RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000368226.8

PTPRK-207, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type K, humanhuman

APPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRK, Length 6,087 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRK-207ENST00000368226 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP7.29□□□□□ -1.24
PTPRK-207ENST00000368226 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-207ENST00000368226 NBEAQ8NFP9 2946 aa7.27□□□□□ -1.25
PTPRK-207ENST00000368226 FLNCQ14315 2725 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRK-207ENST00000368226 A8MU10 97 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRK-207ENST00000368226 HIVEP1P15822 2718 aa7.25□□□□□ -1.25
PTPRK-207ENST00000368226 MYO15AQ9UKN7 3530 aa7.23□□□□□ -1.25
PTPRK-207ENST00000368226 A8MUU9 505 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.21□□□□□ -1.26
PTPRK-207ENST00000368226 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-207ENST00000368226 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP7.19□□□□□ -1.26
PTPRK-207ENST00000368226 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.18□□□□□ -1.26
PTPRK-207ENST00000368226 ZZEF1O43149 2961 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRK-207ENST00000368226 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.17□□□□□ -1.26
PTPRK-207ENST00000368226 APCP25054 2843 aa7.17□□□□□ -1.26
PTPRK-207ENST00000368226 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.15□□□□□ -1.27
PTPRK-207ENST00000368226 H3BS24 57 aa7.09□□□□□ -1.27
PTPRK-207ENST00000368226 A0A0A0MQY5 61 aa7.09□□□□□ -1.28
PTPRK-207ENST00000368226 CELSR2Q9HCU4 2923 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRK-207ENST00000368226 TENM4Q6N022 2769 aa7.08□□□□□ -1.28
PTPRK-207ENST00000368226 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP7.06□□□□□ -1.28
PTPRK-207ENST00000368226 LOC400499M0QZD8 3231 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-207ENST00000368226 A0A1B0GVY2 172 aa7.05□□□□□ -1.28
PTPRK-207ENST00000368226 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7□□□□□ -1.29
PTPRK-207ENST00000368226 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.97□□□□□ -1.29
PTPRK-207ENST00000368226 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa6.96□□□□□ -1.29
PTPRK-207ENST00000368226 ZANQ9Y493 2812 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.95□□□□□ -1.3
PTPRK-207ENST00000368226 XP32Q5T750 250 aa6.94□□□□□ -1.3
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa6.93□□□□□ -1.3
PTPRK-207ENST00000368226 RELNP78509 3460 aa6.92□□□□□ -1.3
PTPRK-207ENST00000368226 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP6.91□□□□□ -1.3
PTPRK-207ENST00000368226 A6NN06 94 aa6.9□□□□□ -1.31
PTPRK-207ENST00000368226 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP6.89□□□□□ -1.31
PTPRK-207ENST00000368226 TNP1P09430 55 aa6.86□□□□□ -1.31
PTPRK-207ENST00000368226 FBN2P35556 2912 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP10-8P60410 259 aa6.85□□□□□ -1.31
PTPRK-207ENST00000368226 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.84□□□□□ -1.31
PTPRK-207ENST00000368226 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.82□□□□□ -1.32
PTPRK-207ENST00000368226 NF1P21359 2839 aa6.8□□□□□ -1.32
PTPRK-207ENST00000368226 LAMA5O15230 3695 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRK-207ENST00000368226 TENM2Q9NT68 2774 aa6.78□□□□□ -1.32
PTPRK-207ENST00000368226 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-207ENST00000368226 DCHS1Q96JQ0 3298 aa6.76□□□□□ -1.33
PTPRK-207ENST00000368226 NDUFAF8A1L188 74 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP10-10P60014 251 aa6.75□□□□□ -1.33
PTPRK-207ENST00000368226 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa6.74□□□□□ -1.33
PTPRK-207ENST00000368226 TENM1Q9UKZ4 2725 aa6.73□□□□□ -1.33
PTPRK-207ENST00000368226 TPRXLQ17RH7 258 aa6.72□□□□□ -1.33
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa6.68□□□□□ -1.34
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.67□□□□□ -1.34
PTPRK-207ENST00000368226 DMDP11532 3685 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-207ENST00000368226 CSMD1Q96PZ7 3565 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-207ENST00000368226 H0YAA0 97 aa6.65□□□□□ -1.34
PTPRK-207ENST00000368226 P0C880 135 aa6.61□□□□□ -1.35
PTPRK-207ENST00000368226 TENM3Q9P273 2699 aa6.6□□□□□ -1.35
PTPRK-207ENST00000368226 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa6.58□□□□□ -1.36
PTPRK-207ENST00000368226 MXRA5Q9NR99 2828 aa6.53□□□□□ -1.36
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PTPRK-207ENST00000368226 ZFHX3Q15911 3703 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-207ENST00000368226 TGP01266 2768 aa6.48□□□□□ -1.37
PTPRK-207ENST00000368226 PP632Q6XCG6 107 aa6.47□□□□□ -1.37
PTPRK-207ENST00000368226 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.46□□□□□ -1.37
PTPRK-207ENST00000368226 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.44□□□□□ -1.38
PTPRK-207ENST00000368226 MUC3AQ02505 3323 aa6.42□□□□□ -1.38
PTPRK-207ENST00000368226 PDZD2O15018 2839 aa6.41□□□□□ -1.38
PTPRK-207ENST00000368226 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.39□□□□□ -1.39
PTPRK-207ENST00000368226 CUBNO60494 3623 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP12-2P59991 146 aa6.35□□□□□ -1.39
PTPRK-207ENST00000368226 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.33□□□□□ -1.4
PTPRK-207ENST00000368226 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP6.32□□□□□ -1.4
PTPRK-207ENST00000368226 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
PTPRK-207ENST00000368226 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.27□□□□□ -1.41
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.2□□□□□ -1.42
PTPRK-207ENST00000368226 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.17□□□□□ -1.42
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP12-1P59990 96 aa6.15□□□□□ -1.43
PTPRK-207ENST00000368226 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.11□□□□□ -1.43
PTPRK-207ENST00000368226 BSNQ9UPA5 3926 aa6.08□□□□□ -1.44
PTPRK-207ENST00000368226 FBN3Q75N90 2809 aa6.07□□□□□ -1.44
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa6.06□□□□□ -1.44
PTPRK-207ENST00000368226 MT1HL1P0DM35 61 aa6.02□□□□□ -1.45
PTPRK-207ENST00000368226 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP6.01□□□□□ -1.45
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.99□□□□□ -1.45
PTPRK-207ENST00000368226 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa5.98□□□□□ -1.45
PTPRK-207ENST00000368226 VPS13CQ709C8 3753 aa5.96□□□□□ -1.45
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP5.95□□□□□ -1.46
PTPRK-207ENST00000368226 COL7A1Q02388 2944 aa5.93□□□□□ -1.46
PTPRK-207ENST00000368226 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.9□□□□□ -1.46
PTPRK-207ENST00000368226 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.83□□□□□ -1.48
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.81□□□□□ -1.48
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.78□□□□□ -1.48
PTPRK-207ENST00000368226 ALMS1Q8TCU4 4167 aa5.75□□□□□ -1.49
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP10-12P60413 245 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-207ENST00000368226 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.74□□□□□ -1.49
PTPRK-207ENST00000368226 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP5.66□□□□□ -1.5
PTPRK-207ENST00000368226 DNAH9Q9NYC9 4486 aa5.63□□□□□ -1.51
PTPRK-207ENST00000368226 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.63□□□□□ -1.51
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