RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000362821.1

RN7SKP173-201, Transcript of RNA, 7SK small nuclear pseudogene 173, humanhuman

BASIC

Gene RN7SKP173, Length 315 nt, Biotype misc RNA.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RN7SKP173-201ENST00000362821 HCG22E2RYF7 251 aa4.9□□□□□ -1.63
RN7SKP173-201ENST00000362821 LRP1Q07954 4544 aaKnown RBP4.89□□□□□ -1.63
RN7SKP173-201ENST00000362821 C8orf87E5RJ46 101 aa4.88□□□□□ -1.63
RN7SKP173-201ENST00000362821 J3QL48 77 aa4.88□□□□□ -1.63
RN7SKP173-201ENST00000362821 CASC2Q6XLA1 102 aa4.88□□□□□ -1.63
RN7SKP173-201ENST00000362821 WFDC13Q8IUB5 93 aa4.88□□□□□ -1.63
RN7SKP173-201ENST00000362821 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.88□□□□□ -1.63
RN7SKP173-201ENST00000362821 C8orf17Q9NRJ1 99 aa4.88□□□□□ -1.63
RN7SKP173-201ENST00000362821 FAT3Q8TDW7 4589 aa4.88□□□□□ -1.63
RN7SKP173-201ENST00000362821 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa4.87□□□□□ -1.63
RN7SKP173-201ENST00000362821 ATOX1O00244 68 aa4.87□□□□□ -1.63
RN7SKP173-201ENST00000362821 hDV103S1A0JD37 113 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP173-201ENST00000362821 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP173-201ENST00000362821 MYCBP2O75592 4640 aa4.86□□□□□ -1.63
RN7SKP173-201ENST00000362821 LINC00313P59037 77 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP173-201ENST00000362821 ABCA13Q86UQ4 5058 aa4.85□□□□□ -1.63
RN7SKP173-201ENST00000362821 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP173-201ENST00000362821 TMEM254Q8TBM7 123 aa4.84□□□□□ -1.63
RN7SKP173-201ENST00000362821 TNXBP22105 4242 aa4.84□□□□□ -1.64
RN7SKP173-201ENST00000362821 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.83□□□□□ -1.64
RN7SKP173-201ENST00000362821 ANAPC13Q9BS18 74 aa4.83□□□□□ -1.64
RN7SKP173-201ENST00000362821 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP4.82□□□□□ -1.64
RN7SKP173-201ENST00000362821 MRPL34Q9BQ48 92 aaKnown RBP4.82□□□□□ -1.64
RN7SKP173-201ENST00000362821 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.81□□□□□ -1.64
RN7SKP173-201ENST00000362821 NDUFS5O43920 106 aa4.81□□□□□ -1.64
RN7SKP173-201ENST00000362821 PRR4Q16378 134 aa4.8□□□□□ -1.64
RN7SKP173-201ENST00000362821 TRAV7A0A075B6U4 112 aa4.79□□□□□ -1.64
RN7SKP173-201ENST00000362821 C9orf92A6NGG3 77 aa4.79□□□□□ -1.64
RN7SKP173-201ENST00000362821 SERP2Q8N6R1 65 aa4.79□□□□□ -1.64
RN7SKP173-201ENST00000362821 OCR1Q9BZK8 76 aa4.79□□□□□ -1.64
RN7SKP173-201ENST00000362821 TP53AIP1Q9HCN2 124 aa4.78□□□□□ -1.64
RN7SKP173-201ENST00000362821 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa4.77□□□□□ -1.65
RN7SKP173-201ENST00000362821 UQCRQO14949 82 aa4.77□□□□□ -1.65
RN7SKP173-201ENST00000362821 PCP4P48539 62 aa4.76□□□□□ -1.65
RN7SKP173-201ENST00000362821 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP4.76□□□□□ -1.65
RN7SKP173-201ENST00000362821 COX7CP15954 63 aa4.75□□□□□ -1.65
RN7SKP173-201ENST00000362821 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa4.75□□□□□ -1.65
RN7SKP173-201ENST00000362821 TRAV22A0A0B4J277 110 aa4.73□□□□□ -1.65
RN7SKP173-201ENST00000362821 MP68P56378 58 aa4.73□□□□□ -1.65
RN7SKP173-201ENST00000362821 TPRXLQ17RH7 258 aa4.73□□□□□ -1.65
RN7SKP173-201ENST00000362821 C5orf47Q569G3 176 aa4.73□□□□□ -1.65
RN7SKP173-201ENST00000362821 H0Y9P7 68 aa4.72□□□□□ -1.65
RN7SKP173-201ENST00000362821 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.72□□□□□ -1.65
RN7SKP173-201ENST00000362821 A8MUU9 505 aa4.71□□□□□ -1.66
RN7SKP173-201ENST00000362821 C20orf197Q8N268 126 aa4.71□□□□□ -1.66
RN7SKP173-201ENST00000362821 PCLOQ9Y6V0 5065 aa4.71□□□□□ -1.66
RN7SKP173-201ENST00000362821 Q75L30 129 aa4.7□□□□□ -1.66
RN7SKP173-201ENST00000362821 H3BPC8 53 aa4.69□□□□□ -1.66
RN7SKP173-201ENST00000362821 CCDC179H3BU77 68 aa4.69□□□□□ -1.66
RN7SKP173-201ENST00000362821 XP32Q5T750 250 aa4.69□□□□□ -1.66
