RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000568693.1

E2F4-211, Transcript of E2F transcription factor 4, human

TSL 2

Gene E2F4, Length 596 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
E2F4-211	ENST00000568693	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
E2F4-211	ENST00000568693	SS18L2	Q9UHA2	77 aa		4.79	□□□□□ -1.64
E2F4-211	ENST00000568693	MT1HL1	P0DM35	61 aa		4.78	□□□□□ -1.64
E2F4-211	ENST00000568693		Q5XG85	94 aa		4.78	□□□□□ -1.64
E2F4-211	ENST00000568693	LIMD2	Q9BT23	127 aa		4.78	□□□□□ -1.64
E2F4-211	ENST00000568693		Q6ZVQ6	151 aa		4.77	□□□□□ -1.65
E2F4-211	ENST00000568693	IGKV3D-7	A0A0C4DH55	119 aa		4.76	□□□□□ -1.65
E2F4-211	ENST00000568693	ASB16-AS1	Q495Z4	193 aa		4.76	□□□□□ -1.65
E2F4-211	ENST00000568693	NREP	Q16612	68 aa		4.75	□□□□□ -1.65
E2F4-211	ENST00000568693	FAM236A	A0A1B0GUQ0	79 aa		4.74	□□□□□ -1.65
E2F4-211	ENST00000568693	FAM236B	A0A1B0GV22	79 aa		4.74	□□□□□ -1.65
E2F4-211	ENST00000568693	KRTAP9-2	Q9BYQ4	174 aa		4.74	□□□□□ -1.65
E2F4-211	ENST00000568693	HMCN2	Q8NDA2	5059 aa		4.73	□□□□□ -1.65
E2F4-211	ENST00000568693	HIST1H4A	P62805	103 aa	Known RBP	4.73	□□□□□ -1.65
E2F4-211	ENST00000568693	CXCL6	P80162	114 aa		4.73	□□□□□ -1.65
E2F4-211	ENST00000568693		Q96NJ1	140 aa		4.73	□□□□□ -1.65
E2F4-211	ENST00000568693	ANAPC13	Q9BS18	74 aa		4.73	□□□□□ -1.65
E2F4-211	ENST00000568693	LINC00472	Q9H8W2	130 aa		4.73	□□□□□ -1.65
E2F4-211	ENST00000568693		J3KT08	172 aa		4.71	□□□□□ -1.66
E2F4-211	ENST00000568693	BPY2	O14599	106 aa		4.71	□□□□□ -1.66
E2F4-211	ENST00000568693	KRTAP9-1	A8MXZ3	250 aa	Predicted RBP	4.7	□□□□□ -1.66
E2F4-211	ENST00000568693	ATOX1	O00244	68 aa		4.7	□□□□□ -1.66
E2F4-211	ENST00000568693	C1orf195	Q5TG92	126 aa		4.7	□□□□□ -1.66
E2F4-211	ENST00000568693		A0A087WVE0	104 aa		4.69	□□□□□ -1.66
E2F4-211	ENST00000568693	KRTAP9-6	A0A140TA67	174 aa		4.69	□□□□□ -1.66
E2F4-211	ENST00000568693	DEFB116	Q30KQ4	102 aa		4.69	□□□□□ -1.66
E2F4-211	ENST00000568693	KRTAP9-7	A8MTY7	169 aa		4.68	□□□□□ -1.66
E2F4-211	ENST00000568693	IGKV4-1	P06312	121 aa		4.68	□□□□□ -1.66
E2F4-211	ENST00000568693	UBR4	Q5T4S7	5183 aa		4.67	□□□□□ -1.66
E2F4-211	ENST00000568693		A8MWP4	228 aa		4.67	□□□□□ -1.66
E2F4-211	ENST00000568693	DSCR10	P59022	87 aa		4.67	□□□□□ -1.66
E2F4-211	ENST00000568693	LCE4A	Q5TA78	99 aa		4.66	□□□□□ -1.66
