RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000283628.9

UBP1-201, Transcript of upstream binding protein 1, humanhuman

APPRIS P3 TSL 2 BASIC

Gene UBP1, Length 2,074 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBP1-201ENST00000283628 FAT3Q8TDW7 4589 aa14.58□□□□□ -0.08
UBP1-201ENST00000283628 LINC01554Q52M75 96 aa14.57□□□□□ -0.08
UBP1-201ENST00000283628 CSAG1Q6PB30 78 aa14.55□□□□□ -0.08
UBP1-201ENST00000283628 RPL37P61927 97 aaKnown RBP14.54□□□□□ -0.08
UBP1-201ENST00000283628 KIAA1109Q2LD37 5005 aa14.52□□□□□ -0.09
UBP1-201ENST00000283628 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP14.43□□□□□ -0.1
UBP1-201ENST00000283628 MT1HL1P0DM35 61 aa14.42□□□□□ -0.1
UBP1-201ENST00000283628 XP32Q5T750 250 aa14.41□□□□□ -0.1
UBP1-201ENST00000283628 K7ERS5 55 aa14.38□□□□□ -0.11
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UBP1-201ENST00000283628 S4R3F8 94 aa14.28□□□□□ -0.12
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UBP1-201ENST00000283628 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP14.24□□□□□ -0.13
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa14.22□□□□□ -0.13
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa14.18□□□□□ -0.14
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa14.13□□□□□ -0.15
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa14.09□□□□□ -0.15
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UBP1-201ENST00000283628 BIRC6Q9NR09 4857 aa13.75□□□□□ -0.21
UBP1-201ENST00000283628 HERC2O95714 4834 aa13.72□□□□□ -0.21
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UBP1-201ENST00000283628 M0QZ58 72 aa13.65□□□□□ -0.22
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UBP1-201ENST00000283628 LRP2P98164 4655 aa13.62□□□□□ -0.23
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP12-1P59990 96 aa13.61□□□□□ -0.23
UBP1-201ENST00000283628 SPINT4Q6UDR6 99 aa13.52□□□□□ -0.24
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UBP1-201ENST00000283628 C10orf95Q9H7T3 257 aa13.38□□□□□ -0.27
UBP1-201ENST00000283628 R4GN34 69 aa13.24□□□□□ -0.29
UBP1-201ENST00000283628 H3BS24 57 aa13.19□□□□□ -0.3
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa13.19□□□□□ -0.3
UBP1-201ENST00000283628 MUC17Q685J3 4493 aa13.17□□□□□ -0.3
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UBP1-201ENST00000283628 LORP23490 312 aaPredicted RBP12.97□□□□□ -0.33
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UBP1-201ENST00000283628 LCE2CQ5TA81 110 aa12.4□□□□□ -0.42
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UBP1-201ENST00000283628 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa11.28□□□□□ -0.6
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UBP1-201ENST00000283628 KRTAP19-7Q3SYF9 63 aa9.97□□□□□ -0.81
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa9.94□□□□□ -0.82
UBP1-201ENST00000283628 KMT2DO14686 5537 aa9.93□□□□□ -0.82
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP9-6A8MVA2 160 aa9.84□□□□□ -0.83
UBP1-201ENST00000283628 MT1LQ93083 61 aa9.7□□□□□ -0.86
UBP1-201ENST00000283628 MT1EP04732 61 aa9.7□□□□□ -0.86
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UBP1-201ENST00000283628 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa9.62□□□□□ -0.87
UBP1-201ENST00000283628 KRTAP2-1Q9BYU5 128 aa9.62□□□□□ -0.87
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