RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000541434.5

CADM1-211, Transcript of cell adhesion molecule 1, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene CADM1, Length 1,112 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Nucleus .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CADM1-211ENST00000541434 LINC00643Q86TS7 51 aa8.71□□□□□ -1.02
CADM1-211ENST00000541434 CXCL6P80162 114 aa8.7□□□□□ -1.02
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.7□□□□□ -1.02
CADM1-211ENST00000541434 PRR15Q8IV56 129 aa8.7□□□□□ -1.02
CADM1-211ENST00000541434 CDIP1Q9H305 208 aa8.7□□□□□ -1.02
CADM1-211ENST00000541434 C9orf92A6NGG3 77 aa8.69□□□□□ -1.02
CADM1-211ENST00000541434 TPRXLQ17RH7 258 aa8.69□□□□□ -1.02
CADM1-211ENST00000541434 K7EQZ3 153 aa8.68□□□□□ -1.02
CADM1-211ENST00000541434 LINC00313P59037 77 aa8.68□□□□□ -1.02
CADM1-211ENST00000541434 Q8N9L7 120 aa8.67□□□□□ -1.02
CADM1-211ENST00000541434 ATP5EP2Q5VTU8 51 aa8.66□□□□□ -1.02
CADM1-211ENST00000541434 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa8.66□□□□□ -1.02
CADM1-211ENST00000541434 C8orf87E5RJ46 101 aa8.65□□□□□ -1.02
CADM1-211ENST00000541434 HMCN2Q8NDA2 5059 aa8.63□□□□□ -1.03
CADM1-211ENST00000541434 C8orf17Q9NRJ1 99 aa8.63□□□□□ -1.03
CADM1-211ENST00000541434 LPAP08519 4548 aa8.62□□□□□ -1.03
CADM1-211ENST00000541434 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.58□□□□□ -1.04
CADM1-211ENST00000541434 HIST1H4AP62805 103 aaKnown RBP8.58□□□□□ -1.04
CADM1-211ENST00000541434 XP32Q5T750 250 aa8.58□□□□□ -1.04
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.57□□□□□ -1.04
CADM1-211ENST00000541434 hDV103S1A0JD37 113 aa8.55□□□□□ -1.04
CADM1-211ENST00000541434 HCG22E2RYF7 251 aa8.54□□□□□ -1.04
CADM1-211ENST00000541434 MT-ATP8P03928 68 aa8.54□□□□□ -1.04
CADM1-211ENST00000541434 WFDC13Q8IUB5 93 aa8.54□□□□□ -1.04
CADM1-211ENST00000541434 CASC2Q6XLA1 102 aa8.53□□□□□ -1.04
CADM1-211ENST00000541434 TMEM254Q8TBM7 123 aa8.53□□□□□ -1.04
CADM1-211ENST00000541434 LRP2P98164 4655 aa8.52□□□□□ -1.05
CADM1-211ENST00000541434 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP8.52□□□□□ -1.05
CADM1-211ENST00000541434 A8MUU9 505 aa8.51□□□□□ -1.05
CADM1-211ENST00000541434 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.51□□□□□ -1.05
CADM1-211ENST00000541434 A0A087WVE0 104 aa8.5□□□□□ -1.05
CADM1-211ENST00000541434 Q75L30 129 aa8.5□□□□□ -1.05
CADM1-211ENST00000541434 IMUPQ9GZP8 106 aa8.49□□□□□ -1.05
CADM1-211ENST00000541434 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
CADM1-211ENST00000541434 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
CADM1-211ENST00000541434 NDUFS5O43920 106 aa8.45□□□□□ -1.06
CADM1-211ENST00000541434 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.43□□□□□ -1.06
CADM1-211ENST00000541434 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa8.43□□□□□ -1.06
CADM1-211ENST00000541434 PCOTHQ58A44 107 aa8.4□□□□□ -1.06
CADM1-211ENST00000541434 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP8.36□□□□□ -1.07
CADM1-211ENST00000541434 MUC17Q685J3 4493 aa8.35□□□□□ -1.07
CADM1-211ENST00000541434 SCGB1A1P11684 91 aa8.35□□□□□ -1.07
CADM1-211ENST00000541434 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa8.35□□□□□ -1.07
CADM1-211ENST00000541434 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa8.31□□□□□ -1.08
CADM1-211ENST00000541434 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa8.31□□□□□ -1.08
CADM1-211ENST00000541434 Q5W150 140 aa8.31□□□□□ -1.08
CADM1-211ENST00000541434 UQCRQO14949 82 aa8.28□□□□□ -1.08
CADM1-211ENST00000541434 UBR4Q5T4S7 5183 aa8.27□□□□□ -1.09
