RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000412161.1

SYNE1-AS1-201, SYNE1 antisense RNA 1, humanhuman

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Gene SYNE1-AS1, Length 553 nt, Biotype antisense RNA.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C4orf26Q17RF5 130 aa4.12□□□□□ -1.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 USH2AO75445 5202 aa4.11□□□□□ -1.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MT1FP04733 61 aa4.11□□□□□ -1.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.1□□□□□ -1.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.09□□□□□ -1.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.09□□□□□ -1.75
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 S4R3F8 94 aa4.07□□□□□ -1.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 H0Y9P7 68 aa4.06□□□□□ -1.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A087WVE0 104 aa4.05□□□□□ -1.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MP68P56378 58 aa4.05□□□□□ -1.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CSAG1Q6PB30 78 aa4.05□□□□□ -1.76
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 K7ERU9 68 aa4.03□□□□□ -1.76
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C5orf47Q569G3 176 aa4.02□□□□□ -1.77
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 OCR1Q9BZK8 76 aa4.02□□□□□ -1.77
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 IMUPQ9GZP8 106 aa4.02□□□□□ -1.77
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LCA10Q71F78 164 aa4.01□□□□□ -1.77
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa3.98□□□□□ -1.77
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.97□□□□□ -1.77
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SMIM20Q8N5G0 67 aa3.97□□□□□ -1.77
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.96□□□□□ -1.78
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NDUFC1O43677 76 aa3.95□□□□□ -1.78
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP3.94□□□□□ -1.78
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 H0YAA0 97 aa3.94□□□□□ -1.78
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CRIPTQ9P021 101 aa3.94□□□□□ -1.78
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa3.92□□□□□ -1.78
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 C20orf197Q8N268 126 aa3.86□□□□□ -1.79
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ACYP2P14621 99 aa3.82□□□□□ -1.8
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPTSSBQ8NFR3 76 aa3.82□□□□□ -1.8
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP3.81□□□□□ -1.8
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.8□□□□□ -1.8
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa3.79□□□□□ -1.8
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa3.75□□□□□ -1.81
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRTAP12-2P59991 146 aa3.57□□□□□ -1.84
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SERP1Q9Y6X1 66 aa3.57□□□□□ -1.84
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 NEBP20929 6669 aa3.56□□□□□ -1.84
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MUC12Q9UKN1 5478 aa3.54□□□□□ -1.84
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KMT2DO14686 5537 aa3.53□□□□□ -1.84
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.52□□□□□ -1.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LCE1AQ5T7P2 110 aa3.5□□□□□ -1.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 MDN1Q9NU22 5596 aa3.49□□□□□ -1.85
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A0A1B0GU33 70 aa3.47□□□□□ -1.85
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 TMEM258P61165 79 aa3.44□□□□□ -1.86
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 PRR15LQ9BU68 103 aa3.43□□□□□ -1.86
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.39□□□□□ -1.87
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SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPRR2AP35326 72 aa3.36□□□□□ -1.87
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 SPINT4Q6UDR6 99 aa3.36□□□□□ -1.87
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa3.36□□□□□ -1.87
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRTAP12-1P59990 96 aa3.35□□□□□ -1.87
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa3.35□□□□□ -1.87
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 UQCR11O14957 56 aa3.3□□□□□ -1.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.3□□□□□ -1.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.3□□□□□ -1.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 V9GYY9 64 aa3.28□□□□□ -1.88
SYNE1-AS1-201ENST00000412161 A8MU10 97 aa3.27□□□□□ -1.89
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