RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000546160.5

PDE4D-226, Transcript of phosphodiesterase 4D, humanhuman

TSL 5 BASIC

Gene PDE4D, Length 7,690 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4D-226ENST00000546160 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-226ENST00000546160 SPATA8Q6RVD6 105 aa3.61□□□□□ -1.83
PDE4D-226ENST00000546160 TACC2O95359 2948 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-226ENST00000546160 ZZEF1O43149 2961 aa3.6□□□□□ -1.83
PDE4D-226ENST00000546160 NBEAQ8NFP9 2946 aa3.59□□□□□ -1.83
PDE4D-226ENST00000546160 COL12A1Q99715 3063 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-226ENST00000546160 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-226ENST00000546160 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-226ENST00000546160 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.58□□□□□ -1.84
PDE4D-226ENST00000546160 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-226ENST00000546160 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-226ENST00000546160 DMXL1Q9Y485 3027 aa3.57□□□□□ -1.84
PDE4D-226ENST00000546160 PRAC1Q96KF2 57 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-226ENST00000546160 ATMQ13315 3056 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-226ENST00000546160 FLNCQ14315 2725 aa3.56□□□□□ -1.84
PDE4D-226ENST00000546160 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-226ENST00000546160 HIVEP1P15822 2718 aa3.55□□□□□ -1.84
PDE4D-226ENST00000546160 EYSQ5T1H1 3165 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-226ENST00000546160 TNP1P09430 55 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-226ENST00000546160 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa3.54□□□□□ -1.84
PDE4D-226ENST00000546160 CELSR2Q9HCU4 2923 aa3.52□□□□□ -1.85
PDE4D-226ENST00000546160 LOC400499M0QZD8 3231 aa3.51□□□□□ -1.85
PDE4D-226ENST00000546160 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-226ENST00000546160 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-226ENST00000546160 TPRXLQ17RH7 258 aa3.5□□□□□ -1.85
PDE4D-226ENST00000546160 TENM1Q9UKZ4 2725 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-226ENST00000546160 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-226ENST00000546160 ASPMQ8IZT6 3477 aa3.49□□□□□ -1.85
PDE4D-226ENST00000546160 PP632Q6XCG6 107 aa3.48□□□□□ -1.85
PDE4D-226ENST00000546160 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP3.47□□□□□ -1.85
PDE4D-226ENST00000546160 H3BS24 57 aa3.46□□□□□ -1.86
PDE4D-226ENST00000546160 DCHS2Q6V1P9 2916 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-226ENST00000546160 XP32Q5T750 250 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-226ENST00000546160 PRO2289Q9P1D8 64 aa3.45□□□□□ -1.86
PDE4D-226ENST00000546160 TENM4Q6N022 2769 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-226ENST00000546160 A6NN06 94 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-226ENST00000546160 A8MU10 97 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-226ENST00000546160 NF1P21359 2839 aa3.44□□□□□ -1.86
PDE4D-226ENST00000546160 ZANQ9Y493 2812 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-226ENST00000546160 MYO15AQ9UKN7 3530 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-226ENST00000546160 FBN2P35556 2912 aa3.43□□□□□ -1.86
PDE4D-226ENST00000546160 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.42□□□□□ -1.86
PDE4D-226ENST00000546160 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa3.41□□□□□ -1.86
PDE4D-226ENST00000546160 DCHS1Q96JQ0 3298 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-226ENST00000546160 LAMA5O15230 3695 aa3.39□□□□□ -1.87
PDE4D-226ENST00000546160 KRTAP10-8P60410 259 aa3.38□□□□□ -1.87
PDE4D-226ENST00000546160 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.35□□□□□ -1.87
PDE4D-226ENST00000546160 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.34□□□□□ -1.87