RN7SKP173-201ENST00000362821 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP4.68□□□□□ -1.66
RN7SKP173-201ENST00000362821 LINC00208Q96KT6 92 aa4.68□□□□□ -1.66
RN7SKP173-201ENST00000362821 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.67□□□□□ -1.66
RN7SKP173-201ENST00000362821 Q5W150 140 aa4.67□□□□□ -1.66
RN7SKP173-201ENST00000362821 ATP11AUNQ6ZP68 121 aa4.67□□□□□ -1.66
RN7SKP173-201ENST00000362821 C1orf64Q8NEQ6 169 aa4.67□□□□□ -1.66
RN7SKP173-201ENST00000362821 A0A0U1RQV1 116 aa4.66□□□□□ -1.66
RN7SKP173-201ENST00000362821 LOC101927531A0A1B0GV80 90 aa4.66□□□□□ -1.66
RN7SKP173-201ENST00000362821 KLKP1Q107X0 134 aa4.66□□□□□ -1.66
RN7SKP173-201ENST00000362821 SNURFQ9Y675 71 aa4.66□□□□□ -1.66
RN7SKP173-201ENST00000362821 NDUFC1O43677 76 aa4.63□□□□□ -1.67
RN7SKP173-201ENST00000362821 IGKV2D-30A0A075B6S6 120 aa4.62□□□□□ -1.67
RN7SKP173-201ENST00000362821 IGKV2-30P06310 120 aa4.62□□□□□ -1.67
RN7SKP173-201ENST00000362821 C7orf65Q6ZTY9 151 aa4.61□□□□□ -1.67
RN7SKP173-201ENST00000362821 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa4.6□□□□□ -1.67
RN7SKP173-201ENST00000362821 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.6□□□□□ -1.67
RN7SKP173-201ENST00000362821 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP4.59□□□□□ -1.67
RN7SKP173-201ENST00000362821 H7BZZ5 65 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP173-201ENST00000362821 PCOTHQ58A44 107 aa4.58□□□□□ -1.68
RN7SKP173-201ENST00000362821 SPINK7P58062 85 aa4.57□□□□□ -1.68
RN7SKP173-201ENST00000362821 TMEM258P61165 79 aa4.56□□□□□ -1.68
RN7SKP173-201ENST00000362821 HERC1Q15751 4861 aa4.56□□□□□ -1.68
RN7SKP173-201ENST00000362821 HMCN2Q8NDA2 5059 aa4.53□□□□□ -1.68
RN7SKP173-201ENST00000362821 HRES1P13985 223 aa4.53□□□□□ -1.68
RN7SKP173-201ENST00000362821 ATP5EP56381 51 aaPredicted RBP4.53□□□□□ -1.68
RN7SKP173-201ENST00000362821 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa4.53□□□□□ -1.68
RN7SKP173-201ENST00000362821 LPAP08519 4548 aa4.53□□□□□ -1.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 FAM236DA0A1B0GTK5 79 aa4.52□□□□□ -1.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 FAM236CP0DP71 79 aa4.52□□□□□ -1.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 LRP2P98164 4655 aa4.5□□□□□ -1.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 C4orf26Q17RF5 130 aa4.48□□□□□ -1.69
RN7SKP173-201ENST00000362821 A8MUN3 132 aa4.45□□□□□ -1.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 DMAC1Q96GE9 116 aa4.45□□□□□ -1.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 COX6B2Q6YFQ2 88 aa4.44□□□□□ -1.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa4.44□□□□□ -1.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 ACYP2P14621 99 aa4.43□□□□□ -1.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 MUC17Q685J3 4493 aa4.41□□□□□ -1.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa4.41□□□□□ -1.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 SERP1Q9Y6X1 66 aa4.41□□□□□ -1.7
RN7SKP173-201ENST00000362821 MPLKIPQ8TAP9 179 aa4.4□□□□□ -1.71
RN7SKP173-201ENST00000362821 COA5Q86WW8 74 aa4.39□□□□□ -1.71
RN7SKP173-201ENST00000362821 CHKB-CPT1BH3BT56 60 aa4.38□□□□□ -1.71
RN7SKP173-201ENST00000362821 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.38□□□□□ -1.71
RN7SKP173-201ENST00000362821 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.36□□□□□ -1.71
RN7SKP173-201ENST00000362821 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.35□□□□□ -1.71
RN7SKP173-201ENST00000362821 UBR4Q5T4S7 5183 aa4.34□□□□□ -1.71
RN7SKP173-201ENST00000362821 SPTSSBQ8NFR3 76 aa4.33□□□□□ -1.72
RN7SKP173-201ENST00000362821 S4R3F8 94 aa4.32□□□□□ -1.72
RN7SKP173-201ENST00000362821 SMIM26A0A096LP01 95 aa4.29□□□□□ -1.72
RN7SKP173-201ENST00000362821 LCA10Q71F78 164 aa4.28□□□□□ -1.72
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 68.4 ms