RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000307180.4

TSNARE1-201, Transcript of t-SNARE domain containing 1, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 5 BASIC

Gene TSNARE1, Length 1,907 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Endoplasmic reticulum .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSNARE1-201ENST00000307180 LPAP08519 4548 aa8.7□□□□□ -1.02
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TSNARE1-201ENST00000307180 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.63□□□□□ -1.03
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TSNARE1-201ENST00000307180 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.22□□□□□ -1.09
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TSNARE1-201ENST00000307180 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.95□□□□□ -1.3
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TSNARE1-201ENST00000307180 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP6.53□□□□□ -1.36
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TSNARE1-201ENST00000307180 MT1XP80297 61 aa6.44□□□□□ -1.38
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TSNARE1-201ENST00000307180 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.36□□□□□ -1.39
TSNARE1-201ENST00000307180 LCE3AQ5TA76 89 aa6.31□□□□□ -1.4
TSNARE1-201ENST00000307180 INE1O15225 51 aa6.29□□□□□ -1.4
TSNARE1-201ENST00000307180 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
TSNARE1-201ENST00000307180 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.19□□□□□ -1.42
TSNARE1-201ENST00000307180 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP6.18□□□□□ -1.42
TSNARE1-201ENST00000307180 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa6.18□□□□□ -1.42
TSNARE1-201ENST00000307180 KMT2DO14686 5537 aa6.17□□□□□ -1.42
TSNARE1-201ENST00000307180 KRTAP10-12P60413 245 aa6.15□□□□□ -1.42
TSNARE1-201ENST00000307180 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.11□□□□□ -1.43
TSNARE1-201ENST00000307180 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa6.11□□□□□ -1.43
TSNARE1-201ENST00000307180 KRTAP12-3P60328 96 aa6.04□□□□□ -1.44
TSNARE1-201ENST00000307180 KRTAP5-9P26371 169 aa6.03□□□□□ -1.44
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