RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000447950.1

PTPRD-AS1-202, PTPRD antisense RNA 1, humanhuman

TSL 2

Gene PTPRD-AS1, Length 1,668 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP7.37□□□□□ -1.23
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 VPS25Q9BRG1 176 aa7.36□□□□□ -1.23
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGHV6-1A0A0B4J1U7 121 aa7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RBM3P98179 157 aaKnown RBP7.34□□□□□ -1.23
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BAALC-AS2P0C853 105 aa7.33□□□□□ -1.24
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP7.32□□□□□ -1.24
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 DSCR8Q96T75 97 aa7.3□□□□□ -1.24
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A0A0A0MQY5 61 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A0A1B0GVX0 72 aa7.29□□□□□ -1.24
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HRES1P13985 223 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 M0R143 59 aa7.28□□□□□ -1.24
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C9JAW5 83 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MPLKIPQ8TAP9 179 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP9-8Q9BYQ0 159 aa7.26□□□□□ -1.25
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ATXN8Q156A1 80 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q6ZQT0 140 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C8orf87E5RJ46 101 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SMIM6P0DI80 62 aa7.24□□□□□ -1.25
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa7.22□□□□□ -1.25
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 J3KT08 172 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FAM236CP0DP71 79 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C14orf132Q9NPU4 83 aa7.2□□□□□ -1.26
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C9orf118A6NHY6 69 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BATFQ16520 125 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGKV3D-7A0A0C4DH55 119 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MT2AP02795 61 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C8orf17Q9NRJ1 99 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A8MWP4 228 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SEC61GP60059 68 aa7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP7.16□□□□□ -1.26
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 USH2AO75445 5202 aa7.14□□□□□ -1.27
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TSTD3H0UI37 97 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NDUFB1O75438 58 aa7.13□□□□□ -1.27
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LOC105371267A0A1B0GV96 52 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MT1FP04733 61 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPINK7P58062 85 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MTURNQ8N3F0 131 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A0A1B0GW54 56 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PDE6GP18545 87 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LYRM7Q5U5X0 104 aa7.12□□□□□ -1.27
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TAX1BP3O14907 124 aa7.11□□□□□ -1.27
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q6ZVQ6 151 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRR15Q8IV56 129 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SSPOA2VEC9 5147 aa7.09□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NREPQ16612 68 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LCE3BQ5TA77 95 aa7.07□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 A0A1W2PPM0 123 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 H3BT86 120 aa7.06□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 K7EQZ3 153 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP9-3Q9BYQ3 159 aa7.04□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 WFDC13Q8IUB5 93 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 TMEM254Q8TBM7 123 aa7.03□□□□□ -1.28
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP7.02□□□□□ -1.29
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP10-10P60014 251 aa7.01□□□□□ -1.29
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP4-12Q9BQ66 201 aa7□□□□□ -1.29
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 hDV103S1A0JD37 113 aa6.99□□□□□ -1.29
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q8N9L7 120 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.96□□□□□ -1.3
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP4-8A0A0G2JLE6 195 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 BPY2O14599 106 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 NDUFS5O43920 106 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 Q5W150 140 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP9-9Q9BYP9 154 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP9-4Q9BYQ2 154 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 FCGBPQ9Y6R7 5405 aaPredicted RBP6.93□□□□□ -1.3
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 PRO0461Q9UI25 63 aa6.91□□□□□ -1.3
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP19-1Q8IUB9 90 aa6.9□□□□□ -1.3
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 IGKV2-30P06310 120 aa6.89□□□□□ -1.31
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CASC2Q6XLA1 102 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LINC00846Q9NV44 126 aa6.87□□□□□ -1.31
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 HCG22E2RYF7 251 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 K7EP34 96 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C7orf65Q6ZTY9 151 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.83□□□□□ -1.32
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C4orf26Q17RF5 130 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 UBL5Q9BZL1 73 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 CXCL6P80162 114 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP19-6Q3LI70 58 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C5orf47Q569G3 176 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP4-7Q9BYR0 210 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 ETDBQ3ZM63 59 aa6.7□□□□□ -1.34
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 V9GYY9 64 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 F8W1H4 67 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 C1orf64Q8NEQ6 169 aa6.63□□□□□ -1.35
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 MACF1Q9UPN3 7388 aaKnown RBP6.63□□□□□ -1.35
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LCE1DQ5T752 114 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 S4R3F8 94 aa6.62□□□□□ -1.35
PTPRD-AS1-202ENST00000447950 LCA10Q71F78 164 aa6.61□□□□□ -1.35
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 57.7 ms