RNA–Protein interactions for RNA: ENSMUST00000165559.1

Ctif-201, Transcript of CBP80/20-dependent translation initiation factor, mousemouse

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene Ctif, Length 6,173 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ctif-201ENSMUST00000165559 Smlr1J3QMJ4 66 aa9.53□□□□□ -0.88
Ctif-201ENSMUST00000165559 P01786 117 aa9.53□□□□□ -0.88
Ctif-201ENSMUST00000165559 LtbP41155 306 aa9.53□□□□□ -0.88
Ctif-201ENSMUST00000165559 Mrpl32Q9DCI9 187 aaKnown RBP9.53□□□□□ -0.88
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cdkn2aQ64364 169 aa9.52□□□□□ -0.88
Ctif-201ENSMUST00000165559 Pygo2Q80V76 405 aa9.52□□□□□ -0.88
Ctif-201ENSMUST00000165559 P0C1Z5 52 aa9.52□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cd69P37217 199 aa9.52□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Msrb3Q8BU85 253 aa9.52□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Plpp2Q9DAX2 276 aa9.52□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tmem210Q9D2F0 147 aa9.52□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm19410A0A140LJC7 2098 aa9.52□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 1500009C09RikD3YYW9 81 aa9.52□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Foxh1O88621 401 aa9.52□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm9961Q8BNV2 113 aa9.52□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Dppa2Q9CWH0 301 aa9.52□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Lrrk2Q5S006 2527 aa9.52□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm9513B3GLJ6 99 aa9.52□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Igfbpl1Q80W15 270 aa9.52□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Trav8-1A0A075B641 109 aa9.51□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 P01790 122 aa9.51□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 P01896 185 aa9.51□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Slamf6Q9ET39 351 aa9.51□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Zfp407G3UVV3 2246 aa9.51□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ighv8-4A0A0A6YW26 117 aa9.51□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Loxl1P97873 607 aa9.51□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Mfap4Q9D1H9 257 aa9.51□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tln2Q71LX4 2375 aa9.51□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Foxl2O88470 375 aa9.51□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ssbp2Q9CYZ8 361 aa9.51□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ighv5-9-1A0A0A6YVS4 126 aa9.51□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Igkv8-34A0A0G2JDU0 121 aa9.51□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Znf431E9QAG8 526 aa9.51□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Esm1Q9QYY7 184 aa9.51□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Defa-rs7P50715 91 aa9.5□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm815Q3UWS2 115 aa9.5□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Lgals4Q8K419 326 aa9.5□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Nr2c2apQ3TV70 140 aa9.5□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Defa1P11477 93 aa9.5□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Fam216bQ8CC14 138 aa9.5□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Defb11Q8R2I7 77 aa9.5□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Synj2bpQ9D6K5 145 aa9.5□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Igkv4-62A0A0G2JDW9 117 aa9.5□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Reg3gO09049 174 aa9.5□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm6040Q4QY32 63 aa9.5□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm10203F6QJ09 66 aa9.49□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Zc2hc1aQ8BJH1 324 aa9.49□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 RhohQ9D3G9 191 aa9.49□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm9747Q810H1 104 aa9.49□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Shisa2Q8QZV2 295 aa9.49□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm26938S4R185 226 aa9.49□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 PdpnQ62011 172 aa9.49□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Jpt2Q6PGH2 190 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ighv1-4A0A075B5T4 117 aa9.49□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 BC035044E0CXF8 138 aa9.49□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Cend1Q9JKC6 149 aa9.49□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Dock10Q8BZN6 2150 aa9.49□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 P01738 130 aa9.49□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Hist1h2bfP10853 126 aa9.49□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Hist1h2bbQ64475 126 aa9.49□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 BC049762Q8C601 163 aa9.49□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Hist1h2bkQ8CGP1 126 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Hist1h2bpQ8CGP2 126 aaKnown RBP9.49□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Pth2Q91W27 100 aa9.49□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 PmvkQ9D1G2 192 aa9.49□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm7257D3YX25 99 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 P01792 123 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 P18528 98 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Chac1Q8R3J5 223 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Fgf4P11403 202 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ang5Q5GAN1 145 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Znhit3Q9CQK1 151 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Tex48Q9DA81 110 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Plac1Q9JI83 173 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 KprpB2RUR4 657 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 P06330 118 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 1810062G17RikG3X8Y2 129 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Hist3h2bbQ8CGP0 126 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Hist3h2baQ9D2U9 126 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Fancd2osQ9D4K4 178 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 GgctQ9D7X8 188 aa9.48□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 P03980 138 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Spaca3Q9D9X8 221 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm33815A0A087WNV3 176 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 COA4Q8BT51 87 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Klk4Q9Z0M1 255 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Igkv4-57-1A0A075B5M4 119 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 SeboxP70368 190 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Fhl3Q9R059 289 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rspo1Q9Z132 265 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Col5a3Q9JLI2 1739 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm6793B2RXM2 351 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Rnf183Q8QZS5 190 aa9.47□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Gm10188Q3V432 135 aa9.46□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Chchd5Q9CQP3 110 aa9.46□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Inafm1E9PV59 130 aa9.46□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Pfn1P62962 140 aa9.46□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Lamtor2Q9JHS3 125 aa9.46□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 Ighv1-74A0A0G2JGK2 117 aa9.46□□□□□ -0.89
Ctif-201ENSMUST00000165559 P01811 117 aa9.46□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 22,080 RNA–protein pairs in 38.9 ms