RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000193170.1

Ccdc71-202, Transcript of Coiled-coil domain-containing protein 71, mousemouse

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene Ccdc71, Length 3,044 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Olfr470Q8VF65 314 aa7.16□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 H2al3Q9D4U4 128 aa7.16□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 ArtnQ9Z0L2 224 aa7.16□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm15294V9GXA7 121 aa7.16□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 TectaO08523 2155 aa7.16□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Frem1Q684R7 2191 aa7.15□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Abca1P41233 2261 aa7.15□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Esp24A8R0V6 68 aa7.15□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm21693J3QK27 380 aa7.15□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Arl14eplQ3UKZ7 152 aa7.15□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Immp2lQ8BPT6 175 aa7.15□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 TprkbQ8QZZ7 175 aa7.15□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Q9CR34 168 aa7.15□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ahctf1Q8CJF7 2243 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.26
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ighv5-4A0A075B5P9 117 aa7.15□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ccl1P10146 92 aa7.15□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Vpreb1P13372 142 aa7.15□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Srp14P16254 110 aaKnown RBP7.15□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Neurog3P70661 214 aa7.15□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Olfr148Q60887 310 aa7.15□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Foxl1Q64731 336 aa7.15□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Zfp420Q7TMN8 578 aa7.15□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Tmem91Q8C581 172 aa7.15□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Znrf1Q91V17 227 aa7.15□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Arpc1aQ9R0Q6 370 aa7.15□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Asxl3Q8C4A5 2259 aa7.15□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Col27a1Q5QNQ9 1845 aa7.15□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Trav6n-7A0A075B6A6 116 aa7.14□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm37388A0A0A6YY46 143 aa7.14□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm11939A2A592 99 aa7.14□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gfra3O35118 397 aa7.14□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Olfr143P34985 313 aa7.14□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 TeppQ6IMH0 216 aa7.14□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm4894Q8CA09 118 aa7.14□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Timm21Q8CCM6 249 aa7.14□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Tm2d2Q8R0I4 213 aa7.14□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Mapk1ip1Q9D7G9 263 aa7.14□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Lbhd2G3UW55 114 aa7.14□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Apoc4Q61268 124 aa7.14□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 MiaQ61865 130 aa7.14□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Mrpl20Q9CQL4 149 aa7.14□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Pxmp4Q9JJW0 212 aa7.14□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm12886B1AZM5 119 aa7.14□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 PigyP0C1P0 71 aa7.14□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Q8VC23 124 aa7.14□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Zfp119aQ9JIC0 545 aa7.14□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Igkv20-101-2A0A0G2JDU3 113 aa7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Twist1P26687 206 aa7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Defb28Q3V2L0 89 aa7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Vmn1r197Q8R265 298 aa7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Crybb3Q9JJU9 211 aa7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 DspE9Q557 2883 aaKnown RBP7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Arhgef17Q80U35 2057 aa7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm9920D3YVZ2 140 aa7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3110021N24RikJ3QMN2 152 aa7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Mef2bO55087 349 aa7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Rhox10Q4TU83 196 aa7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 A530064D06RikQ8BNV8 229 aa7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 B430305J03RikQ8BQQ8 176 aa7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Foxi1Q922I5 372 aa7.13□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm45844A0A1B0GRQ2 137 aa7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Pex7P97865 318 aa7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 SeleQ00690 612 aa7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Tpsab1Q02844 273 aa7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Rer1Q9CQU3 196 aaKnown RBP7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Fbn2Q61555 2907 aa7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 DscamQ9ERC8 2013 aa7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Ighv1-55A0A075B5W6 117 aa7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm45623A0A1B0GSF6 103 aa7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm27021M0QWE2 156 aa7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 P01806 116 aa7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Hbb-b2P02089 147 aa7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 ApcsP12246 224 aa7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Phxr2P15972 65 aa7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Defa20Q45VN2 95 aa7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Crip3Q6Q6R3 243 aa7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cacna1gQ5SUF7 2381 aa7.12□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Trav21-dv12A0A075B6C4 109 aa7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 A0A1L1SR50 188 aa7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 3110082J24RikF6Z6Z2 108 aa7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Olfr149Q60888 311 aa7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Tmem190Q9D2E9 166 aa7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Med12A2AGH6 2190 aa7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 1700084M14RikB1AT01 78 aa7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Chtf8P0CG14 533 aa7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cd59bP58019 129 aa7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 AW146154Q3TPQ7 468 aa7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cd200r3Q5UKY4 296 aa7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Vma21Q78T54 101 aa7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Parm1Q923D3 296 aa7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Trav14d-3-dv8A0A075B619 120 aa7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm28778A0A087WSK7 233 aa7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 P01723 117 aa7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Egr2P08152 470 aa7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Cnep1r1Q3UJ81 125 aa7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Jpt2Q6PGH2 190 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Morn3Q8C5T4 241 aa7.11□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Tln2Q71LX4 2375 aa7.1□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Gm17521F6QAC8 156 aa7.1□□□□□ -1.27
Ccdc71-202ENSMUST00000193170 Defa-rs2P17534 91 aa7.1□□□□□ -1.27
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 31.3 ms