RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000577827.5

PTPRM-205, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type M, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRM, Length 4,640 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRM-205ENST00000577827 USP34Q70CQ2 3546 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-205ENST00000577827 COX6B2Q6YFQ2 88 aa5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-205ENST00000577827 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-205ENST00000577827 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.94□□□□□ -1.46
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP10-2P60368 255 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRM-205ENST00000577827 Q6ZSA8 131 aa5.92□□□□□ -1.46
PTPRM-205ENST00000577827 MYO15AQ9UKN7 3530 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRM-205ENST00000577827 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.9□□□□□ -1.47
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa5.89□□□□□ -1.47
PTPRM-205ENST00000577827 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5.88□□□□□ -1.47
PTPRM-205ENST00000577827 ADM2Q7Z4H4 148 aa5.87□□□□□ -1.47
PTPRM-205ENST00000577827 HIVEP1P15822 2718 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.86□□□□□ -1.47
PTPRM-205ENST00000577827 J3QL48 77 aa5.85□□□□□ -1.47
PTPRM-205ENST00000577827 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.84□□□□□ -1.48
PTPRM-205ENST00000577827 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRM-205ENST00000577827 NF1P21359 2839 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRM-205ENST00000577827 FBN2P35556 2912 aa5.82□□□□□ -1.48
PTPRM-205ENST00000577827 DCHS2Q6V1P9 2916 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRM-205ENST00000577827 R4GN34 69 aa5.8□□□□□ -1.48
PTPRM-205ENST00000577827 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP5.79□□□□□ -1.48
PTPRM-205ENST00000577827 MUC3AQ02505 3323 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRM-205ENST00000577827 MXRA5Q9NR99 2828 aa5.77□□□□□ -1.49
PTPRM-205ENST00000577827 A0A0A0MQY5 61 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRM-205ENST00000577827 DMDP11532 3685 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRM-205ENST00000577827 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRM-205ENST00000577827 A8MUU9 505 aa5.73□□□□□ -1.49
PTPRM-205ENST00000577827 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.71□□□□□ -1.49
PTPRM-205ENST00000577827 M0QZ58 72 aa5.7□□□□□ -1.5
PTPRM-205ENST00000577827 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.69□□□□□ -1.5
PTPRM-205ENST00000577827 Q5VSD8 79 aa5.68□□□□□ -1.5
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PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa5.65□□□□□ -1.51
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-205ENST00000577827 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRM-205ENST00000577827 H0YAA0 97 aa5.61□□□□□ -1.51
PTPRM-205ENST00000577827 TENM3Q9P273 2699 aa5.6□□□□□ -1.51
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PTPRM-205ENST00000577827 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa5.56□□□□□ -1.52
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PTPRM-205ENST00000577827 ASPMQ8IZT6 3477 aa5.53□□□□□ -1.52
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PTPRM-205ENST00000577827 TENM1Q9UKZ4 2725 aa5.42□□□□□ -1.54
PTPRM-205ENST00000577827 PP632Q6XCG6 107 aa5.41□□□□□ -1.54
PTPRM-205ENST00000577827 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP5.41□□□□□ -1.54
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PTPRM-205ENST00000577827 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.4□□□□□ -1.54
PTPRM-205ENST00000577827 P0C880 135 aa5.38□□□□□ -1.55
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PTPRM-205ENST00000577827 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
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PTPRM-205ENST00000577827 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa5.23□□□□□ -1.57
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PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP12-2P59991 146 aa5.17□□□□□ -1.58
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PTPRM-205ENST00000577827 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
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PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.94□□□□□ -1.62
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PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
PTPRM-205ENST00000577827 MT1HL1P0DM35 61 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRM-205ENST00000577827 AKAP9Q99996 3911 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRM-205ENST00000577827 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRM-205ENST00000577827 INE1O15225 51 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRM-205ENST00000577827 DNAH9Q9NYC9 4486 aa4.62□□□□□ -1.67
PTPRM-205ENST00000577827 DNAH1Q9P2D7 4330 aa4.58□□□□□ -1.68
PTPRM-205ENST00000577827 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.57□□□□□ -1.68
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