RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000402738.5

HERC3-202, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene HERC3, Length 4,974 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-202ENST00000402738 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa5.52□□□□□ -1.53
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa5.51□□□□□ -1.53
HERC3-202ENST00000402738 TACC2O95359 2948 aa5.5□□□□□ -1.53
HERC3-202ENST00000402738 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa5.49□□□□□ -1.53
HERC3-202ENST00000402738 PLAC4Q8WY50 150 aa5.48□□□□□ -1.53
HERC3-202ENST00000402738 C10orf95Q9H7T3 257 aa5.46□□□□□ -1.53
HERC3-202ENST00000402738 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa5.46□□□□□ -1.54
HERC3-202ENST00000402738 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-202ENST00000402738 HIVEP1P15822 2718 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-202ENST00000402738 ATMQ13315 3056 aa5.45□□□□□ -1.54
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa5.44□□□□□ -1.54
HERC3-202ENST00000402738 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP5.44□□□□□ -1.54
HERC3-202ENST00000402738 IGSF10Q6WRI0 2623 aa5.43□□□□□ -1.54
HERC3-202ENST00000402738 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC3-202ENST00000402738 H0YAA0 97 aa5.42□□□□□ -1.54
HERC3-202ENST00000402738 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP5.4□□□□□ -1.54
HERC3-202ENST00000402738 COL12A1Q99715 3063 aa5.4□□□□□ -1.54
HERC3-202ENST00000402738 ZZEF1O43149 2961 aa5.4□□□□□ -1.54
HERC3-202ENST00000402738 CELSR2Q9HCU4 2923 aa5.37□□□□□ -1.55
HERC3-202ENST00000402738 FLNCQ14315 2725 aa5.36□□□□□ -1.55
HERC3-202ENST00000402738 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP5.36□□□□□ -1.55
HERC3-202ENST00000402738 LOC400499M0QZD8 3231 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC3-202ENST00000402738 MUC3AQ02505 3323 aa5.35□□□□□ -1.55
HERC3-202ENST00000402738 RPS29P62273 56 aaKnown RBP5.34□□□□□ -1.55
HERC3-202ENST00000402738 ASPMQ8IZT6 3477 aa5.33□□□□□ -1.56
HERC3-202ENST00000402738 ITPR2Q14571 2701 aa5.33□□□□□ -1.56
HERC3-202ENST00000402738 Q5VSD8 79 aa5.33□□□□□ -1.56
HERC3-202ENST00000402738 DMDP11532 3685 aa5.32□□□□□ -1.56
HERC3-202ENST00000402738 P0C880 135 aa5.3□□□□□ -1.56
HERC3-202ENST00000402738 DMXL1Q9Y485 3027 aa5.3□□□□□ -1.56
HERC3-202ENST00000402738 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP5.3□□□□□ -1.56
HERC3-202ENST00000402738 DCHS1Q96JQ0 3298 aa5.29□□□□□ -1.56
HERC3-202ENST00000402738 ZANQ9Y493 2812 aa5.27□□□□□ -1.57
HERC3-202ENST00000402738 DCHS2Q6V1P9 2916 aa5.25□□□□□ -1.57
HERC3-202ENST00000402738 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP5.24□□□□□ -1.57
HERC3-202ENST00000402738 TNP1P09430 55 aa5.21□□□□□ -1.57
HERC3-202ENST00000402738 FBN2P35556 2912 aa5.2□□□□□ -1.58
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP10-8P60410 259 aa5.19□□□□□ -1.58
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa5.19□□□□□ -1.58
HERC3-202ENST00000402738 PP632Q6XCG6 107 aa5.17□□□□□ -1.58
HERC3-202ENST00000402738 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP5.17□□□□□ -1.58
HERC3-202ENST00000402738 TGP01266 2768 aa5.17□□□□□ -1.58
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa5.16□□□□□ -1.58
HERC3-202ENST00000402738 LAMA5O15230 3695 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC3-202ENST00000402738 ZFHX4Q86UP3 3567 aa5.15□□□□□ -1.59
HERC3-202ENST00000402738 NF1P21359 2839 aa5.14□□□□□ -1.59
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa5.13□□□□□ -1.59
HERC3-202ENST00000402738 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa5.12□□□□□ -1.59
HERC3-202ENST00000402738 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP5.11□□□□□ -1.59
