RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000465399.5

ATG4B-214, Transcript of autophagy related 4B cysteine peptidase, humanhuman

TSL 2

Gene ATG4B, Length 581 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4B-214ENST00000465399 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa7.06□□□□□ -1.28
ATG4B-214ENST00000465399 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.06□□□□□ -1.28
ATG4B-214ENST00000465399 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa7.05□□□□□ -1.28
ATG4B-214ENST00000465399 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.05□□□□□ -1.28
ATG4B-214ENST00000465399 H3BQ85 93 aa7.04□□□□□ -1.28
ATG4B-214ENST00000465399 UBE2V1Q13404 147 aa7.04□□□□□ -1.28
ATG4B-214ENST00000465399 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa7.03□□□□□ -1.28
ATG4B-214ENST00000465399 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.03□□□□□ -1.28
ATG4B-214ENST00000465399 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.02□□□□□ -1.29
ATG4B-214ENST00000465399 M0R143 59 aa7.02□□□□□ -1.29
ATG4B-214ENST00000465399 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.02□□□□□ -1.29
ATG4B-214ENST00000465399 DEFB116Q30KQ4 102 aa7.02□□□□□ -1.29
ATG4B-214ENST00000465399 MTURNQ8N3F0 131 aa7.01□□□□□ -1.29
ATG4B-214ENST00000465399 LINC00472Q9H8W2 130 aa7□□□□□ -1.29
ATG4B-214ENST00000465399 CCKP06307 115 aa6.99□□□□□ -1.29
ATG4B-214ENST00000465399 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.97□□□□□ -1.29
ATG4B-214ENST00000465399 C8orf87E5RJ46 101 aa6.96□□□□□ -1.3
ATG4B-214ENST00000465399 BATFQ16520 125 aa6.96□□□□□ -1.3
ATG4B-214ENST00000465399 LINC00846Q9NV44 126 aa6.96□□□□□ -1.3
ATG4B-214ENST00000465399 TSTD3H0UI37 97 aa6.95□□□□□ -1.3
ATG4B-214ENST00000465399 ATXN8Q156A1 80 aa6.95□□□□□ -1.3
ATG4B-214ENST00000465399 VPS25Q9BRG1 176 aa6.95□□□□□ -1.3
ATG4B-214ENST00000465399 A0A1B0GVX0 72 aa6.94□□□□□ -1.3
ATG4B-214ENST00000465399 DSCR8Q96T75 97 aa6.93□□□□□ -1.3
ATG4B-214ENST00000465399 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
ATG4B-214ENST00000465399 C9JAW5 83 aa6.91□□□□□ -1.3
ATG4B-214ENST00000465399 SPINK7P58062 85 aa6.9□□□□□ -1.3
ATG4B-214ENST00000465399 TAX1BP3O14907 124 aa6.89□□□□□ -1.31
ATG4B-214ENST00000465399 Q6ZQT0 140 aa6.88□□□□□ -1.31
ATG4B-214ENST00000465399 C9orf118A6NHY6 69 aa6.87□□□□□ -1.31
ATG4B-214ENST00000465399 A8MWP4 228 aa6.87□□□□□ -1.31
ATG4B-214ENST00000465399 J3KT08 172 aa6.87□□□□□ -1.31
ATG4B-214ENST00000465399 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.87□□□□□ -1.31
ATG4B-214ENST00000465399 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa6.86□□□□□ -1.31
ATG4B-214ENST00000465399 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.85□□□□□ -1.31
ATG4B-214ENST00000465399 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa6.85□□□□□ -1.31
ATG4B-214ENST00000465399 C14orf132Q9NPU4 83 aa6.85□□□□□ -1.31
ATG4B-214ENST00000465399 NDUFB1O75438 58 aa6.84□□□□□ -1.31
ATG4B-214ENST00000465399 WFDC13Q8IUB5 93 aa6.84□□□□□ -1.31
ATG4B-214ENST00000465399 A0A1W2PPM0 123 aa6.83□□□□□ -1.32
ATG4B-214ENST00000465399 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.83□□□□□ -1.32
ATG4B-214ENST00000465399 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP6.83□□□□□ -1.32
ATG4B-214ENST00000465399 SYNE2Q8WXH0 6885 aaKnown RBP6.82□□□□□ -1.32
ATG4B-214ENST00000465399 PDE6GP18545 87 aa6.79□□□□□ -1.32
ATG4B-214ENST00000465399 C8orf17Q9NRJ1 99 aa6.78□□□□□ -1.32
ATG4B-214ENST00000465399 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4B-214ENST00000465399 A0A1B0GW54 56 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4B-214ENST00000465399 H3BT86 120 aa6.76□□□□□ -1.33
ATG4B-214ENST00000465399 SMCPP49901 116 aaPredicted RBP6.74□□□□□ -1.33
