RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000361320.4

LRRTM3-201, Transcript of leucine rich repeat transmembrane neuronal 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene LRRTM3, Length 4,358 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRTM3-201ENST00000361320 STARD9Q9P2P6 4700 aa3.61□□□□□ -1.83
LRRTM3-201ENST00000361320 PKHD1P08F94 4074 aa3.58□□□□□ -1.84
LRRTM3-201ENST00000361320 HYDINQ4G0P3 5121 aa3.57□□□□□ -1.84
LRRTM3-201ENST00000361320 Q5VV11 94 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa3.56□□□□□ -1.84
LRRTM3-201ENST00000361320 KIAA1109Q2LD37 5005 aa3.55□□□□□ -1.84
LRRTM3-201ENST00000361320 A8MU10 97 aa3.54□□□□□ -1.84
LRRTM3-201ENST00000361320 RYR1P21817 5038 aa3.54□□□□□ -1.84
LRRTM3-201ENST00000361320 FAT1Q14517 4588 aa3.53□□□□□ -1.84
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LRRTM3-201ENST00000361320 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa3.49□□□□□ -1.85
LRRTM3-201ENST00000361320 RYR3Q15413 4870 aa3.49□□□□□ -1.85
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LRRTM3-201ENST00000361320 LRP1BQ9NZR2 4599 aa3.48□□□□□ -1.85
LRRTM3-201ENST00000361320 P0C880 135 aa3.47□□□□□ -1.85
LRRTM3-201ENST00000361320 ROMO1P60602 79 aa3.45□□□□□ -1.86
LRRTM3-201ENST00000361320 FAT3Q8TDW7 4589 aa3.45□□□□□ -1.86
LRRTM3-201ENST00000361320 LOC100996750A0A140TA64 210 aa3.45□□□□□ -1.86
LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.45□□□□□ -1.86
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LRRTM3-201ENST00000361320 TNP1P09430 55 aa3.42□□□□□ -1.86
LRRTM3-201ENST00000361320 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.41□□□□□ -1.86
LRRTM3-201ENST00000361320 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa3.41□□□□□ -1.86
LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa3.39□□□□□ -1.87
LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM3-201ENST00000361320 LUZP6Q538Z0 58 aa3.37□□□□□ -1.87
LRRTM3-201ENST00000361320 TNXBP22105 4242 aa3.35□□□□□ -1.87
LRRTM3-201ENST00000361320 HERC2O95714 4834 aa3.35□□□□□ -1.87
LRRTM3-201ENST00000361320 RYR2Q92736 4967 aa3.35□□□□□ -1.87
LRRTM3-201ENST00000361320 HSPG2P98160 4391 aa3.34□□□□□ -1.87
LRRTM3-201ENST00000361320 KMT2CQ8NEZ4 4911 aaKnown RBP3.34□□□□□ -1.87
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LRRTM3-201ENST00000361320 H0YAA0 97 aa3.32□□□□□ -1.88
LRRTM3-201ENST00000361320 MYCBP2O75592 4640 aa3.31□□□□□ -1.88
LRRTM3-201ENST00000361320 A6NN06 94 aa3.29□□□□□ -1.88
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LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa3.28□□□□□ -1.89
LRRTM3-201ENST00000361320 LCE2BO14633 110 aa3.25□□□□□ -1.89
LRRTM3-201ENST00000361320 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.21□□□□□ -1.9
LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP12-2P59991 146 aa3.2□□□□□ -1.9
LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.2□□□□□ -1.9
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LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP12-1P59990 96 aa3.17□□□□□ -1.9
LRRTM3-201ENST00000361320 PP632Q6XCG6 107 aa3.17□□□□□ -1.9
LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.17□□□□□ -1.9
LRRTM3-201ENST00000361320 LRP2P98164 4655 aa3.16□□□□□ -1.9
LRRTM3-201ENST00000361320 LPAP08519 4548 aa3.15□□□□□ -1.9
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LRRTM3-201ENST00000361320 MT2AP02795 61 aa3.09□□□□□ -1.91
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LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa3.03□□□□□ -1.93
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LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa2.99□□□□□ -1.93
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LRRTM3-201ENST00000361320 UBR4Q5T4S7 5183 aa2.97□□□□□ -1.93
LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa2.96□□□□□ -1.94
LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa2.95□□□□□ -1.94
LRRTM3-201ENST00000361320 FSIP2Q5CZC0 6907 aa2.95□□□□□ -1.94
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LRRTM3-201ENST00000361320 CRCT1Q9UGL9 99 aa2.91□□□□□ -1.94
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LRRTM3-201ENST00000361320 LCE3AQ5TA76 89 aa2.88□□□□□ -1.95
LRRTM3-201ENST00000361320 RNF213Q63HN8 5207 aa2.87□□□□□ -1.95
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LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa2.85□□□□□ -1.95
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LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa2.84□□□□□ -1.96
LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa2.82□□□□□ -1.96
LRRTM3-201ENST00000361320 FAT4Q6V0I7 4981 aa2.82□□□□□ -1.96
LRRTM3-201ENST00000361320 HMCN2Q8NDA2 5059 aa2.81□□□□□ -1.96
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LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa2.77□□□□□ -1.97
LRRTM3-201ENST00000361320 MUC2Q02817 5179 aa2.77□□□□□ -1.97
LRRTM3-201ENST00000361320 MT1BP07438 61 aa2.76□□□□□ -1.97
LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa2.76□□□□□ -1.97
LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP10-5P60370 271 aa2.75□□□□□ -1.97
LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP2.71□□□□□ -1.98
LRRTM3-201ENST00000361320 MT1XP80297 61 aa2.7□□□□□ -1.98
LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa2.7□□□□□ -1.98
LRRTM3-201ENST00000361320 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa2.69□□□□□ -1.98
LRRTM3-201ENST00000361320 SPRR2EP22531 72 aa2.69□□□□□ -1.98
LRRTM3-201ENST00000361320 SPRR2BP35325 72 aa2.69□□□□□ -1.98
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