□□□ -1.35
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