RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000439986.8

CCBE1-202, Transcript of collagen and calcium binding EGF domains 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene CCBE1, Length 6,227 nt, Biotype protein coding.

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCBE1-202ENST00000439986 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP6.92□□□□□ -1.3
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa6.92□□□□□ -1.3
CCBE1-202ENST00000439986 DMXL1Q9Y485 3027 aa6.91□□□□□ -1.3
CCBE1-202ENST00000439986 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
CCBE1-202ENST00000439986 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP6.91□□□□□ -1.3
CCBE1-202ENST00000439986 PLAC8Q9NZF1 115 aa6.9□□□□□ -1.31
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP6.9□□□□□ -1.31
CCBE1-202ENST00000439986 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.86□□□□□ -1.31
CCBE1-202ENST00000439986 M0QZ58 72 aa6.85□□□□□ -1.31
CCBE1-202ENST00000439986 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP6.84□□□□□ -1.31
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP10-2P60368 255 aa6.83□□□□□ -1.32
CCBE1-202ENST00000439986 LCE6AA0A183 80 aa6.83□□□□□ -1.32
CCBE1-202ENST00000439986 A8MU10 97 aa6.82□□□□□ -1.32
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP10-1P60331 282 aa6.82□□□□□ -1.32
CCBE1-202ENST00000439986 CELSR2Q9HCU4 2923 aa6.81□□□□□ -1.32
CCBE1-202ENST00000439986 APCP25054 2843 aa6.8□□□□□ -1.32
CCBE1-202ENST00000439986 HIVEP1P15822 2718 aa6.8□□□□□ -1.32
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa6.79□□□□□ -1.32
CCBE1-202ENST00000439986 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.78□□□□□ -1.32
CCBE1-202ENST00000439986 ITPR2Q14571 2701 aa6.78□□□□□ -1.32
CCBE1-202ENST00000439986 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.77□□□□□ -1.33
CCBE1-202ENST00000439986 PANO1I0J062 215 aa6.77□□□□□ -1.33
CCBE1-202ENST00000439986 FBN2P35556 2912 aa6.77□□□□□ -1.33
CCBE1-202ENST00000439986 NF1P21359 2839 aa6.76□□□□□ -1.33
CCBE1-202ENST00000439986 STAB2Q8WWQ8 2551 aa6.76□□□□□ -1.33
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa6.74□□□□□ -1.33
CCBE1-202ENST00000439986 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.74□□□□□ -1.33
CCBE1-202ENST00000439986 DCHS2Q6V1P9 2916 aa6.71□□□□□ -1.33
CCBE1-202ENST00000439986 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.68□□□□□ -1.34
CCBE1-202ENST00000439986 RELNP78509 3460 aa6.68□□□□□ -1.34
CCBE1-202ENST00000439986 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa6.65□□□□□ -1.34
CCBE1-202ENST00000439986 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.65□□□□□ -1.34
CCBE1-202ENST00000439986 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.62□□□□□ -1.35
CCBE1-202ENST00000439986 LAMA5O15230 3695 aa6.61□□□□□ -1.35
CCBE1-202ENST00000439986 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP6.58□□□□□ -1.36
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa6.58□□□□□ -1.36
CCBE1-202ENST00000439986 DMDP11532 3685 aa6.57□□□□□ -1.36
CCBE1-202ENST00000439986 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.56□□□□□ -1.36
CCBE1-202ENST00000439986 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCBE1-202ENST00000439986 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
CCBE1-202ENST00000439986 P0C880 135 aa6.55□□□□□ -1.36
CCBE1-202ENST00000439986 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
CCBE1-202ENST00000439986 INE1O15225 51 aa6.54□□□□□ -1.36
CCBE1-202ENST00000439986 MUC3AQ02505 3323 aa6.51□□□□□ -1.37
CCBE1-202ENST00000439986 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.51□□□□□ -1.37
CCBE1-202ENST00000439986 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.44□□□□□ -1.38
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa6.42□□□□□ -1.38
CCBE1-202ENST00000439986 TENM3Q9P273 2699 aa6.41□□□□□ -1.38
CCBE1-202ENST00000439986 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.4□□□□□ -1.38