PDE4D-226ENST00000546160 KRTAP10-10P60014 251 aa3.34□□□□□ -1.88
PDE4D-226ENST00000546160 MXRA5Q9NR99 2828 aa3.33□□□□□ -1.88
PDE4D-226ENST00000546160 BSNQ9UPA5 3926 aa3.31□□□□□ -1.88
PDE4D-226ENST00000546160 TGP01266 2768 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-226ENST00000546160 A0A1B0GVY2 172 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-226ENST00000546160 TENM2Q9NT68 2774 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-226ENST00000546160 CSMD1Q96PZ7 3565 aa3.3□□□□□ -1.88
PDE4D-226ENST00000546160 TENM3Q9P273 2699 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-226ENST00000546160 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-226ENST00000546160 RELNP78509 3460 aa3.29□□□□□ -1.88
PDE4D-226ENST00000546160 H0YAA0 97 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-226ENST00000546160 ZFHX4Q86UP3 3567 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-226ENST00000546160 NDUFAF8A1L188 74 aa3.28□□□□□ -1.88
PDE4D-226ENST00000546160 ZFHX3Q15911 3703 aa3.26□□□□□ -1.89
PDE4D-226ENST00000546160 DMDP11532 3685 aa3.25□□□□□ -1.89
PDE4D-226ENST00000546160 P0C880 135 aa3.23□□□□□ -1.89
PDE4D-226ENST00000546160 PDZD2O15018 2839 aa3.23□□□□□ -1.89
PDE4D-226ENST00000546160 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP3.21□□□□□ -1.9
PDE4D-226ENST00000546160 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-226ENST00000546160 AKAP9Q99996 3911 aa3.19□□□□□ -1.9
PDE4D-226ENST00000546160 VPS13CQ709C8 3753 aa3.17□□□□□ -1.9
PDE4D-226ENST00000546160 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-226ENST00000546160 VWFP04275 2813 aa3.16□□□□□ -1.9
PDE4D-226ENST00000546160 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-226ENST00000546160 COL7A1Q02388 2944 aa3.14□□□□□ -1.91
PDE4D-226ENST00000546160 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP3.11□□□□□ -1.91
PDE4D-226ENST00000546160 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa3.09□□□□□ -1.91
PDE4D-226ENST00000546160 KRTAP12-2P59991 146 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-226ENST00000546160 ALMS1Q8TCU4 4167 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-226ENST00000546160 SVEP1Q4LDE5 3571 aa3.08□□□□□ -1.92
PDE4D-226ENST00000546160 MUC3AQ02505 3323 aa3.07□□□□□ -1.92
PDE4D-226ENST00000546160 KRTAP12-1P59990 96 aa3.06□□□□□ -1.92
PDE4D-226ENST00000546160 FBN3Q75N90 2809 aa3.04□□□□□ -1.92
PDE4D-226ENST00000546160 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP3.02□□□□□ -1.93
PDE4D-226ENST00000546160 OTOGQ6ZRI0 2925 aa3.02□□□□□ -1.93
PDE4D-226ENST00000546160 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PDE4D-226ENST00000546160 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP3.01□□□□□ -1.93
PDE4D-226ENST00000546160 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-226ENST00000546160 DNAH1Q9P2D7 4330 aa2.99□□□□□ -1.93
PDE4D-226ENST00000546160 RYR1P21817 5038 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-226ENST00000546160 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-226ENST00000546160 CSMD2Q7Z408 3487 aa2.98□□□□□ -1.93
PDE4D-226ENST00000546160 DNAH3Q8TD57 4116 aa2.96□□□□□ -1.94
PDE4D-226ENST00000546160 CMYA5Q8N3K9 4069 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-226ENST00000546160 MT1HL1P0DM35 61 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-226ENST00000546160 CUBNO60494 3623 aa2.94□□□□□ -1.94
PDE4D-226ENST00000546160 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP2.92□□□□□ -1.94
PDE4D-226ENST00000546160 DNAH7Q8WXX0 4024 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-226ENST00000546160 KRTAP23-1A1A580 65 aa2.91□□□□□ -1.94
PDE4D-226ENST00000546160 KRTAP10-12P60413 245 aa2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-226ENST00000546160 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP2.9□□□□□ -1.95
PDE4D-226ENST00000546160 CSMD3Q7Z407 3707 aa2.89□□□□□ -1.95
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