RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000513533.1

HOXC-AS2-201, HOXC cluster antisense RNA 2, humanhuman

TSL 2 BASIC

Gene HOXC-AS2, Length 504 nt, Biotype antisense RNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RYR1P21817 5038 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.95□□□□□ -1.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HSPG2P98160 4391 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa6.94□□□□□ -1.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PKHD1L1Q86WI1 4243 aa6.93□□□□□ -1.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAT1Q14517 4588 aa6.93□□□□□ -1.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NDUFS5O43920 106 aa6.93□□□□□ -1.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COX7CP15954 63 aa6.93□□□□□ -1.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.93□□□□□ -1.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 UQCRQO14949 82 aa6.92□□□□□ -1.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 J3QL48 77 aa6.9□□□□□ -1.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C5orf47Q569G3 176 aa6.9□□□□□ -1.3
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MP68P56378 58 aa6.89□□□□□ -1.31
HOXC-AS2-201ENST00000513533 EPPK1P58107 5090 aaKnown RBP6.88□□□□□ -1.31
HOXC-AS2-201ENST00000513533 OCR1Q9BZK8 76 aa6.88□□□□□ -1.31
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRTAP17-1Q9BYP8 105 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KIAA1109Q2LD37 5005 aa6.87□□□□□ -1.31
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MT1HL1P0DM35 61 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RETNLBQ9BQ08 111 aa6.85□□□□□ -1.31
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
HOXC-AS2-201ENST00000513533 H3BPC8 53 aa6.84□□□□□ -1.31
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.82□□□□□ -1.32
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa6.82□□□□□ -1.32
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TRAV22A0A0B4J277 110 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXC-AS2-201ENST00000513533 NDUFC1O43677 76 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C20orf197Q8N268 126 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.81□□□□□ -1.32
HOXC-AS2-201ENST00000513533 H0Y9P7 68 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PRR4Q16378 134 aa6.8□□□□□ -1.32
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.8□□□□□ -1.32
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CCDC179H3BU77 68 aa6.79□□□□□ -1.32
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.78□□□□□ -1.32
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C9orf92A6NGG3 77 aa6.78□□□□□ -1.32
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KLKP1Q107X0 134 aa6.76□□□□□ -1.33
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LINC00208Q96KT6 92 aa6.75□□□□□ -1.33
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A0A0U1RQV1 116 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SNURFQ9Y675 71 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXC-AS2-201ENST00000513533 BIRC6Q9NR09 4857 aa6.73□□□□□ -1.33
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa6.72□□□□□ -1.33
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A8MUU9 505 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q75L30 129 aa6.71□□□□□ -1.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TNXBP22105 4242 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.7□□□□□ -1.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAT3Q8TDW7 4589 aa6.7□□□□□ -1.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP6.68□□□□□ -1.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TPRXLQ17RH7 258 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.68□□□□□ -1.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 TMEM258P61165 79 aa6.67□□□□□ -1.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP6.65□□□□□ -1.34
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q5W150 140 aa6.64□□□□□ -1.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 H7BZZ5 65 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RPL37P61927 97 aaKnown RBP6.62□□□□□ -1.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.62□□□□□ -1.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 IGKV2-30P06310 120 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 XP32Q5T750 250 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MYCBP2O75592 4640 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HERC2O95714 4834 aa6.61□□□□□ -1.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 FAM236CP0DP71 79 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa6.59□□□□□ -1.35
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PCOTHQ58A44 107 aa6.58□□□□□ -1.36
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CYSTM1Q9H1C7 97 aa6.56□□□□□ -1.36
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPINK7P58062 85 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ABCA13Q86UQ4 5058 aa6.52□□□□□ -1.37
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HRES1P13985 223 aa6.49□□□□□ -1.37
HOXC-AS2-201ENST00000513533 ACYP2P14621 99 aa6.46□□□□□ -1.38
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SERP1Q9Y6X1 66 aa6.46□□□□□ -1.38
HOXC-AS2-201ENST00000513533 A8MUN3 132 aa6.45□□□□□ -1.38
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RPS28P62857 69 aaKnown RBP6.44□□□□□ -1.38
HOXC-AS2-201ENST00000513533 DMAC1Q96GE9 116 aa6.4□□□□□ -1.38
HOXC-AS2-201ENST00000513533 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXC-AS2-201ENST00000513533 C4orf26Q17RF5 130 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXC-AS2-201ENST00000513533 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa6.39□□□□□ -1.39
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COX6B2Q6YFQ2 88 aa6.36□□□□□ -1.39
HOXC-AS2-201ENST00000513533 COA5Q86WW8 74 aa6.34□□□□□ -1.39
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SPTSSBQ8NFR3 76 aa6.34□□□□□ -1.39
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PCLOQ9Y6V0 5065 aa6.33□□□□□ -1.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SMIM26A0A096LP01 95 aa6.31□□□□□ -1.4
HOXC-AS2-201ENST00000513533 V9GYY9 64 aa6.27□□□□□ -1.41
HOXC-AS2-201ENST00000513533 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.24□□□□□ -1.41
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LPAP08519 4548 aa6.21□□□□□ -1.42
HOXC-AS2-201ENST00000513533 MPLKIPQ8TAP9 179 aa6.2□□□□□ -1.42
HOXC-AS2-201ENST00000513533 S4R3F8 94 aa6.2□□□□□ -1.42
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXC-AS2-201ENST00000513533 LRP2P98164 4655 aa6.19□□□□□ -1.42
HOXC-AS2-201ENST00000513533 SEC61GP60059 68 aa6.17□□□□□ -1.42
HOXC-AS2-201ENST00000513533 PRR15LQ9BU68 103 aa6.16□□□□□ -1.42
HOXC-AS2-201ENST00000513533 Q1T7F1 81 aa6.15□□□□□ -1.42
HOXC-AS2-201ENST00000513533 HERC1Q15751 4861 aa6.12□□□□□ -1.43
HOXC-AS2-201ENST00000513533 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa6.11□□□□□ -1.43
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 33.7 ms