RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000443120.5

ANKRD39-202, Transcript of ankyrin repeat domain 39, humanhuman

TSL 2

Gene ANKRD39, Length 4,965 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39-202ENST00000443120 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.67□□□□□ -1.02
ANKRD39-202ENST00000443120 FLNCQ14315 2725 aa8.62□□□□□ -1.03
ANKRD39-202ENST00000443120 KALRNO60229 2985 aa8.61□□□□□ -1.03
ANKRD39-202ENST00000443120 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP8.59□□□□□ -1.03
ANKRD39-202ENST00000443120 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.58□□□□□ -1.04
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD39-202ENST00000443120 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.54□□□□□ -1.04
ANKRD39-202ENST00000443120 MUC3AQ02505 3323 aa8.53□□□□□ -1.04
ANKRD39-202ENST00000443120 TACC2O95359 2948 aa8.51□□□□□ -1.05
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa8.5□□□□□ -1.05
ANKRD39-202ENST00000443120 HIVEP1P15822 2718 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD39-202ENST00000443120 TENM4Q6N022 2769 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD39-202ENST00000443120 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD39-202ENST00000443120 PLAC4Q8WY50 150 aa8.49□□□□□ -1.05
ANKRD39-202ENST00000443120 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP8.47□□□□□ -1.05
ANKRD39-202ENST00000443120 H0YAA0 97 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD39-202ENST00000443120 LOC400499M0QZD8 3231 aa8.45□□□□□ -1.06
ANKRD39-202ENST00000443120 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP8.41□□□□□ -1.06
ANKRD39-202ENST00000443120 APCP25054 2843 aa8.41□□□□□ -1.06
ANKRD39-202ENST00000443120 ATMQ13315 3056 aa8.4□□□□□ -1.06
ANKRD39-202ENST00000443120 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP8.4□□□□□ -1.06
ANKRD39-202ENST00000443120 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP8.4□□□□□ -1.07
ANKRD39-202ENST00000443120 COL12A1Q99715 3063 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD39-202ENST00000443120 DMDP11532 3685 aa8.39□□□□□ -1.07
ANKRD39-202ENST00000443120 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD39-202ENST00000443120 ASPMQ8IZT6 3477 aa8.37□□□□□ -1.07
ANKRD39-202ENST00000443120 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa8.35□□□□□ -1.07
ANKRD39-202ENST00000443120 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa8.33□□□□□ -1.08
ANKRD39-202ENST00000443120 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP8.33□□□□□ -1.08
ANKRD39-202ENST00000443120 DMXL1Q9Y485 3027 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD39-202ENST00000443120 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.32□□□□□ -1.08
ANKRD39-202ENST00000443120 P0C880 135 aa8.29□□□□□ -1.08
ANKRD39-202ENST00000443120 PP632Q6XCG6 107 aa8.27□□□□□ -1.09
ANKRD39-202ENST00000443120 LRBAP50851 2863 aa8.26□□□□□ -1.09
ANKRD39-202ENST00000443120 ZZEF1O43149 2961 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD39-202ENST00000443120 DCHS1Q96JQ0 3298 aa8.24□□□□□ -1.09
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa8.23□□□□□ -1.09
ANKRD39-202ENST00000443120 LAMA5O15230 3695 aa8.22□□□□□ -1.09
ANKRD39-202ENST00000443120 CELSR2Q9HCU4 2923 aa8.2□□□□□ -1.1
ANKRD39-202ENST00000443120 TNP1P09430 55 aa8.18□□□□□ -1.1
ANKRD39-202ENST00000443120 ZFHX4Q86UP3 3567 aa8.16□□□□□ -1.1
ANKRD39-202ENST00000443120 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa8.14□□□□□ -1.11
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.12□□□□□ -1.11
ANKRD39-202ENST00000443120 DCHS2Q6V1P9 2916 aa8.11□□□□□ -1.11
ANKRD39-202ENST00000443120 TENM3Q9P273 2699 aa8.09□□□□□ -1.12
ANKRD39-202ENST00000443120 ZANQ9Y493 2812 aa8.06□□□□□ -1.12
ANKRD39-202ENST00000443120 RELNP78509 3460 aa8.05□□□□□ -1.12
ANKRD39-202ENST00000443120 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.96□□□□□ -1.13
