RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000319942.7

RABGGTB-201, Transcript of Rab geranylgeranyltransferase subunit beta, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RABGGTB, Length 1,496 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RABGGTB-201ENST00000319942 TNXBP22105 4242 aa5.5□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa5.49□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 PCOTHQ58A44 107 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 FAT3Q8TDW7 4589 aa5.47□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV2-30P06310 120 aa5.46□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 RPS28P62857 69 aaKnown RBP5.46□□□□□ -1.53
RABGGTB-201ENST00000319942 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa5.45□□□□□ -1.54
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RABGGTB-201ENST00000319942 TPRXLQ17RH7 258 aa5.43□□□□□ -1.54
RABGGTB-201ENST00000319942 C7orf65Q6ZTY9 151 aa5.42□□□□□ -1.54
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RABGGTB-201ENST00000319942 SPINK7P58062 85 aa5.38□□□□□ -1.55
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RABGGTB-201ENST00000319942 HERC2O95714 4834 aa5.34□□□□□ -1.56
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RABGGTB-201ENST00000319942 MPLKIPQ8TAP9 179 aa5.19□□□□□ -1.58
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RABGGTB-201ENST00000319942 S4R3F8 94 aa5.07□□□□□ -1.6
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RABGGTB-201ENST00000319942 A6NED7 52 aa4.95□□□□□ -1.62
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RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP10-5P60370 271 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-201ENST00000319942 MIR22HGQ0VDD5 57 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-201ENST00000319942 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.84□□□□□ -1.63
RABGGTB-201ENST00000319942 PRO0628Q9UI54 55 aa4.82□□□□□ -1.64
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RABGGTB-201ENST00000319942 P0C880 135 aa4.79□□□□□ -1.64
RABGGTB-201ENST00000319942 M0R2T5 61 aa4.77□□□□□ -1.65
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-201ENST00000319942 M0QZ58 72 aa4.76□□□□□ -1.65
RABGGTB-201ENST00000319942 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.74□□□□□ -1.65
RABGGTB-201ENST00000319942 A8MU10 97 aa4.74□□□□□ -1.65
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RABGGTB-201ENST00000319942 K7ERS5 55 aa4.69□□□□□ -1.66
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RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP10-10P60014 251 aa4.57□□□□□ -1.68
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RABGGTB-201ENST00000319942 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa4.45□□□□□ -1.7
RABGGTB-201ENST00000319942 ROMO1P60602 79 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-201ENST00000319942 PLAC4Q8WY50 150 aa4.44□□□□□ -1.7
RABGGTB-201ENST00000319942 KRTAP10-12P60413 245 aa4.43□□□□□ -1.7
RABGGTB-201ENST00000319942 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa4.43□□□□□ -1.7
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