E2F4-211	ENST00000568693		K7EQZ3	153 aa		4.65	□□□□□ -1.67
E2F4-211	ENST00000568693	NDUFB1	O75438	58 aa		4.65	□□□□□ -1.67
E2F4-211	ENST00000568693	FP248	Q71RG6	208 aa	Predicted RBP	4.65	□□□□□ -1.67
E2F4-211	ENST00000568693	RETNLB	Q9BQ08	111 aa		4.65	□□□□□ -1.67
E2F4-211	ENST00000568693		A0A1B0GVX0	72 aa		4.64	□□□□□ -1.67
E2F4-211	ENST00000568693	PRR15	Q8IV56	129 aa		4.64	□□□□□ -1.67
E2F4-211	ENST00000568693		Q8N9L7	120 aa		4.64	□□□□□ -1.67
E2F4-211	ENST00000568693	LCE3B	Q5TA77	95 aa		4.63	□□□□□ -1.67
E2F4-211	ENST00000568693	CCDC179	H3BU77	68 aa		4.62	□□□□□ -1.67
E2F4-211	ENST00000568693	UQCRQ	O14949	82 aa		4.62	□□□□□ -1.67
E2F4-211	ENST00000568693	COX7C	P15954	63 aa		4.62	□□□□□ -1.67
E2F4-211	ENST00000568693	SERP2	Q8N6R1	65 aa		4.62	□□□□□ -1.67
E2F4-211	ENST00000568693	IGHV6-1	A0A0B4J1U7	121 aa		4.61	□□□□□ -1.67
E2F4-211	ENST00000568693	C8orf87	E5RJ46	101 aa		4.61	□□□□□ -1.67
E2F4-211	ENST00000568693	SMIM20	Q8N5G0	67 aa		4.61	□□□□□ -1.67
E2F4-211	ENST00000568693	TRAV7	A0A075B6U4	112 aa		4.59	□□□□□ -1.67
E2F4-211	ENST00000568693	MMP24-AS1	A0A0U1RRL7	71 aa		4.59	□□□□□ -1.67
E2F4-211	ENST00000568693	C8orf17	Q9NRJ1	99 aa		4.59	□□□□□ -1.67
E2F4-211	ENST00000568693	IGLV7-46	A0A075B6I9	117 aa		4.58	□□□□□ -1.68
E2F4-211	ENST00000568693		A0A0A0MQY5	61 aa		4.58	□□□□□ -1.68
E2F4-211	ENST00000568693	HCG22	E2RYF7	251 aa		4.58	□□□□□ -1.68
E2F4-211	ENST00000568693	PRR4	Q16378	134 aa		4.58	□□□□□ -1.68
E2F4-211	ENST00000568693	LINC00313	P59037	77 aa		4.57	□□□□□ -1.68
E2F4-211	ENST00000568693	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.57	□□□□□ -1.68
E2F4-211	ENST00000568693	hDV103S1	A0JD37	113 aa		4.56	□□□□□ -1.68
E2F4-211	ENST00000568693	TPRXL	Q17RH7	258 aa		4.56	□□□□□ -1.68
E2F4-211	ENST00000568693	CASC2	Q6XLA1	102 aa		4.56	□□□□□ -1.68
E2F4-211	ENST00000568693	RNF213	Q63HN8	5207 aa		4.56	□□□□□ -1.68
E2F4-211	ENST00000568693	C9orf92	A6NGG3	77 aa		4.55	□□□□□ -1.68
E2F4-211	ENST00000568693	KRTAP16-1	A8MUX0	517 aa		4.55	□□□□□ -1.68
E2F4-211	ENST00000568693	KRTAP13-3	Q3SY46	172 aa		4.55	□□□□□ -1.68
E2F4-211	ENST00000568693	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		4.55	□□□□□ -1.68
E2F4-211	ENST00000568693	TMEM254	Q8TBM7	123 aa		4.55	□□□□□ -1.68
E2F4-211	ENST00000568693	LRP2	P98164	4655 aa		4.55	□□□□□ -1.68
E2F4-211	ENST00000568693	OCR1	Q9BZK8	76 aa		4.54	□□□□□ -1.68
