RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000493468.6

PRPF40A-211, Transcript of pre-mRNA processing factor 40 homolog A, humanhuman

TSL 1 (best)

Gene PRPF40A, Length 1,043 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40A-211ENST00000493468 A0A1B0GX51 115 aa6.56□□□□□ -1.36
PRPF40A-211ENST00000493468 FABP2P12104 132 aa6.56□□□□□ -1.36
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PRPF40A-211ENST00000493468 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF40A-211ENST00000493468 KRTAP2-4Q9BYR9 128 aa6.55□□□□□ -1.36
PRPF40A-211ENST00000493468 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-211ENST00000493468 KRTAP4-2Q9BYR5 136 aa6.52□□□□□ -1.37
PRPF40A-211ENST00000493468 MT1BP07438 61 aa6.51□□□□□ -1.37
PRPF40A-211ENST00000493468 HIST1H4GQ99525 98 aa6.51□□□□□ -1.37
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PRPF40A-211ENST00000493468 A0A0B4J2C4 111 aa6.47□□□□□ -1.37
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PRPF40A-211ENST00000493468 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.45□□□□□ -1.38
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PRPF40A-211ENST00000493468 KRTAP5-3Q6L8H2 238 aa6.37□□□□□ -1.39
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PRPF40A-211ENST00000493468 PRO1854Q9UHT4 67 aa6.35□□□□□ -1.39
PRPF40A-211ENST00000493468 Q6ZVQ6 151 aa6.33□□□□□ -1.4
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PRPF40A-211ENST00000493468 HIGD1BQ9P298 99 aa6.33□□□□□ -1.4
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PRPF40A-211ENST00000493468 HIST3H2BBQ8N257 126 aa6.3□□□□□ -1.4
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PRPF40A-211ENST00000493468 IGKV2-30P06310 120 aa6.22□□□□□ -1.41
PRPF40A-211ENST00000493468 COX6CP09669 75 aa6.22□□□□□ -1.41
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PRPF40A-211ENST00000493468 KLKP1Q107X0 134 aa6.2□□□□□ -1.42
PRPF40A-211ENST00000493468 CSAG1Q6PB30 78 aa6.18□□□□□ -1.42
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PRPF40A-211ENST00000493468 LCE1AQ5T7P2 110 aa6.17□□□□□ -1.42
PRPF40A-211ENST00000493468 NDUFS5O43920 106 aa6.16□□□□□ -1.42
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PRPF40A-211ENST00000493468 PDE6GP18545 87 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-211ENST00000493468 VAMP8Q9BV40 100 aa6.07□□□□□ -1.44
PRPF40A-211ENST00000493468 K7EQZ3 153 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-211ENST00000493468 HSD52Q0P140 79 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-211ENST00000493468 NREPQ16612 68 aa6.06□□□□□ -1.44
PRPF40A-211ENST00000493468 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.04□□□□□ -1.44
PRPF40A-211ENST00000493468 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.03□□□□□ -1.44
PRPF40A-211ENST00000493468 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6□□□□□ -1.45
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