CADM1-211ENST00000541434 OCR1Q9BZK8 76 aa8.27□□□□□ -1.09
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa8.25□□□□□ -1.09
CADM1-211ENST00000541434 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
CADM1-211ENST00000541434 ATOX1O00244 68 aa8.21□□□□□ -1.1
CADM1-211ENST00000541434 SMIM20Q8N5G0 67 aa8.21□□□□□ -1.1
CADM1-211ENST00000541434 TRAV22A0A0B4J277 110 aa8.2□□□□□ -1.1
CADM1-211ENST00000541434 SPINK7P58062 85 aa8.2□□□□□ -1.1
CADM1-211ENST00000541434 C5orf47Q569G3 176 aa8.19□□□□□ -1.1
CADM1-211ENST00000541434 TRAV7A0A075B6U4 112 aa8.18□□□□□ -1.1
CADM1-211ENST00000541434 H0Y9P7 68 aa8.18□□□□□ -1.1
CADM1-211ENST00000541434 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa8.17□□□□□ -1.1
CADM1-211ENST00000541434 IGKV2-30P06310 120 aa8.17□□□□□ -1.1
CADM1-211ENST00000541434 RNF213Q63HN8 5207 aa8.16□□□□□ -1.1
CADM1-211ENST00000541434 MP68P56378 58 aa8.15□□□□□ -1.1
CADM1-211ENST00000541434 C7orf65Q6ZTY9 151 aa8.13□□□□□ -1.11
CADM1-211ENST00000541434 MUC2Q02817 5179 aa8.13□□□□□ -1.11
CADM1-211ENST00000541434 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa8.11□□□□□ -1.11
CADM1-211ENST00000541434 SERP2Q8N6R1 65 aa8.11□□□□□ -1.11
CADM1-211ENST00000541434 C1orf64Q8NEQ6 169 aa8.11□□□□□ -1.11
CADM1-211ENST00000541434 LINC00208Q96KT6 92 aa8.11□□□□□ -1.11
CADM1-211ENST00000541434 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa8.1□□□□□ -1.11
CADM1-211ENST00000541434 H3BPC8 53 aa8.09□□□□□ -1.11
CADM1-211ENST00000541434 HRES1P13985 223 aa8.08□□□□□ -1.12
CADM1-211ENST00000541434 ANAPC13Q9BS18 74 aa8.03□□□□□ -1.12
CADM1-211ENST00000541434 MPLKIPQ8TAP9 179 aa8.02□□□□□ -1.13
CADM1-211ENST00000541434 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa8.02□□□□□ -1.13
CADM1-211ENST00000541434 COX7CP15954 63 aa8.01□□□□□ -1.13
CADM1-211ENST00000541434 A0A0U1RQV1 116 aa8□□□□□ -1.13
CADM1-211ENST00000541434 C20orf197Q8N268 126 aa7.99□□□□□ -1.13
CADM1-211ENST00000541434 KLKP1Q107X0 134 aa7.98□□□□□ -1.13
CADM1-211ENST00000541434 C4orf26Q17RF5 130 aa7.98□□□□□ -1.13
CADM1-211ENST00000541434 SNURFQ9Y675 71 aa7.98□□□□□ -1.13
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP19-2Q3LHN2 52 aa7.96□□□□□ -1.14
CADM1-211ENST00000541434 COX6B2Q6YFQ2 88 aa7.96□□□□□ -1.14
CADM1-211ENST00000541434 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.95□□□□□ -1.14
CADM1-211ENST00000541434 FAM236CP0DP71 79 aa7.95□□□□□ -1.14
CADM1-211ENST00000541434 LCE2CQ5TA81 110 aa7.91□□□□□ -1.14
CADM1-211ENST00000541434 FAT4Q6V0I7 4981 aa7.88□□□□□ -1.15
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.87□□□□□ -1.15
CADM1-211ENST00000541434 CCDC179H3BU77 68 aa7.86□□□□□ -1.15
CADM1-211ENST00000541434 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa7.85□□□□□ -1.15
CADM1-211ENST00000541434 NDUFC1O43677 76 aa7.8□□□□□ -1.16
CADM1-211ENST00000541434 CYSTM1Q9H1C7 97 aa7.8□□□□□ -1.16
CADM1-211ENST00000541434 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP7.79□□□□□ -1.16
CADM1-211ENST00000541434 A8MUN3 132 aa7.78□□□□□ -1.16
CADM1-211ENST00000541434 MT1HP80294 61 aa7.77□□□□□ -1.17
CADM1-211ENST00000541434 H7BZZ5 65 aa7.76□□□□□ -1.17
CADM1-211ENST00000541434 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa7.76□□□□□ -1.17
CADM1-211ENST00000541434 DMAC1Q96GE9 116 aa7.74□□□□□ -1.17
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.72□□□□□ -1.17
CADM1-211ENST00000541434 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.72□□□□□ -1.17
CADM1-211ENST00000541434 M0R2T5 61 aa7.7□□□□□ -1.18
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 84 ms