RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000239461.10

PRRX1-201, Transcript of paired related homeobox 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene PRRX1, Length 4,284 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRRX1-201ENST00000239461 Q5W150 140 aa6.03□□□□□ -1.44
PRRX1-201ENST00000239461 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.02□□□□□ -1.45
PRRX1-201ENST00000239461 RYR1P21817 5038 aa6.02□□□□□ -1.45
PRRX1-201ENST00000239461 SPATA8Q6RVD6 105 aa6.02□□□□□ -1.45
PRRX1-201ENST00000239461 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.01□□□□□ -1.45
PRRX1-201ENST00000239461 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP5.99□□□□□ -1.45
PRRX1-201ENST00000239461 TNXBP22105 4242 aa5.99□□□□□ -1.45
PRRX1-201ENST00000239461 FAT1Q14517 4588 aa5.95□□□□□ -1.46
PRRX1-201ENST00000239461 A8MUU9 505 aa5.95□□□□□ -1.46
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa5.92□□□□□ -1.46
PRRX1-201ENST00000239461 A0A1B0GU33 70 aa5.89□□□□□ -1.47
PRRX1-201ENST00000239461 A0A0D9SG42 100 aa5.88□□□□□ -1.47
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.82□□□□□ -1.48
PRRX1-201ENST00000239461 KIAA1109Q2LD37 5005 aa5.8□□□□□ -1.48
PRRX1-201ENST00000239461 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.8□□□□□ -1.48
PRRX1-201ENST00000239461 BIRC6Q9NR09 4857 aa5.78□□□□□ -1.48
PRRX1-201ENST00000239461 HERC2O95714 4834 aa5.78□□□□□ -1.48
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP10-8P60410 259 aa5.76□□□□□ -1.49
PRRX1-201ENST00000239461 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP5.76□□□□□ -1.49
PRRX1-201ENST00000239461 P0C880 135 aa5.72□□□□□ -1.49
PRRX1-201ENST00000239461 RPL37P61927 97 aaKnown RBP5.72□□□□□ -1.49
PRRX1-201ENST00000239461 R4GN34 69 aa5.7□□□□□ -1.5
PRRX1-201ENST00000239461 ABCA13Q86UQ4 5058 aa5.7□□□□□ -1.5
PRRX1-201ENST00000239461 S4R3F8 94 aa5.67□□□□□ -1.5
PRRX1-201ENST00000239461 MYCBP2O75592 4640 aa5.67□□□□□ -1.5
PRRX1-201ENST00000239461 MT1HL1P0DM35 61 aa5.66□□□□□ -1.5
PRRX1-201ENST00000239461 XP32Q5T750 250 aa5.65□□□□□ -1.51
PRRX1-201ENST00000239461 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa5.61□□□□□ -1.51
PRRX1-201ENST00000239461 PLAC4Q8WY50 150 aa5.61□□□□□ -1.51
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.6□□□□□ -1.51
PRRX1-201ENST00000239461 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.59□□□□□ -1.51
PRRX1-201ENST00000239461 TPRXLQ17RH7 258 aa5.58□□□□□ -1.52
PRRX1-201ENST00000239461 M0QZ58 72 aa5.56□□□□□ -1.52
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP10-10P60014 251 aa5.52□□□□□ -1.53
PRRX1-201ENST00000239461 MUC17Q685J3 4493 aa5.51□□□□□ -1.53
PRRX1-201ENST00000239461 PCLOQ9Y6V0 5065 aa5.47□□□□□ -1.53
PRRX1-201ENST00000239461 H0YAA0 97 aa5.46□□□□□ -1.54
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.43□□□□□ -1.54
PRRX1-201ENST00000239461 LPAP08519 4548 aa5.38□□□□□ -1.55
PRRX1-201ENST00000239461 HMCN2Q8NDA2 5059 aa5.33□□□□□ -1.56
PRRX1-201ENST00000239461 LRP2P98164 4655 aa5.3□□□□□ -1.56
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.29□□□□□ -1.56
PRRX1-201ENST00000239461 HERC1Q15751 4861 aa5.24□□□□□ -1.57
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.2□□□□□ -1.58
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.15□□□□□ -1.58
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa5.14□□□□□ -1.59
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.11□□□□□ -1.59
PRRX1-201ENST00000239461 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP5.1□□□□□ -1.59
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.09□□□□□ -1.59
PRRX1-201ENST00000239461 PRO2289Q9P1D8 64 aa5.05□□□□□ -1.6