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP10-8P60410 259 aa7.95□□□□□ -1.14
ANKRD39-202ENST00000443120 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.94□□□□□ -1.14
ANKRD39-202ENST00000443120 NF1P21359 2839 aa7.92□□□□□ -1.14
ANKRD39-202ENST00000443120 XP32Q5T750 250 aa7.91□□□□□ -1.14
ANKRD39-202ENST00000443120 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.91□□□□□ -1.14
ANKRD39-202ENST00000443120 TGP01266 2768 aa7.86□□□□□ -1.15
ANKRD39-202ENST00000443120 TPRXLQ17RH7 258 aa7.84□□□□□ -1.15
ANKRD39-202ENST00000443120 FBN2P35556 2912 aa7.83□□□□□ -1.16
ANKRD39-202ENST00000443120 TENM2Q9NT68 2774 aa7.79□□□□□ -1.16
ANKRD39-202ENST00000443120 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.78□□□□□ -1.16
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP12-2P59991 146 aa7.77□□□□□ -1.17
ANKRD39-202ENST00000443120 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.76□□□□□ -1.17
ANKRD39-202ENST00000443120 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.73□□□□□ -1.17
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP12-1P59990 96 aa7.69□□□□□ -1.18
ANKRD39-202ENST00000443120 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.67□□□□□ -1.18
ANKRD39-202ENST00000443120 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.66□□□□□ -1.18
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa7.65□□□□□ -1.18
ANKRD39-202ENST00000443120 CUBNO60494 3623 aa7.64□□□□□ -1.19
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa7.61□□□□□ -1.19
ANKRD39-202ENST00000443120 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP7.6□□□□□ -1.19
ANKRD39-202ENST00000443120 A0A1B0GVY2 172 aa7.6□□□□□ -1.19
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa7.57□□□□□ -1.2
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP10-10P60014 251 aa7.55□□□□□ -1.2
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP7.53□□□□□ -1.2
ANKRD39-202ENST00000443120 PDZD2O15018 2839 aa7.48□□□□□ -1.21
ANKRD39-202ENST00000443120 PRO2289Q9P1D8 64 aa7.48□□□□□ -1.21
ANKRD39-202ENST00000443120 VWFP04275 2813 aa7.47□□□□□ -1.21
ANKRD39-202ENST00000443120 BSNQ9UPA5 3926 aa7.39□□□□□ -1.23
ANKRD39-202ENST00000443120 CSMD2Q7Z408 3487 aa7.38□□□□□ -1.23
ANKRD39-202ENST00000443120 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.3□□□□□ -1.24
ANKRD39-202ENST00000443120 INE1O15225 51 aa7.27□□□□□ -1.25
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa7.26□□□□□ -1.25
ANKRD39-202ENST00000443120 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.24□□□□□ -1.25
ANKRD39-202ENST00000443120 VPS13CQ709C8 3753 aa7.21□□□□□ -1.26
ANKRD39-202ENST00000443120 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7.19□□□□□ -1.26
ANKRD39-202ENST00000443120 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa7.18□□□□□ -1.26
ANKRD39-202ENST00000443120 ZFHX3Q15911 3703 aa7.11□□□□□ -1.27
ANKRD39-202ENST00000443120 FBN3Q75N90 2809 aa7.07□□□□□ -1.28
ANKRD39-202ENST00000443120 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa7.02□□□□□ -1.29
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP23-1A1A580 65 aa6.95□□□□□ -1.3
ANKRD39-202ENST00000443120 COL7A1Q02388 2944 aa6.91□□□□□ -1.3
ANKRD39-202ENST00000443120 MT1HL1P0DM35 61 aa6.89□□□□□ -1.31
ANKRD39-202ENST00000443120 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.87□□□□□ -1.31
ANKRD39-202ENST00000443120 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.83□□□□□ -1.32
ANKRD39-202ENST00000443120 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.74□□□□□ -1.33
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6.69□□□□□ -1.34
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP10-12P60413 245 aa6.65□□□□□ -1.35
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.61□□□□□ -1.35
ANKRD39-202ENST00000443120 KRTAP12-3P60328 96 aa6.6□□□□□ -1.35
ANKRD39-202ENST00000443120 LCE3AQ5TA76 89 aa6.55□□□□□ -1.36
ANKRD39-202ENST00000443120 LORP23490 312 aaPredicted RBP6.54□□□□□ -1.36
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