RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000372906.2

TTPAL-203, Transcript of alpha tocopherol transfer protein like, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene TTPAL, Length 1,139 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTPAL-203ENST00000372906 H0Y9P7 68 aa6.41□□□□□ -1.38
TTPAL-203ENST00000372906 H3BPC8 53 aa6.41□□□□□ -1.38
TTPAL-203ENST00000372906 C20orf197Q8N268 126 aa6.41□□□□□ -1.38
TTPAL-203ENST00000372906 SPINK7P58062 85 aa6.39□□□□□ -1.39
TTPAL-203ENST00000372906 KLKP1Q107X0 134 aa6.38□□□□□ -1.39
TTPAL-203ENST00000372906 NDUFC1O43677 76 aa6.36□□□□□ -1.39
TTPAL-203ENST00000372906 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.36□□□□□ -1.39
TTPAL-203ENST00000372906 LINC00208Q96KT6 92 aa6.36□□□□□ -1.39
TTPAL-203ENST00000372906 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.35□□□□□ -1.39
TTPAL-203ENST00000372906 SNURFQ9Y675 71 aa6.35□□□□□ -1.39
TTPAL-203ENST00000372906 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.33□□□□□ -1.4
TTPAL-203ENST00000372906 Q5W150 140 aa6.33□□□□□ -1.4
TTPAL-203ENST00000372906 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.3□□□□□ -1.4
TTPAL-203ENST00000372906 NEBP20929 6669 aa6.29□□□□□ -1.4
TTPAL-203ENST00000372906 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.27□□□□□ -1.41
TTPAL-203ENST00000372906 H7BZZ5 65 aa6.26□□□□□ -1.41
TTPAL-203ENST00000372906 IGKV2-30P06310 120 aa6.26□□□□□ -1.41
TTPAL-203ENST00000372906 TMEM258P61165 79 aa6.26□□□□□ -1.41
TTPAL-203ENST00000372906 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.25□□□□□ -1.41
TTPAL-203ENST00000372906 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.25□□□□□ -1.41
TTPAL-203ENST00000372906 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.24□□□□□ -1.41
TTPAL-203ENST00000372906 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.22□□□□□ -1.41
TTPAL-203ENST00000372906 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.2□□□□□ -1.42
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.19□□□□□ -1.42
TTPAL-203ENST00000372906 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.18□□□□□ -1.42
TTPAL-203ENST00000372906 A6NN06 94 aa6.15□□□□□ -1.42
TTPAL-203ENST00000372906 MT1BP07438 61 aa6.12□□□□□ -1.43
TTPAL-203ENST00000372906 MDN1Q9NU22 5596 aa6.08□□□□□ -1.44
TTPAL-203ENST00000372906 DMAC1Q96GE9 116 aa6.07□□□□□ -1.44
TTPAL-203ENST00000372906 KMT2DO14686 5537 aa6.07□□□□□ -1.44
TTPAL-203ENST00000372906 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.06□□□□□ -1.44
TTPAL-203ENST00000372906 A8MUN3 132 aa6.06□□□□□ -1.44
TTPAL-203ENST00000372906 C4orf26Q17RF5 130 aa6.06□□□□□ -1.44
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.06□□□□□ -1.44
TTPAL-203ENST00000372906 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.06□□□□□ -1.44
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP5-9P26371 169 aa6.05□□□□□ -1.44
TTPAL-203ENST00000372906 ACYP2P14621 99 aa6.04□□□□□ -1.44
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP10-5P60370 271 aa6.03□□□□□ -1.44
TTPAL-203ENST00000372906 Q5VV11 94 aa6.03□□□□□ -1.44
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.02□□□□□ -1.45
TTPAL-203ENST00000372906 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
TTPAL-203ENST00000372906 COA5Q86WW8 74 aa5.99□□□□□ -1.45
TTPAL-203ENST00000372906 SPRR2GQ9BYE4 73 aa5.98□□□□□ -1.45
TTPAL-203ENST00000372906 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa5.97□□□□□ -1.45
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa5.93□□□□□ -1.46
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.93□□□□□ -1.46