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.05□□□□□ -1.6
PRRX1-201ENST00000239461 PP632Q6XCG6 107 aa4.99□□□□□ -1.61
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP12-2P59991 146 aa4.97□□□□□ -1.61
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP12-1P59990 96 aa4.96□□□□□ -1.61
PRRX1-201ENST00000239461 RNF213Q63HN8 5207 aa4.96□□□□□ -1.62
PRRX1-201ENST00000239461 TNP1P09430 55 aa4.95□□□□□ -1.62
PRRX1-201ENST00000239461 LCE2CQ5TA81 110 aa4.94□□□□□ -1.62
PRRX1-201ENST00000239461 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.94□□□□□ -1.62
PRRX1-201ENST00000239461 MUC2Q02817 5179 aa4.94□□□□□ -1.62
PRRX1-201ENST00000239461 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.83□□□□□ -1.64
PRRX1-201ENST00000239461 INE1O15225 51 aa4.81□□□□□ -1.64
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.81□□□□□ -1.64
PRRX1-201ENST00000239461 FSIP2Q5CZC0 6907 aa4.79□□□□□ -1.64
PRRX1-201ENST00000239461 FAT4Q6V0I7 4981 aa4.78□□□□□ -1.64
PRRX1-201ENST00000239461 MT1HP80294 61 aa4.75□□□□□ -1.65
PRRX1-201ENST00000239461 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP4.67□□□□□ -1.66
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa4.63□□□□□ -1.67
PRRX1-201ENST00000239461 SPRR2GQ9BYE4 73 aa4.57□□□□□ -1.68
PRRX1-201ENST00000239461 CRCT1Q9UGL9 99 aa4.57□□□□□ -1.68
PRRX1-201ENST00000239461 MT2AP02795 61 aa4.56□□□□□ -1.68
PRRX1-201ENST00000239461 MT1FP04733 61 aa4.52□□□□□ -1.69
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa4.49□□□□□ -1.69
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa4.46□□□□□ -1.7
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa4.44□□□□□ -1.7
PRRX1-201ENST00000239461 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP4.43□□□□□ -1.7
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa4.42□□□□□ -1.7
PRRX1-201ENST00000239461 SYNE1Q8NF91 8797 aaKnown RBP4.39□□□□□ -1.71
PRRX1-201ENST00000239461 SPRR2FQ96RM1 72 aa4.35□□□□□ -1.71
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP10-12P60413 245 aa4.34□□□□□ -1.72
PRRX1-201ENST00000239461 MT1BP07438 61 aa4.33□□□□□ -1.72
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP9-2Q9BYQ4 174 aa4.31□□□□□ -1.72
PRRX1-201ENST00000239461 LCE2BO14633 110 aa4.3□□□□□ -1.72
PRRX1-201ENST00000239461 LCE3AQ5TA76 89 aa4.29□□□□□ -1.72
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP12-3P60328 96 aa4.2□□□□□ -1.74
PRRX1-201ENST00000239461 MT1XP80297 61 aa4.2□□□□□ -1.74
PRRX1-201ENST00000239461 USH2AO75445 5202 aa4.2□□□□□ -1.74
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP10-5P60370 271 aa4.19□□□□□ -1.74
PRRX1-201ENST00000239461 SSPOA2VEC9 5147 aa4.18□□□□□ -1.74
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP9-6A0A140TA67 174 aa4.17□□□□□ -1.74
PRRX1-201ENST00000239461 OBSCNQ5VST9 7968 aa4.16□□□□□ -1.74
PRRX1-201ENST00000239461 SPRR2EP22531 72 aa4.1□□□□□ -1.75
PRRX1-201ENST00000239461 SPRR2BP35325 72 aa4.1□□□□□ -1.75
PRRX1-201ENST00000239461 SPRR2AP35326 72 aa4.1□□□□□ -1.75
PRRX1-201ENST00000239461 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP4.1□□□□□ -1.75
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.09□□□□□ -1.75
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa4.09□□□□□ -1.75
PRRX1-201ENST00000239461 DSTQ03001 7570 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
PRRX1-201ENST00000239461 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PRRX1-201ENST00000239461 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4□□□□□ -1.77
PRRX1-201ENST00000239461 KRTAP19-5Q3LI72 72 aa3.98□□□□□ -1.77
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 38.1 ms