RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000376215.9

PDSS1-201, Transcript of decaprenyl diphosphate synthase subunit 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PDSS1, Length 1,626 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDSS1-201ENST00000376215 H7BZZ5 65 aa11.27□□□□□ -0.6
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PDSS1-201ENST00000376215 ACYP2P14621 99 aa11.2□□□□□ -0.62
PDSS1-201ENST00000376215 CSAG1Q6PB30 78 aa11.2□□□□□ -0.62
PDSS1-201ENST00000376215 MT2AP02795 61 aa11.14□□□□□ -0.63
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PDSS1-201ENST00000376215 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP10.86□□□□□ -0.67
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PDSS1-201ENST00000376215 Q5VV11 94 aa10.32□□□□□ -0.76
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PDSS1-201ENST00000376215 RPS28P62857 69 aaKnown RBP10.24□□□□□ -0.77
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PDSS1-201ENST00000376215 SMIM26A0A096LP01 95 aa10.18□□□□□ -0.78
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PDSS1-201ENST00000376215 A6NN06 94 aa10.03□□□□□ -0.8
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PDSS1-201ENST00000376215 MIR22HGQ0VDD5 57 aa9.78□□□□□ -0.84
PDSS1-201ENST00000376215 PRO2289Q9P1D8 64 aa9.77□□□□□ -0.85
PDSS1-201ENST00000376215 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa9.71□□□□□ -0.85
PDSS1-201ENST00000376215 A6NED7 52 aa9.69□□□□□ -0.86
PDSS1-201ENST00000376215 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP9.57□□□□□ -0.88
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP9.56□□□□□ -0.88
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP9.45□□□□□ -0.9
PDSS1-201ENST00000376215 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa9.43□□□□□ -0.9
PDSS1-201ENST00000376215 K7ERS5 55 aa9.39□□□□□ -0.91
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP10-12P60413 245 aa9.36□□□□□ -0.91
PDSS1-201ENST00000376215 C10orf95Q9H7T3 257 aa9.36□□□□□ -0.91
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PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa9.24□□□□□ -0.93
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa9.23□□□□□ -0.93
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PDSS1-201ENST00000376215 SPRR2BP35325 72 aa8.63□□□□□ -1.03
PDSS1-201ENST00000376215 SPRR2AP35326 72 aa8.63□□□□□ -1.03
PDSS1-201ENST00000376215 NEBP20929 6669 aa8.63□□□□□ -1.03
PDSS1-201ENST00000376215 PMAIP1Q13794 54 aa8.61□□□□□ -1.03
PDSS1-201ENST00000376215 PRO0628Q9UI54 55 aa8.6□□□□□ -1.03
PDSS1-201ENST00000376215 KRTAP12-3P60328 96 aa8.56□□□□□ -1.04
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