ATG4B-214ENST00000465399 NREPQ16612 68 aa6.73□□□□□ -1.33
ATG4B-214ENST00000465399 Q6ZVQ6 151 aa6.73□□□□□ -1.33
ATG4B-214ENST00000465399 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.73□□□□□ -1.33
ATG4B-214ENST00000465399 KRTAP6-3Q3LI67 103 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4B-214ENST00000465399 PRR15Q8IV56 129 aa6.7□□□□□ -1.34
ATG4B-214ENST00000465399 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4B-214ENST00000465399 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.69□□□□□ -1.34
ATG4B-214ENST00000465399 PRO0461Q9UI25 63 aa6.68□□□□□ -1.34
ATG4B-214ENST00000465399 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP6.66□□□□□ -1.34
ATG4B-214ENST00000465399 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4B-214ENST00000465399 K7EQZ3 153 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4B-214ENST00000465399 TMEM254Q8TBM7 123 aa6.65□□□□□ -1.34
ATG4B-214ENST00000465399 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4B-214ENST00000465399 K7EP34 96 aa6.64□□□□□ -1.35
ATG4B-214ENST00000465399 NDUFS5O43920 106 aa6.63□□□□□ -1.35
ATG4B-214ENST00000465399 BPY2O14599 106 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG4B-214ENST00000465399 Q8N9L7 120 aa6.61□□□□□ -1.35
ATG4B-214ENST00000465399 hDV103S1A0JD37 113 aa6.6□□□□□ -1.35
ATG4B-214ENST00000465399 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4B-214ENST00000465399 IGKV2-30P06310 120 aa6.59□□□□□ -1.35
ATG4B-214ENST00000465399 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.58□□□□□ -1.36
ATG4B-214ENST00000465399 Q5W150 140 aa6.54□□□□□ -1.36
ATG4B-214ENST00000465399 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.51□□□□□ -1.37
ATG4B-214ENST00000465399 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4B-214ENST00000465399 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4B-214ENST00000465399 F8W1H4 67 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4B-214ENST00000465399 ETDBQ3ZM63 59 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4B-214ENST00000465399 CASC2Q6XLA1 102 aa6.5□□□□□ -1.37
ATG4B-214ENST00000465399 A6NN06 94 aa6.49□□□□□ -1.37
ATG4B-214ENST00000465399 UBL5Q9BZL1 73 aa6.49□□□□□ -1.37
ATG4B-214ENST00000465399 C4orf26Q17RF5 130 aa6.48□□□□□ -1.37
ATG4B-214ENST00000465399 HCG22E2RYF7 251 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4B-214ENST00000465399 C5orf47Q569G3 176 aa6.47□□□□□ -1.37
ATG4B-214ENST00000465399 Q5VV11 94 aa6.45□□□□□ -1.38
ATG4B-214ENST00000465399 MUC12Q9UKN1 5478 aa6.44□□□□□ -1.38
ATG4B-214ENST00000465399 MT1BP07438 61 aa6.42□□□□□ -1.38
ATG4B-214ENST00000465399 CXCL6P80162 114 aa6.42□□□□□ -1.38
ATG4B-214ENST00000465399 S4R3F8 94 aa6.41□□□□□ -1.38
ATG4B-214ENST00000465399 NEBP20929 6669 aa6.39□□□□□ -1.39
ATG4B-214ENST00000465399 CSAG1Q6PB30 78 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4B-214ENST00000465399 SPRR2GQ9BYE4 73 aa6.38□□□□□ -1.39
ATG4B-214ENST00000465399 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa6.37□□□□□ -1.39
ATG4B-214ENST00000465399 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.35□□□□□ -1.39
ATG4B-214ENST00000465399 KRTAP10-5P60370 271 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4B-214ENST00000465399 KRTAP20-1Q3LI63 56 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4B-214ENST00000465399 LCA10Q71F78 164 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4B-214ENST00000465399 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.34□□□□□ -1.39
ATG4B-214ENST00000465399 KLKP1Q107X0 134 aa6.31□□□□□ -1.4
ATG4B-214ENST00000465399 A0A1B0GV90 55 aa6.28□□□□□ -1.4
ATG4B-214ENST00000465399 ACYP1P07311 99 aa6.28□□□□□ -1.4
ATG4B-214ENST00000465399 KRTAP5-9P26371 169 aa6.28□□□□□ -1.4
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 11.2 ms