RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361441.4

APOBEC3C-201, Transcript of apolipoprotein B mRNA editing enzyme catalytic subunit 3C, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene APOBEC3C, Length 2,818 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBEC3C-201ENST00000361441 C9orf92A6NGG3 77 aa5.74□□□□□ -1.49
APOBEC3C-201ENST00000361441 SMR3BP02814 79 aaPredicted RBP5.72□□□□□ -1.49
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAT1Q14517 4588 aa5.7□□□□□ -1.5
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.68□□□□□ -1.5
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.67□□□□□ -1.5
APOBEC3C-201ENST00000361441 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP5.61□□□□□ -1.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 S4R3F8 94 aa5.6□□□□□ -1.51
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP23-1A1A580 65 aa5.57□□□□□ -1.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 PLAC4Q8WY50 150 aa5.57□□□□□ -1.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP12-2P59991 146 aa5.56□□□□□ -1.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 SACSQ9NZJ4 4579 aa5.56□□□□□ -1.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.56□□□□□ -1.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.55□□□□□ -1.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.55□□□□□ -1.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 XP32Q5T750 250 aa5.53□□□□□ -1.52
APOBEC3C-201ENST00000361441 MYCBP2O75592 4640 aa5.5□□□□□ -1.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.5□□□□□ -1.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP5.49□□□□□ -1.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 APOBP04114 4563 aaKnown RBP5.48□□□□□ -1.53
APOBEC3C-201ENST00000361441 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa5.43□□□□□ -1.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP5.43□□□□□ -1.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 HSPG2P98160 4391 aa5.43□□□□□ -1.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP12-1P59990 96 aa5.42□□□□□ -1.54
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.38□□□□□ -1.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.38□□□□□ -1.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.37□□□□□ -1.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.36□□□□□ -1.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 RYR3Q15413 4870 aa5.36□□□□□ -1.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP10-8P60410 259 aa5.34□□□□□ -1.55
APOBEC3C-201ENST00000361441 LPAP08519 4548 aa5.32□□□□□ -1.56
APOBEC3C-201ENST00000361441 RYR2Q92736 4967 aa5.31□□□□□ -1.56
APOBEC3C-201ENST00000361441 A0A1B0GVY2 172 aa5.3□□□□□ -1.56
APOBEC3C-201ENST00000361441 TNXBP22105 4242 aa5.28□□□□□ -1.56
APOBEC3C-201ENST00000361441 R4GN34 69 aa5.26□□□□□ -1.57
APOBEC3C-201ENST00000361441 LRP2P98164 4655 aa5.2□□□□□ -1.58
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.2□□□□□ -1.58
APOBEC3C-201ENST00000361441 Q5VSD8 79 aa5.2□□□□□ -1.58
APOBEC3C-201ENST00000361441 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.19□□□□□ -1.58
APOBEC3C-201ENST00000361441 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.17□□□□□ -1.58
APOBEC3C-201ENST00000361441 RYR1P21817 5038 aa5.13□□□□□ -1.59
APOBEC3C-201ENST00000361441 M0QZ58 72 aa5.08□□□□□ -1.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.08□□□□□ -1.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.04□□□□□ -1.6
APOBEC3C-201ENST00000361441 MT1HL1P0DM35 61 aa5.02□□□□□ -1.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 INE1O15225 51 aa5□□□□□ -1.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 LCE2CQ5TA81 110 aa4.99□□□□□ -1.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 PP632Q6XCG6 107 aa4.98□□□□□ -1.61
APOBEC3C-201ENST00000361441 LCE2BO14633 110 aa4.95□□□□□ -1.62
APOBEC3C-201ENST00000361441 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.93□□□□□ -1.62
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.93□□□□□ -1.62
APOBEC3C-201ENST00000361441 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.91□□□□□ -1.62
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa4.91□□□□□ -1.62
APOBEC3C-201ENST00000361441 HERC2O95714 4834 aa4.89□□□□□ -1.63
APOBEC3C-201ENST00000361441 MUC2Q02817 5179 aa4.88□□□□□ -1.63
APOBEC3C-201ENST00000361441 MUC17Q685J3 4493 aa4.82□□□□□ -1.64
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.82□□□□□ -1.64
APOBEC3C-201ENST00000361441 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.79□□□□□ -1.64
APOBEC3C-201ENST00000361441 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.64□□□□□ -1.67
APOBEC3C-201ENST00000361441 HERC1Q15751 4861 aa4.63□□□□□ -1.67
APOBEC3C-201ENST00000361441 TNP1P09430 55 aa4.63□□□□□ -1.67
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa4.6□□□□□ -1.67
APOBEC3C-201ENST00000361441 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP4.51□□□□□ -1.69
APOBEC3C-201ENST00000361441 RNF213Q63HN8 5207 aa4.49□□□□□ -1.69
APOBEC3C-201ENST00000361441 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.43□□□□□ -1.7
APOBEC3C-201ENST00000361441 M0R2T5 61 aa4.37□□□□□ -1.71
APOBEC3C-201ENST00000361441 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.37□□□□□ -1.71
APOBEC3C-201ENST00000361441 LCE3AQ5TA76 89 aa4.34□□□□□ -1.71
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.3□□□□□ -1.72
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP10-10P60014 251 aa4.3□□□□□ -1.72
APOBEC3C-201ENST00000361441 MT1FP04733 61 aa4.23□□□□□ -1.73
APOBEC3C-201ENST00000361441 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.22□□□□□ -1.73
APOBEC3C-201ENST00000361441 MT1HP80294 61 aa4.21□□□□□ -1.74
APOBEC3C-201ENST00000361441 MT2AP02795 61 aa4.18□□□□□ -1.74
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP10-12P60413 245 aa4.17□□□□□ -1.74
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.11□□□□□ -1.75
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.11□□□□□ -1.75
APOBEC3C-201ENST00000361441 USH2AO75445 5202 aa4.09□□□□□ -1.75
APOBEC3C-201ENST00000361441 KMT2DO14686 5537 aa4.08□□□□□ -1.76
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP10-5P60370 271 aa4.07□□□□□ -1.76
APOBEC3C-201ENST00000361441 MT1BP07438 61 aa4.06□□□□□ -1.76
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP12-3P60328 96 aa4.06□□□□□ -1.76
APOBEC3C-201ENST00000361441 MT1XP80297 61 aa4.06□□□□□ -1.76
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.05□□□□□ -1.76
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa3.99□□□□□ -1.77
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa3.98□□□□□ -1.77
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP2-2Q9BYT5 123 aa3.98□□□□□ -1.77
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa3.9□□□□□ -1.78
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.87□□□□□ -1.79
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP2-3P0C7H8 128 aa3.86□□□□□ -1.79
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa3.86□□□□□ -1.79
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa3.86□□□□□ -1.79
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa3.85□□□□□ -1.79
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa3.85□□□□□ -1.79
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.85□□□□□ -1.79
APOBEC3C-201ENST00000361441 LCE3CQ5T5A8 94 aa3.84□□□□□ -1.79
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa3.79□□□□□ -1.8
APOBEC3C-201ENST00000361441 FSIP2Q5CZC0 6907 aa3.78□□□□□ -1.8
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa3.75□□□□□ -1.81
APOBEC3C-201ENST00000361441 KRTAP12-4P60329 112 aa3.71□□□□□ -1.81
APOBEC3C-201ENST00000361441 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.67□□□□□ -1.82
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