RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000284116.8

GDPD1-201, Transcript of glycerophosphodiester phosphodiesterase domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene GDPD1, Length 1,821 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDPD1-201ENST00000284116 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa9.63□□□□□ -0.87
GDPD1-201ENST00000284116 LRP2P98164 4655 aa9.63□□□□□ -0.87
GDPD1-201ENST00000284116 LPAP08519 4548 aa9.6□□□□□ -0.87
GDPD1-201ENST00000284116 SEC61GP60059 68 aa9.59□□□□□ -0.87
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa9.53□□□□□ -0.88
GDPD1-201ENST00000284116 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP9.52□□□□□ -0.89
GDPD1-201ENST00000284116 UQCR11O14957 56 aa9.52□□□□□ -0.89
GDPD1-201ENST00000284116 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa9.51□□□□□ -0.89
GDPD1-201ENST00000284116 S4R3F8 94 aa9.51□□□□□ -0.89
GDPD1-201ENST00000284116 SPATA8Q6RVD6 105 aa9.49□□□□□ -0.89
GDPD1-201ENST00000284116 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa9.48□□□□□ -0.89
GDPD1-201ENST00000284116 MIR22HGQ0VDD5 57 aa9.45□□□□□ -0.9
GDPD1-201ENST00000284116 A0A1B0GU33 70 aa9.38□□□□□ -0.91
GDPD1-201ENST00000284116 PMAIP1Q13794 54 aa9.37□□□□□ -0.91
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa9.35□□□□□ -0.91
GDPD1-201ENST00000284116 MUC17Q685J3 4493 aa9.3□□□□□ -0.92
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP9.29□□□□□ -0.92
GDPD1-201ENST00000284116 H0YAA0 97 aa9.28□□□□□ -0.92
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa9.28□□□□□ -0.92
GDPD1-201ENST00000284116 A6NN06 94 aa9.28□□□□□ -0.92
GDPD1-201ENST00000284116 CSAG1Q6PB30 78 aa9.26□□□□□ -0.93
GDPD1-201ENST00000284116 PCLOQ9Y6V0 5065 aa9.25□□□□□ -0.93
GDPD1-201ENST00000284116 P0C880 135 aa9.16□□□□□ -0.94
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa9.16□□□□□ -0.94
GDPD1-201ENST00000284116 ADM2Q7Z4H4 148 aa9.15□□□□□ -0.94
GDPD1-201ENST00000284116 HERC1Q15751 4861 aa9.12□□□□□ -0.95
GDPD1-201ENST00000284116 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP9.1□□□□□ -0.95
GDPD1-201ENST00000284116 HMCN2Q8NDA2 5059 aa9.1□□□□□ -0.95
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa9.09□□□□□ -0.95
GDPD1-201ENST00000284116 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa9.06□□□□□ -0.96
GDPD1-201ENST00000284116 A0A0D9SG42 100 aa8.94□□□□□ -0.98
GDPD1-201ENST00000284116 K7ERS5 55 aa8.93□□□□□ -0.98
GDPD1-201ENST00000284116 M0QZ58 72 aa8.92□□□□□ -0.98
GDPD1-201ENST00000284116 MUC2Q02817 5179 aa8.87□□□□□ -0.99
GDPD1-201ENST00000284116 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP8.85□□□□□ -0.99
GDPD1-201ENST00000284116 LCE2CQ5TA81 110 aa8.8□□□□□ -1
GDPD1-201ENST00000284116 R4GN34 69 aa8.77□□□□□ -1
GDPD1-201ENST00000284116 LORP23490 312 aaPredicted RBP8.77□□□□□ -1.01
GDPD1-201ENST00000284116 PRAC1Q96KF2 57 aa8.76□□□□□ -1.01
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP12-1P59990 96 aa8.75□□□□□ -1.01
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP12-2P59991 146 aa8.75□□□□□ -1.01
GDPD1-201ENST00000284116 SPINT4Q6UDR6 99 aa8.7□□□□□ -1.02
GDPD1-201ENST00000284116 RNF213Q63HN8 5207 aa8.67□□□□□ -1.02
GDPD1-201ENST00000284116 ROMO1P60602 79 aa8.65□□□□□ -1.02
GDPD1-201ENST00000284116 LINC01554Q52M75 96 aa8.65□□□□□ -1.02
GDPD1-201ENST00000284116 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.61□□□□□ -1.03
GDPD1-201ENST00000284116 MT1HP80294 61 aa8.59□□□□□ -1.03
GDPD1-201ENST00000284116 CRIPTQ9P021 101 aa8.57□□□□□ -1.04
GDPD1-201ENST00000284116 M0R2T5 61 aa8.52□□□□□ -1.04
GDPD1-201ENST00000284116 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.5□□□□□ -1.05