CCBE1-202ENST00000439986 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP6.4□□□□□ -1.38
CCBE1-202ENST00000439986 TENM4Q6N022 2769 aa6.34□□□□□ -1.39
CCBE1-202ENST00000439986 A0A1B0GVY2 172 aa6.34□□□□□ -1.39
CCBE1-202ENST00000439986 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.3□□□□□ -1.4
CCBE1-202ENST00000439986 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
CCBE1-202ENST00000439986 CUBNO60494 3623 aa6.28□□□□□ -1.4
CCBE1-202ENST00000439986 PDZD2O15018 2839 aa6.27□□□□□ -1.41
CCBE1-202ENST00000439986 VWFP04275 2813 aa6.27□□□□□ -1.41
CCBE1-202ENST00000439986 TNP1P09430 55 aa6.26□□□□□ -1.41
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP10-8P60410 259 aa6.22□□□□□ -1.41
CCBE1-202ENST00000439986 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.21□□□□□ -1.41
CCBE1-202ENST00000439986 TGP01266 2768 aa6.18□□□□□ -1.42
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.16□□□□□ -1.42
CCBE1-202ENST00000439986 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.15□□□□□ -1.42
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.13□□□□□ -1.43
CCBE1-202ENST00000439986 H0YAA0 97 aa6.13□□□□□ -1.43
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.12□□□□□ -1.43
CCBE1-202ENST00000439986 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.08□□□□□ -1.44
CCBE1-202ENST00000439986 XP32Q5T750 250 aa6.05□□□□□ -1.44
CCBE1-202ENST00000439986 TPRXLQ17RH7 258 aa6.05□□□□□ -1.44
CCBE1-202ENST00000439986 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.04□□□□□ -1.44
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP10-10P60014 251 aa6.03□□□□□ -1.44
CCBE1-202ENST00000439986 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.02□□□□□ -1.45
CCBE1-202ENST00000439986 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.01□□□□□ -1.45
CCBE1-202ENST00000439986 BSNQ9UPA5 3926 aa6□□□□□ -1.45
CCBE1-202ENST00000439986 TENM2Q9NT68 2774 aa5.98□□□□□ -1.45
CCBE1-202ENST00000439986 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP5.95□□□□□ -1.46
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.94□□□□□ -1.46
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.94□□□□□ -1.46
CCBE1-202ENST00000439986 ZFHX3Q15911 3703 aa5.88□□□□□ -1.47
CCBE1-202ENST00000439986 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP5.87□□□□□ -1.47
CCBE1-202ENST00000439986 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa5.87□□□□□ -1.47
CCBE1-202ENST00000439986 FBN3Q75N90 2809 aa5.85□□□□□ -1.47
CCBE1-202ENST00000439986 VPS13CQ709C8 3753 aa5.8□□□□□ -1.48
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa5.76□□□□□ -1.49
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa5.75□□□□□ -1.49
CCBE1-202ENST00000439986 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.75□□□□□ -1.49
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP12-2P59991 146 aa5.7□□□□□ -1.5
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa5.62□□□□□ -1.51
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa5.6□□□□□ -1.51
CCBE1-202ENST00000439986 COL7A1Q02388 2944 aa5.6□□□□□ -1.51
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP12-1P59990 96 aa5.6□□□□□ -1.51
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.59□□□□□ -1.52
CCBE1-202ENST00000439986 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.54□□□□□ -1.52
CCBE1-202ENST00000439986 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.51□□□□□ -1.53
CCBE1-202ENST00000439986 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.49□□□□□ -1.53
CCBE1-202ENST00000439986 AKAP9Q99996 3911 aa5.49□□□□□ -1.53
CCBE1-202ENST00000439986 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.47□□□□□ -1.53
CCBE1-202ENST00000439986 MT3P25713 68 aa5.31□□□□□ -1.56
CCBE1-202ENST00000439986 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.28□□□□□ -1.56
CCBE1-202ENST00000439986 DNAH10Q8IVF4 4471 aa5.24□□□□□ -1.57
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