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa5.93□□□□□ -1.46
TTPAL-203ENST00000372906 SPTSSBQ8NFR3 76 aa5.9□□□□□ -1.46
TTPAL-203ENST00000372906 SMIM26A0A096LP01 95 aa5.89□□□□□ -1.47
TTPAL-203ENST00000372906 CSAG1Q6PB30 78 aa5.86□□□□□ -1.47
TTPAL-203ENST00000372906 LCA10Q71F78 164 aa5.86□□□□□ -1.47
TTPAL-203ENST00000372906 S4R3F8 94 aa5.86□□□□□ -1.47
TTPAL-203ENST00000372906 V9GYY9 64 aa5.82□□□□□ -1.48
TTPAL-203ENST00000372906 SPRR2FQ96RM1 72 aa5.81□□□□□ -1.48
TTPAL-203ENST00000372906 SPRR2EP22531 72 aa5.8□□□□□ -1.48
TTPAL-203ENST00000372906 SPRR2BP35325 72 aa5.8□□□□□ -1.48
TTPAL-203ENST00000372906 SPRR2AP35326 72 aa5.8□□□□□ -1.48
TTPAL-203ENST00000372906 Q1T7F1 81 aa5.78□□□□□ -1.48
TTPAL-203ENST00000372906 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa5.74□□□□□ -1.49
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa5.73□□□□□ -1.49
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa5.73□□□□□ -1.49
TTPAL-203ENST00000372906 SEC61GP60059 68 aa5.72□□□□□ -1.49
TTPAL-203ENST00000372906 PRR15LQ9BU68 103 aa5.72□□□□□ -1.49
TTPAL-203ENST00000372906 LCE1AQ5T7P2 110 aa5.7□□□□□ -1.5
TTPAL-203ENST00000372906 A0A1B0GU69 56 aa5.69□□□□□ -1.5
TTPAL-203ENST00000372906 CRIPTQ9P021 101 aa5.67□□□□□ -1.5
TTPAL-203ENST00000372906 PSPHP1O15172 72 aa5.65□□□□□ -1.5
TTPAL-203ENST00000372906 MT1XP80297 61 aa5.65□□□□□ -1.5
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa5.65□□□□□ -1.5
TTPAL-203ENST00000372906 H0YAA0 97 aa5.61□□□□□ -1.51
TTPAL-203ENST00000372906 SPRR2DP22532 72 aa5.61□□□□□ -1.51
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa5.57□□□□□ -1.52
TTPAL-203ENST00000372906 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.57□□□□□ -1.52
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.57□□□□□ -1.52
TTPAL-203ENST00000372906 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.57□□□□□ -1.52
TTPAL-203ENST00000372906 A0A1B0GU33 70 aa5.52□□□□□ -1.53
TTPAL-203ENST00000372906 A6NED7 52 aa5.52□□□□□ -1.53
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP12-2P59991 146 aa5.52□□□□□ -1.53
TTPAL-203ENST00000372906 UQCR11O14957 56 aa5.51□□□□□ -1.53
TTPAL-203ENST00000372906 P0C880 135 aa5.49□□□□□ -1.53
TTPAL-203ENST00000372906 LCE3BQ5TA77 95 aa5.49□□□□□ -1.53
TTPAL-203ENST00000372906 PLAC4Q8WY50 150 aa5.49□□□□□ -1.53
TTPAL-203ENST00000372906 MIR22HGQ0VDD5 57 aa5.44□□□□□ -1.54
TTPAL-203ENST00000372906 M0QZ58 72 aa5.43□□□□□ -1.54
TTPAL-203ENST00000372906 BRK1Q8WUW1 75 aa5.41□□□□□ -1.54
TTPAL-203ENST00000372906 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa5.41□□□□□ -1.54
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
TTPAL-203ENST00000372906 SPATA8Q6RVD6 105 aa5.4□□□□□ -1.54
TTPAL-203ENST00000372906 R4GN34 69 aa5.4□□□□□ -1.54
TTPAL-203ENST00000372906 GPR98Q8WXG9 6306 aa5.38□□□□□ -1.55
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.34□□□□□ -1.55
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP10-12P60413 245 aa5.33□□□□□ -1.56
TTPAL-203ENST00000372906 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP5.3□□□□□ -1.56
TTPAL-203ENST00000372906 A0A0D9SG42 100 aa5.29□□□□□ -1.56
TTPAL-203ENST00000372906 A8MU10 97 aa5.28□□□□□ -1.56
TTPAL-203ENST00000372906 LINC01554Q52M75 96 aa5.28□□□□□ -1.56
TTPAL-203ENST00000372906 PRO0628Q9UI54 55 aa5.28□□□□□ -1.56
TTPAL-203ENST00000372906 K7ERS5 55 aa5.27□□□□□ -1.57
TTPAL-203ENST00000372906 KRTAP4-9Q9BYQ8 210 aa5.27□□□□□ -1.57
TTPAL-203ENST00000372906 SPINT4Q6UDR6 99 aa5.18□□□□□ -1.58
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 7.3 ms