RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000534348.5

NEDD8-MDP1-202, Transcript of NEDD8-MDP1 readthrough, humanhuman

APPRIS P1 TSL 5 BASIC

Gene NEDD8-MDP1, Length 595 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC01545Q5VT33 79 aa4.25□□□□□ -1.73
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MT1XP80297 61 aa4.24□□□□□ -1.73
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.23□□□□□ -1.73
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRACP01848 142 aa4.23□□□□□ -1.73
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 IGKV2-30P06310 120 aa4.23□□□□□ -1.73
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 RBM3P98179 157 aaKnown RBP4.23□□□□□ -1.73
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCE1DQ5T752 114 aa4.23□□□□□ -1.73
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCA10Q71F78 164 aa4.23□□□□□ -1.73
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 YPEL4Q96NS1 127 aa4.23□□□□□ -1.73
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNCGO76070 127 aa4.22□□□□□ -1.73
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 APOC3P02656 99 aa4.22□□□□□ -1.73
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CCKP06307 115 aa4.22□□□□□ -1.73
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C4orf26Q17RF5 130 aa4.22□□□□□ -1.73
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CSAG1Q6PB30 78 aa4.22□□□□□ -1.73
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP5-10Q6L8G5 202 aa4.2□□□□□ -1.74
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PET117Q6UWS5 81 aa4.2□□□□□ -1.74
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRR15Q8IV56 129 aa4.2□□□□□ -1.74
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 S4R3F8 94 aa4.2□□□□□ -1.74
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP12-2P59991 146 aa4.19□□□□□ -1.74
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 VPS25Q9BRG1 176 aa4.19□□□□□ -1.74
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.19□□□□□ -1.74
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ATOH7Q8N100 152 aa4.18□□□□□ -1.74
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFB1O75438 58 aa4.17□□□□□ -1.74
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SNAPINO95295 136 aa4.17□□□□□ -1.74
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MT4P47944 62 aa4.16□□□□□ -1.74
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q6ZVQ6 151 aa4.16□□□□□ -1.74
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SPRR5A0A1B0GTR4 108 aa4.14□□□□□ -1.75
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H0YGX0 51 aa4.14□□□□□ -1.75
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 J3KT08 172 aa4.14□□□□□ -1.75
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTDAPP60985 99 aa4.14□□□□□ -1.75
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.14□□□□□ -1.75
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C2orf91Q6ZV80 131 aa4.14□□□□□ -1.75
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 SVBPQ8N300 66 aa4.14□□□□□ -1.75
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CRIPTQ9P021 101 aa4.14□□□□□ -1.75
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFS5O43920 106 aa4.13□□□□□ -1.75
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NDUFA5Q16718 116 aa4.11□□□□□ -1.75
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP5-7Q6L8G8 165 aa4.1□□□□□ -1.75
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.1□□□□□ -1.75
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PLAC4Q8WY50 150 aa4.09□□□□□ -1.75
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP10-7P60409 375 aaPredicted RBP4.08□□□□□ -1.76
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q5W150 140 aa4.08□□□□□ -1.76
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.08□□□□□ -1.76
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST1H4GQ99525 98 aa4.06□□□□□ -1.76
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ORMDL1Q9P0S3 153 aa4.06□□□□□ -1.76
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A1B0GX51 115 aa4.05□□□□□ -1.76
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 K7EQZ3 153 aa4.04□□□□□ -1.76
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 DNAL4O96015 105 aa4.04□□□□□ -1.76
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.04□□□□□ -1.76
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.03□□□□□ -1.76
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.02□□□□□ -1.77
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A8MUN3 132 aa4.02□□□□□ -1.77
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa4.02□□□□□ -1.77
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 Q6ZQT0 140 aa4.02□□□□□ -1.77
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.02□□□□□ -1.77
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PDE6GP18545 87 aa4.01□□□□□ -1.77
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 hDV103S1A0JD37 113 aa4□□□□□ -1.77
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST1H2BJP06899 126 aa4□□□□□ -1.77
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST1H2BOP23527 126 aa4□□□□□ -1.77
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST1H2BBP33778 126 aa4□□□□□ -1.77
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST1H2BDP58876 126 aa4□□□□□ -1.77
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST1H2BCP62807 126 aa4□□□□□ -1.77
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST2H2BEQ16778 126 aa4□□□□□ -1.77
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST2H2BFQ5QNW6 126 aaPredicted RBP4□□□□□ -1.77
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST1H2BHQ93079 126 aa4□□□□□ -1.77
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST1H2BNQ99877 126 aa4□□□□□ -1.77
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HIST1H2BMQ99879 126 aa4□□□□□ -1.77
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCE4AQ5TA78 99 aa3.99□□□□□ -1.77
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa3.98□□□□□ -1.77
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H3BQ85 93 aa3.97□□□□□ -1.77
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TRIAP1O43715 76 aa3.97□□□□□ -1.77
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LCE5AQ5TCM9 118 aa3.96□□□□□ -1.78
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A0A0B4J2C4 111 aa3.95□□□□□ -1.78
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C9JAW5 83 aa3.95□□□□□ -1.78
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 UBE2V1Q13404 147 aa3.95□□□□□ -1.78
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa3.94□□□□□ -1.78
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP4-6Q9BYQ5 205 aa3.94□□□□□ -1.78
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NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PRO1854Q9UHT4 67 aa3.91□□□□□ -1.78
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 HCG22E2RYF7 251 aa3.9□□□□□ -1.79
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CEND1Q8N111 149 aa3.9□□□□□ -1.79
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa3.89□□□□□ -1.79
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 A6NJY4 79 aa3.89□□□□□ -1.79
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 PSMB2P49721 201 aa3.89□□□□□ -1.79
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 ADM2Q7Z4H4 148 aa3.89□□□□□ -1.79
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 KRTAP19-3Q7Z4W3 81 aa3.88□□□□□ -1.79
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CYSTM1Q9H1C7 97 aa3.88□□□□□ -1.79
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 NREPQ16612 68 aa3.87□□□□□ -1.79
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 H0YAA0 97 aa3.85□□□□□ -1.79
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COX8AP10176 69 aa3.83□□□□□ -1.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 LINC01554Q52M75 96 aa3.83□□□□□ -1.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CXCL6P80162 114 aa3.82□□□□□ -1.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COA6Q5JTJ3 125 aaKnown RBP3.82□□□□□ -1.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 CASC2Q6XLA1 102 aa3.82□□□□□ -1.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 R4GN34 69 aa3.82□□□□□ -1.8
NEDD8-MDP1-202ENST00000534348 COX6CP09669 75 aa3.81□□□□□ -1.8
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