HERC3-202ENST00000402738 RELNP78509 3460 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC3-202ENST00000402738 TPRXLQ17RH7 258 aa5.07□□□□□ -1.6
HERC3-202ENST00000402738 CUBNO60494 3623 aa5.06□□□□□ -1.6
HERC3-202ENST00000402738 XP32Q5T750 250 aa5.03□□□□□ -1.6
HERC3-202ENST00000402738 TENM3Q9P273 2699 aa5.02□□□□□ -1.61
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP12-2P59991 146 aa5.02□□□□□ -1.61
HERC3-202ENST00000402738 PDZD2O15018 2839 aa5.01□□□□□ -1.61
HERC3-202ENST00000402738 TENM4Q6N022 2769 aa5.01□□□□□ -1.61
HERC3-202ENST00000402738 MXRA5Q9NR99 2828 aa4.98□□□□□ -1.61
HERC3-202ENST00000402738 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa4.97□□□□□ -1.61
HERC3-202ENST00000402738 TENM1Q9UKZ4 2725 aa4.94□□□□□ -1.62
HERC3-202ENST00000402738 CSMD1Q96PZ7 3565 aa4.92□□□□□ -1.62
HERC3-202ENST00000402738 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP4.92□□□□□ -1.62
HERC3-202ENST00000402738 SVEP1Q4LDE5 3571 aa4.91□□□□□ -1.62
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP12-1P59990 96 aa4.91□□□□□ -1.62
HERC3-202ENST00000402738 A0A1B0GVY2 172 aa4.9□□□□□ -1.62
HERC3-202ENST00000402738 ZFHX3Q15911 3703 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.88□□□□□ -1.63
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa4.84□□□□□ -1.63
HERC3-202ENST00000402738 TENM2Q9NT68 2774 aa4.84□□□□□ -1.63
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.84□□□□□ -1.64
HERC3-202ENST00000402738 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa4.81□□□□□ -1.64
HERC3-202ENST00000402738 BSNQ9UPA5 3926 aa4.81□□□□□ -1.64
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.78□□□□□ -1.64
HERC3-202ENST00000402738 VWFP04275 2813 aa4.76□□□□□ -1.65
HERC3-202ENST00000402738 OTOGQ6ZRI0 2925 aa4.76□□□□□ -1.65
HERC3-202ENST00000402738 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP4.76□□□□□ -1.65
HERC3-202ENST00000402738 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP4.69□□□□□ -1.66
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP10-10P60014 251 aa4.68□□□□□ -1.66
HERC3-202ENST00000402738 PRO2289Q9P1D8 64 aa4.67□□□□□ -1.66
HERC3-202ENST00000402738 FBN3Q75N90 2809 aa4.67□□□□□ -1.66
HERC3-202ENST00000402738 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa4.66□□□□□ -1.66
HERC3-202ENST00000402738 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP4.65□□□□□ -1.66
HERC3-202ENST00000402738 CSMD2Q7Z408 3487 aa4.65□□□□□ -1.67
HERC3-202ENST00000402738 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa4.63□□□□□ -1.67
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa4.61□□□□□ -1.67
HERC3-202ENST00000402738 VPS13CQ709C8 3753 aa4.6□□□□□ -1.67
HERC3-202ENST00000402738 INE1O15225 51 aa4.56□□□□□ -1.68
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa4.55□□□□□ -1.68
HERC3-202ENST00000402738 AKAP9Q99996 3911 aa4.52□□□□□ -1.69
HERC3-202ENST00000402738 COL7A1Q02388 2944 aa4.51□□□□□ -1.69
HERC3-202ENST00000402738 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP4.36□□□□□ -1.71
HERC3-202ENST00000402738 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa4.35□□□□□ -1.71
HERC3-202ENST00000402738 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.25□□□□□ -1.73
HERC3-202ENST00000402738 LORP23490 312 aaPredicted RBP4.25□□□□□ -1.73
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP10-12P60413 245 aa4.24□□□□□ -1.73
HERC3-202ENST00000402738 ANK2Q01484 3957 aa4.24□□□□□ -1.73
HERC3-202ENST00000402738 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.23□□□□□ -1.73
HERC3-202ENST00000402738 LCE3AQ5TA76 89 aa4.23□□□□□ -1.73
HERC3-202ENST00000402738 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.22□□□□□ -1.73
HERC3-202ENST00000402738 CSMD3Q7Z407 3707 aa4.22□□□□□ -1.73
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 9.2 ms