RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000614459.4

MDM4-215, Transcript of MDM4, p53 regulator, human

TSL 5 BASIC

Gene MDM4, Length 9,782 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
MDM4-215	ENST00000614459	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		3.8	□□□□□ -1.8
MDM4-215	ENST00000614459	FRY	Q5TBA9	3013 aa		3.79	□□□□□ -1.8
MDM4-215	ENST00000614459	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MDM4-215	ENST00000614459	CRYBG3	Q68DQ2	2970 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP13-2	Q52LG2	175 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MDM4-215	ENST00000614459	MGA	Q8IWI9	3026 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MDM4-215	ENST00000614459	FLNC	Q14315	2725 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MDM4-215	ENST00000614459	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		3.76	□□□□□ -1.81
MDM4-215	ENST00000614459	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		3.74	□□□□□ -1.81
MDM4-215	ENST00000614459	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	3.73	□□□□□ -1.81
MDM4-215	ENST00000614459	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM4-215	ENST00000614459	SZT2	Q5T011	3432 aa		3.73	□□□□□ -1.81
MDM4-215	ENST00000614459	UBR5	O95071	2799 aa	Predicted RBP	3.72	□□□□□ -1.81
MDM4-215	ENST00000614459	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		3.72	□□□□□ -1.81
MDM4-215	ENST00000614459	MUC3A	Q02505	3323 aa		3.71	□□□□□ -1.81
MDM4-215	ENST00000614459	LAMA1	P25391	3075 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM4-215	ENST00000614459	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		3.71	□□□□□ -1.82
MDM4-215	ENST00000614459	LRBA	P50851	2863 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM4-215	ENST00000614459	KALRN	O60229	2985 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM4-215	ENST00000614459	ZZEF1	O43149	2961 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		3.7	□□□□□ -1.82
MDM4-215	ENST00000614459	TNRC18	O15417	2968 aa	Predicted RBP	3.69	□□□□□ -1.82
MDM4-215	ENST00000614459	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	3.69	□□□□□ -1.82
MDM4-215	ENST00000614459	COL6A3	P12111	3177 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP7-1	Q8IUC3	87 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM4-215	ENST00000614459	TENM3	Q9P273	2699 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM4-215	ENST00000614459	EYS	Q5T1H1	3165 aa		3.69	□□□□□ -1.82
MDM4-215	ENST00000614459	SPEG	Q15772	3267 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP10-8	P60410	259 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM4-215	ENST00000614459	COL12A1	Q99715	3063 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM4-215	ENST00000614459	TG	P01266	2768 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM4-215	ENST00000614459	TPRXL	Q17RH7	258 aa		3.68	□□□□□ -1.82
MDM4-215	ENST00000614459	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		3.66	□□□□□ -1.82
MDM4-215	ENST00000614459	DMXL2	Q8TDJ6	3036 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM4-215	ENST00000614459	WDFY3	Q8IZQ1	3526 aa		3.65	□□□□□ -1.83
MDM4-215	ENST00000614459	DMD	P11532	3685 aa		3.64	□□□□□ -1.83
MDM4-215	ENST00000614459		A0A1B0GVY2	172 aa		3.63	□□□□□ -1.83
MDM4-215	ENST00000614459	NBEA	Q8NFP9	2946 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM4-215	ENST00000614459	NIPBL	Q6KC79	2804 aa	eCLIP	3.62	□□□□□ -1.83
MDM4-215	ENST00000614459	XP32	Q5T750	250 aa		3.62	□□□□□ -1.83
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP12-2	P59991	146 aa		3.59	□□□□□ -1.83
MDM4-215	ENST00000614459	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		3.59	□□□□□ -1.83
MDM4-215	ENST00000614459	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDM4-215	ENST00000614459	NF1	P21359	2839 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDM4-215	ENST00000614459	TACC2	O95359	2948 aa		3.58	□□□□□ -1.84
MDM4-215	ENST00000614459	ATM	Q13315	3056 aa		3.57	□□□□□ -1.84
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP12-1	P59990	96 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDM4-215	ENST00000614459	HIVEP1	P15822	2718 aa		3.56	□□□□□ -1.84
