RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000375425.9

NELFE-201, Transcript of negative elongation factor complex member E, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 2 BASIC

Gene NELFE, Length 1,405 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NELFE-201ENST00000375425 A6NN06 94 aa6.4□□□□□ -1.39
NELFE-201ENST00000375425 Q5VV11 94 aa6.4□□□□□ -1.39
NELFE-201ENST00000375425 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.4□□□□□ -1.39
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.37□□□□□ -1.39
NELFE-201ENST00000375425 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa6.36□□□□□ -1.39
NELFE-201ENST00000375425 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.36□□□□□ -1.39
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.35□□□□□ -1.39
NELFE-201ENST00000375425 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.35□□□□□ -1.39
NELFE-201ENST00000375425 KLKP1Q107X0 134 aa6.34□□□□□ -1.39
NELFE-201ENST00000375425 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
NELFE-201ENST00000375425 A0A087WVE0 104 aa6.3□□□□□ -1.4
NELFE-201ENST00000375425 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.29□□□□□ -1.4
NELFE-201ENST00000375425 ATOX1O00244 68 aa6.29□□□□□ -1.4
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP10-5P60370 271 aa6.28□□□□□ -1.4
NELFE-201ENST00000375425 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.27□□□□□ -1.41
NELFE-201ENST00000375425 CCDC179H3BU77 68 aa6.27□□□□□ -1.41
NELFE-201ENST00000375425 CRIPTQ9P021 101 aa6.25□□□□□ -1.41
NELFE-201ENST00000375425 UQCRQO14949 82 aa6.24□□□□□ -1.41
NELFE-201ENST00000375425 SMIM20Q8N5G0 67 aa6.21□□□□□ -1.42
NELFE-201ENST00000375425 COX7CP15954 63 aa6.2□□□□□ -1.42
NELFE-201ENST00000375425 H0Y9P7 68 aa6.18□□□□□ -1.42
NELFE-201ENST00000375425 NDUFC1O43677 76 aa6.18□□□□□ -1.42
NELFE-201ENST00000375425 SERP2Q8N6R1 65 aa6.18□□□□□ -1.42
NELFE-201ENST00000375425 MDN1Q9NU22 5596 aa6.18□□□□□ -1.42
NELFE-201ENST00000375425 H0YAA0 97 aa6.15□□□□□ -1.43
NELFE-201ENST00000375425 KMT2DO14686 5537 aa6.15□□□□□ -1.43
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP5-9P26371 169 aa6.13□□□□□ -1.43
NELFE-201ENST00000375425 TRAV7A0A075B6U4 112 aa6.1□□□□□ -1.43
NELFE-201ENST00000375425 A8MUN3 132 aa6.1□□□□□ -1.43
NELFE-201ENST00000375425 ADM2Q7Z4H4 148 aa6.1□□□□□ -1.43
NELFE-201ENST00000375425 LINC00208Q96KT6 92 aa6.08□□□□□ -1.44
NELFE-201ENST00000375425 TMEM258P61165 79 aa6.07□□□□□ -1.44
NELFE-201ENST00000375425 OCR1Q9BZK8 76 aa6.06□□□□□ -1.44
NELFE-201ENST00000375425 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.04□□□□□ -1.44
NELFE-201ENST00000375425 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.03□□□□□ -1.44
NELFE-201ENST00000375425 MP68P56378 58 aa6.02□□□□□ -1.45
NELFE-201ENST00000375425 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.99□□□□□ -1.45
NELFE-201ENST00000375425 MT1XP80297 61 aa5.99□□□□□ -1.45
NELFE-201ENST00000375425 PLAC4Q8WY50 150 aa5.99□□□□□ -1.45
NELFE-201ENST00000375425 C20orf197Q8N268 126 aa5.98□□□□□ -1.45
NELFE-201ENST00000375425 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP5.97□□□□□ -1.45
NELFE-201ENST00000375425 R4GN34 69 aa5.96□□□□□ -1.46
NELFE-201ENST00000375425 P0C880 135 aa5.95□□□□□ -1.46
NELFE-201ENST00000375425 H7BZZ5 65 aa5.93□□□□□ -1.46
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NELFE-201ENST00000375425 H3BPC8 53 aa5.91□□□□□ -1.46
NELFE-201ENST00000375425 M0QZ58 72 aa5.9□□□□□ -1.47
NELFE-201ENST00000375425 DMAC1Q96GE9 116 aa5.89□□□□□ -1.47
NELFE-201ENST00000375425 SERP1Q9Y6X1 66 aa5.88□□□□□ -1.47
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.87□□□□□ -1.47
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.87□□□□□ -1.47
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.87□□□□□ -1.47
NELFE-201ENST00000375425 SPRR2EP22531 72 aa5.86□□□□□ -1.47
NELFE-201ENST00000375425 SPRR2BP35325 72 aa5.86□□□□□ -1.47
NELFE-201ENST00000375425 SPRR2AP35326 72 aa5.86□□□□□ -1.47
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.86□□□□□ -1.47
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NELFE-201ENST00000375425 LINC01554Q52M75 96 aa5.83□□□□□ -1.48
NELFE-201ENST00000375425 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.79□□□□□ -1.48
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.78□□□□□ -1.48
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NELFE-201ENST00000375425 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.77□□□□□ -1.49
NELFE-201ENST00000375425 ACYP2P14621 99 aa5.74□□□□□ -1.49
NELFE-201ENST00000375425 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.74□□□□□ -1.49
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP10-12P60413 245 aa5.68□□□□□ -1.5
NELFE-201ENST00000375425 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.68□□□□□ -1.5
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.68□□□□□ -1.5
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.68□□□□□ -1.5
NELFE-201ENST00000375425 SPRR2DP22532 72 aa5.67□□□□□ -1.5
NELFE-201ENST00000375425 V9GYY9 64 aa5.65□□□□□ -1.51
NELFE-201ENST00000375425 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.63□□□□□ -1.51
NELFE-201ENST00000375425 Q1T7F1 81 aa5.58□□□□□ -1.52
NELFE-201ENST00000375425 PRO0628Q9UI54 55 aa5.57□□□□□ -1.52
NELFE-201ENST00000375425 LCE3BQ5TA77 95 aa5.53□□□□□ -1.52
NELFE-201ENST00000375425 COA5Q86WW8 74 aa5.53□□□□□ -1.52
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NELFE-201ENST00000375425 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.5□□□□□ -1.53
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NELFE-201ENST00000375425 PSPHP1O15172 72 aa5.4□□□□□ -1.54
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NELFE-201ENST00000375425 LCE5AQ5TCM9 118 aa5.32□□□□□ -1.56
NELFE-201ENST00000375425 MT1EP04732 61 aa5.31□□□□□ -1.56
NELFE-201ENST00000375425 A6NED7 52 aa5.3□□□□□ -1.56
NELFE-201ENST00000375425 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.3□□□□□ -1.56
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa5.28□□□□□ -1.56
NELFE-201ENST00000375425 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.27□□□□□ -1.57
NELFE-201ENST00000375425 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.27□□□□□ -1.57
NELFE-201ENST00000375425 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.25□□□□□ -1.57
NELFE-201ENST00000375425 A0A1B0GU33 70 aa5.24□□□□□ -1.57
NELFE-201ENST00000375425 A0A1B0GU69 56 aa5.23□□□□□ -1.57
NELFE-201ENST00000375425 PMAIP1Q13794 54 aa5.23□□□□□ -1.57
NELFE-201ENST00000375425 KRTAP12-1P59990 96 aa5.2□□□□□ -1.58
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