RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 TPRXLQ17RH7 258 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRB-208ENST00000550358 PP632Q6XCG6 107 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRB-208ENST00000550358 ATRQ13535 2644 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRB-208ENST00000550358 ATMQ13315 3056 aa4.66□□□□□ -1.66
PTPRB-208ENST00000550358 A6NN06 94 aa4.65□□□□□ -1.67
PTPRB-208ENST00000550358 TNP1P09430 55 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-208ENST00000550358 STAB1Q9NY15 2570 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-208ENST00000550358 H3BS24 57 aa4.64□□□□□ -1.67
PTPRB-208ENST00000550358 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa4.63□□□□□ -1.67
PTPRB-208ENST00000550358 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP4.62□□□□□ -1.67
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PTPRB-208ENST00000550358 COL12A1Q99715 3063 aa4.59□□□□□ -1.67
PTPRB-208ENST00000550358 XP32Q5T750 250 aa4.59□□□□□ -1.67
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PTPRB-208ENST00000550358 COL6A5A8TX70 2615 aa4.56□□□□□ -1.68
PTPRB-208ENST00000550358 MYO15AQ9UKN7 3530 aa4.55□□□□□ -1.68
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PTPRB-208ENST00000550358 DMDP11532 3685 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRB-208ENST00000550358 TACC2O95359 2948 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRB-208ENST00000550358 A8MU10 97 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRB-208ENST00000550358 ZANQ9Y493 2812 aa4.52□□□□□ -1.69
PTPRB-208ENST00000550358 DNAH14Q0VDD8 3507 aa4.51□□□□□ -1.69
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PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.5□□□□□ -1.69
PTPRB-208ENST00000550358 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.49□□□□□ -1.69
PTPRB-208ENST00000550358 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.48□□□□□ -1.69
PTPRB-208ENST00000550358 LOC400499M0QZD8 3231 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRB-208ENST00000550358 A0A1B0GVY2 172 aa4.47□□□□□ -1.69
PTPRB-208ENST00000550358 DCHS2Q6V1P9 2916 aa4.47□□□□□ -1.69
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PTPRB-208ENST00000550358 ZFHX4Q86UP3 3567 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRB-208ENST00000550358 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa4.44□□□□□ -1.7
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP10-8P60410 259 aa4.43□□□□□ -1.7
PTPRB-208ENST00000550358 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP4.4□□□□□ -1.71
PTPRB-208ENST00000550358 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa4.39□□□□□ -1.71
PTPRB-208ENST00000550358 FBN3Q75N90 2809 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRB-208ENST00000550358 BSNQ9UPA5 3926 aa4.38□□□□□ -1.71
PTPRB-208ENST00000550358 H0YAA0 97 aa4.37□□□□□ -1.71
PTPRB-208ENST00000550358 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP4.36□□□□□ -1.71
PTPRB-208ENST00000550358 TENM1Q9UKZ4 2725 aa4.36□□□□□ -1.71
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP10-10P60014 251 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRB-208ENST00000550358 NOTCH1P46531 2555 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRB-208ENST00000550358 C10orf95Q9H7T3 257 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRB-208ENST00000550358 DNHD1Q96M86 4753 aa4.33□□□□□ -1.72
PTPRB-208ENST00000550358 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa4.32□□□□□ -1.72
PTPRB-208ENST00000550358 STAB2Q8WWQ8 2551 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRB-208ENST00000550358 P0C880 135 aa4.3□□□□□ -1.72
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PTPRB-208ENST00000550358 LAMA5O15230 3695 aa4.29□□□□□ -1.72
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PTPRB-208ENST00000550358 VWFP04275 2813 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRB-208ENST00000550358 AKAP9Q99996 3911 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRB-208ENST00000550358 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRB-208ENST00000550358 TENM3Q9P273 2699 aa4.15□□□□□ -1.74
PTPRB-208ENST00000550358 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa4.15□□□□□ -1.75
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PTPRB-208ENST00000550358 RYR2Q92736 4967 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP12-1P59990 96 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP12-2P59991 146 aa4.06□□□□□ -1.76
PTPRB-208ENST00000550358 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.06□□□□□ -1.76
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PTPRB-208ENST00000550358 DNAH9Q9NYC9 4486 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRB-208ENST00000550358 CSMD2Q7Z408 3487 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRB-208ENST00000550358 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP3.95□□□□□ -1.78
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PTPRB-208ENST00000550358 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP3.93□□□□□ -1.78
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PTPRB-208ENST00000550358 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP3.92□□□□□ -1.78
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRB-208ENST00000550358 TGP01266 2768 aa3.91□□□□□ -1.78
PTPRB-208ENST00000550358 DYNC2H1Q8NCM8 4307 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP3.89□□□□□ -1.79
PTPRB-208ENST00000550358 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.89□□□□□ -1.79
PTPRB-208ENST00000550358 HERC2O95714 4834 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRB-208ENST00000550358 ZFHX3Q15911 3703 aa3.87□□□□□ -1.79
PTPRB-208ENST00000550358 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.87□□□□□ -1.79
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