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP1-4	P0C5Y4	121 aa		3.54	□□□□□ -1.84
MDM4-215	ENST00000614459	TENM1	Q9UKZ4	2725 aa		3.53	□□□□□ -1.84
MDM4-215	ENST00000614459	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MDM4-215	ENST00000614459	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP10-10	P60014	251 aa		3.52	□□□□□ -1.85
MDM4-215	ENST00000614459	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	3.47	□□□□□ -1.85
MDM4-215	ENST00000614459	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		3.47	□□□□□ -1.85
MDM4-215	ENST00000614459	ZFHX3	Q15911	3703 aa		3.46	□□□□□ -1.85
MDM4-215	ENST00000614459	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		3.46	□□□□□ -1.85
MDM4-215	ENST00000614459	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		3.46	□□□□□ -1.86
MDM4-215	ENST00000614459	SRRM2	Q9UQ35	2752 aa	Known RBP	3.43	□□□□□ -1.86
MDM4-215	ENST00000614459	NBPF19	A0A087WUL8	3843 aa		3.43	□□□□□ -1.86
MDM4-215	ENST00000614459	PDZD2	O15018	2839 aa		3.42	□□□□□ -1.86
MDM4-215	ENST00000614459	PKD1L1	Q8TDX9	2849 aa		3.4	□□□□□ -1.87
MDM4-215	ENST00000614459	VWF	P04275	2813 aa		3.39	□□□□□ -1.87
MDM4-215	ENST00000614459	LAMA5	O15230	3695 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MDM4-215	ENST00000614459	TENM4	Q6N022	2769 aa		3.38	□□□□□ -1.87
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP10-6	P60371	365 aa	Predicted RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MDM4-215	ENST00000614459	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	3.35	□□□□□ -1.87
MDM4-215	ENST00000614459	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MDM4-215	ENST00000614459	MXRA5	Q9NR99	2828 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MDM4-215	ENST00000614459	RELN	P78509	3460 aa		3.33	□□□□□ -1.88
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP19-4	Q3LI73	84 aa		3.32	□□□□□ -1.88
MDM4-215	ENST00000614459	TENM2	Q9NT68	2774 aa		3.3	□□□□□ -1.88
MDM4-215	ENST00000614459	ANK3	Q12955	4377 aa	Known RBP	3.27	□□□□□ -1.89
MDM4-215	ENST00000614459	COL7A1	Q02388	2944 aa		3.26	□□□□□ -1.89
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP10-12	P60413	245 aa		3.25	□□□□□ -1.89
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP3-1	Q9BYR8	98 aa		3.25	□□□□□ -1.89
MDM4-215	ENST00000614459	ZAN	Q9Y493	2812 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM4-215	ENST00000614459	MEGF8	Q7Z7M0	2845 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM4-215	ENST00000614459	HRNR	Q86YZ3	2850 aa	Predicted RBP	3.22	□□□□□ -1.89
MDM4-215	ENST00000614459	FBN2	P35556	2912 aa		3.22	□□□□□ -1.89
MDM4-215	ENST00000614459	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		3.2	□□□□□ -1.9
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP12-3	P60328	96 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP3-2	Q9BYR7	98 aa		3.18	□□□□□ -1.9
MDM4-215	ENST00000614459	CUBN	O60494	3623 aa		3.17	□□□□□ -1.9
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP4-5	Q9BYR2	181 aa		3.15	□□□□□ -1.9
MDM4-215	ENST00000614459	SVEP1	Q4LDE5	3571 aa		3.15	□□□□□ -1.9
MDM4-215	ENST00000614459	MT3	P25713	68 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MDM4-215	ENST00000614459	ALMS1	Q8TCU4	4167 aa		3.14	□□□□□ -1.91
MDM4-215	ENST00000614459	HUWE1	Q7Z6Z7	4374 aa	Known RBP	3.12	□□□□□ -1.91
MDM4-215	ENST00000614459	BSN	Q9UPA5	3926 aa		3.1	□□□□□ -1.91
MDM4-215	ENST00000614459	CSMD2	Q7Z408	3487 aa		3.09	□□□□□ -1.91
MDM4-215	ENST00000614459	MT1HL1	P0DM35	61 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MDM4-215	ENST00000614459	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		3.08	□□□□□ -1.92
MDM4-215	ENST00000614459	KRTAP3-3	Q9BYR6	98 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MDM4-215	ENST00000614459	VPS13C	Q709C8	3753 aa		3.07	□□□□□ -1.92
MDM4-215	ENST00000614459	FBN1	P35555	2871 aa	Known RBP	3.03	□□□□□ -1.92
MDM4-215	ENST00000614459	CRCT1	Q9UGL9	99 aa		3.01	□□□□□ -1.93
MDM4-215	ENST00000614459	AKAP9	Q99996	3911 aa		2.98	□□□□□ -1.93
MDM4-215	ENST00000614459	TRRAP	Q9Y4A5	3859 aa		2.98	□□□□□ -1.93

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