E2F4-211	ENST00000568693	MRPL34	Q9BQ48	92 aa	Known RBP	4.53	□□□□□ -1.68
E2F4-211	ENST00000568693	C20orf197	Q8N268	126 aa		4.51	□□□□□ -1.69
E2F4-211	ENST00000568693		Q8N9P0	234 aa	Predicted RBP	4.51	□□□□□ -1.69
E2F4-211	ENST00000568693	C20orf166-AS1	Q96NR2	134 aa		4.51	□□□□□ -1.69
E2F4-211	ENST00000568693	LPA	P08519	4548 aa		4.5	□□□□□ -1.69
E2F4-211	ENST00000568693	KLKP1	Q107X0	134 aa		4.5	□□□□□ -1.69
E2F4-211	ENST00000568693	KRTAP9-9	Q9BYP9	154 aa		4.5	□□□□□ -1.69
E2F4-211	ENST00000568693	KRTAP9-4	Q9BYQ2	154 aa		4.5	□□□□□ -1.69
E2F4-211	ENST00000568693		A8MUU9	505 aa		4.49	□□□□□ -1.69
E2F4-211	ENST00000568693		Q75L30	129 aa		4.49	□□□□□ -1.69
E2F4-211	ENST00000568693	CYSTM1	Q9H1C7	97 aa		4.49	□□□□□ -1.69
E2F4-211	ENST00000568693	NDUFS5	O43920	106 aa		4.48	□□□□□ -1.69
E2F4-211	ENST00000568693	TMEM258	P61165	79 aa		4.48	□□□□□ -1.69
E2F4-211	ENST00000568693	KRTAP15-1	Q3LI76	137 aa		4.48	□□□□□ -1.69
E2F4-211	ENST00000568693	KRTAP9-3	Q9BYQ3	159 aa		4.48	□□□□□ -1.69
E2F4-211	ENST00000568693	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		4.48	□□□□□ -1.69
E2F4-211	ENST00000568693		A0A0U1RQV1	116 aa		4.46	□□□□□ -1.7
E2F4-211	ENST00000568693	NDUFC1	O43677	76 aa		4.46	□□□□□ -1.7
E2F4-211	ENST00000568693	RPL37	P61927	97 aa	Known RBP	4.46	□□□□□ -1.7
E2F4-211	ENST00000568693	MPLKIP	Q8TAP9	179 aa		4.46	□□□□□ -1.7
E2F4-211	ENST00000568693	SNURF	Q9Y675	71 aa		4.45	□□□□□ -1.7
E2F4-211	ENST00000568693		H7BZZ5	65 aa		4.44	□□□□□ -1.7
E2F4-211	ENST00000568693	C5orf47	Q569G3	176 aa		4.44	□□□□□ -1.7
E2F4-211	ENST00000568693	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	4.43	□□□□□ -1.7
E2F4-211	ENST00000568693	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		4.42	□□□□□ -1.7
E2F4-211	ENST00000568693	FAM236D	A0A1B0GTK5	79 aa		4.42	□□□□□ -1.7
E2F4-211	ENST00000568693	FAM236C	P0DP71	79 aa		4.42	□□□□□ -1.7
E2F4-211	ENST00000568693	MP68	P56378	58 aa		4.42	□□□□□ -1.7
E2F4-211	ENST00000568693		H3BPC8	53 aa		4.41	□□□□□ -1.7
E2F4-211	ENST00000568693	ATP5E	P56381	51 aa	Predicted RBP	4.41	□□□□□ -1.7
E2F4-211	ENST00000568693		Q5W150	140 aa		4.41	□□□□□ -1.7
E2F4-211	ENST00000568693	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		4.41	□□□□□ -1.7
E2F4-211	ENST00000568693		H0Y9P7	68 aa		4.4	□□□□□ -1.71

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