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.47□□□□□ -1.05
GDPD1-201ENST00000284116 MT2AP02795 61 aa8.33□□□□□ -1.08
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa8.33□□□□□ -1.08
GDPD1-201ENST00000284116 SPRR2GQ9BYE4 73 aa8.33□□□□□ -1.08
GDPD1-201ENST00000284116 MT1FP04733 61 aa8.29□□□□□ -1.08
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa8.29□□□□□ -1.08
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP10-10P60014 251 aa8.28□□□□□ -1.08
GDPD1-201ENST00000284116 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.28□□□□□ -1.08
GDPD1-201ENST00000284116 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa8.26□□□□□ -1.09
GDPD1-201ENST00000284116 PLAC4Q8WY50 150 aa8.12□□□□□ -1.11
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa8.06□□□□□ -1.12
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa8.01□□□□□ -1.13
GDPD1-201ENST00000284116 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8□□□□□ -1.13
GDPD1-201ENST00000284116 MT1BP07438 61 aa7.94□□□□□ -1.14
GDPD1-201ENST00000284116 TNP1P09430 55 aa7.92□□□□□ -1.14
GDPD1-201ENST00000284116 PP632Q6XCG6 107 aa7.87□□□□□ -1.15
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP23-1A1A580 65 aa7.78□□□□□ -1.16
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP10-5P60370 271 aa7.75□□□□□ -1.17
GDPD1-201ENST00000284116 MT1XP80297 61 aa7.75□□□□□ -1.17
GDPD1-201ENST00000284116 LCE2BO14633 110 aa7.74□□□□□ -1.17
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.59□□□□□ -1.19
GDPD1-201ENST00000284116 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.58□□□□□ -1.2
GDPD1-201ENST00000284116 LCE3AQ5TA76 89 aa7.55□□□□□ -1.2
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP7.46□□□□□ -1.21
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP10-12P60413 245 aa7.43□□□□□ -1.22
GDPD1-201ENST00000284116 USH2AO75445 5202 aa7.41□□□□□ -1.22
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa7.41□□□□□ -1.22
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP12-3P60328 96 aa7.23□□□□□ -1.25
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa7.16□□□□□ -1.26
GDPD1-201ENST00000284116 SSPOA2VEC9 5147 aa7.16□□□□□ -1.26
GDPD1-201ENST00000284116 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa7.14□□□□□ -1.27
GDPD1-201ENST00000284116 NDUFAF8A1L188 74 aa7.14□□□□□ -1.27
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa7.11□□□□□ -1.27
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa7.11□□□□□ -1.27
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa7.08□□□□□ -1.28
GDPD1-201ENST00000284116 LUZP6Q538Z0 58 aa7.03□□□□□ -1.28
GDPD1-201ENST00000284116 KMT2DO14686 5537 aa6.97□□□□□ -1.29
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa6.92□□□□□ -1.3
GDPD1-201ENST00000284116 FSIP2Q5CZC0 6907 aa6.87□□□□□ -1.31
GDPD1-201ENST00000284116 H3BS24 57 aa6.8□□□□□ -1.32
GDPD1-201ENST00000284116 LCE3CQ5T5A8 94 aa6.78□□□□□ -1.32
GDPD1-201ENST00000284116 LOC100996750A0A140TA64 210 aa6.76□□□□□ -1.33
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa6.76□□□□□ -1.33
GDPD1-201ENST00000284116 MT1EP04732 61 aa6.76□□□□□ -1.33
GDPD1-201ENST00000284116 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.75□□□□□ -1.33
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa6.69□□□□□ -1.34
GDPD1-201ENST00000284116 MT1LQ93083 61 aa6.68□□□□□ -1.34
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa6.66□□□□□ -1.34
GDPD1-201ENST00000284116 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.55□□□□□ -1.36
GDPD1-201ENST00000284116 CRCT1Q9UGL9 99 aa6.48□□□□□ -1.37
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