RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000291574.8

TRAPPC10-201, Transcript of trafficking protein particle complex 10, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene TRAPPC10, Length 6,976 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAPPC10-201ENST00000291574 MYO15AQ9UKN7 3530 aa7.94□□□□□ -1.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.91□□□□□ -1.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP7.9□□□□□ -1.142e-7■■■□□ 16.1
TRAPPC10-201ENST00000291574 A6NN06 94 aa7.9□□□□□ -1.14
TRAPPC10-201ENST00000291574 LCE6AA0A183 80 aa7.89□□□□□ -1.15
TRAPPC10-201ENST00000291574 M0R2T5 61 aa7.89□□□□□ -1.15
TRAPPC10-201ENST00000291574 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A0A0MQY5 61 aa7.88□□□□□ -1.15
TRAPPC10-201ENST00000291574 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.87□□□□□ -1.15
TRAPPC10-201ENST00000291574 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP7.87□□□□□ -1.15
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC10-201ENST00000291574 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.86□□□□□ -1.15
TRAPPC10-201ENST00000291574 NF1P21359 2839 aa7.85□□□□□ -1.15
TRAPPC10-201ENST00000291574 M0QZ58 72 aa7.84□□□□□ -1.15
TRAPPC10-201ENST00000291574 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.83□□□□□ -1.16
TRAPPC10-201ENST00000291574 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa7.82□□□□□ -1.16
TRAPPC10-201ENST00000291574 USP34Q70CQ2 3546 aa7.81□□□□□ -1.16
TRAPPC10-201ENST00000291574 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP7.78□□□□□ -1.16
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q5VSD8 79 aa7.77□□□□□ -1.16
TRAPPC10-201ENST00000291574 TENM4Q6N022 2769 aa7.77□□□□□ -1.17
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa7.75□□□□□ -1.17
TRAPPC10-201ENST00000291574 FBN2P35556 2912 aa7.74□□□□□ -1.17
TRAPPC10-201ENST00000291574 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP7.72□□□□□ -1.17
TRAPPC10-201ENST00000291574 DCHS1Q96JQ0 3298 aa7.72□□□□□ -1.17
TRAPPC10-201ENST00000291574 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP7.71□□□□□ -1.17
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.69□□□□□ -1.18
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.68□□□□□ -1.18
TRAPPC10-201ENST00000291574 MXRA5Q9NR99 2828 aa7.66□□□□□ -1.18
TRAPPC10-201ENST00000291574 TENM3Q9P273 2699 aa7.65□□□□□ -1.18
TRAPPC10-201ENST00000291574 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa7.62□□□□□ -1.19
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa7.62□□□□□ -1.19
TRAPPC10-201ENST00000291574 NDUFAF8A1L188 74 aa7.61□□□□□ -1.19
TRAPPC10-201ENST00000291574 A8MUU9 505 aa7.54□□□□□ -1.2
TRAPPC10-201ENST00000291574 RPS29P62273 56 aaKnown RBP7.52□□□□□ -1.2
TRAPPC10-201ENST00000291574 MUC3AQ02505 3323 aa7.51□□□□□ -1.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 RELNP78509 3460 aa7.49□□□□□ -1.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 ASPMQ8IZT6 3477 aa7.48□□□□□ -1.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 PLAC4Q8WY50 150 aa7.48□□□□□ -1.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 TENM1Q9UKZ4 2725 aa7.48□□□□□ -1.21
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZFHX4Q86UP3 3567 aa7.44□□□□□ -1.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa7.42□□□□□ -1.22
TRAPPC10-201ENST00000291574 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.4□□□□□ -1.23
TRAPPC10-201ENST00000291574 LAMA5O15230 3695 aa7.39□□□□□ -1.23
TRAPPC10-201ENST00000291574 TGP01266 2768 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC10-201ENST00000291574 C10orf95Q9H7T3 257 aa7.38□□□□□ -1.23
TRAPPC10-201ENST00000291574 PDZD2O15018 2839 aa7.36□□□□□ -1.23
TRAPPC10-201ENST00000291574 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.35□□□□□ -1.23
TRAPPC10-201ENST00000291574 H0YAA0 97 aa7.32□□□□□ -1.24
TRAPPC10-201ENST00000291574 DMDP11532 3685 aa7.29□□□□□ -1.24
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa7.28□□□□□ -1.24
TRAPPC10-201ENST00000291574 VWFP04275 2813 aa7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP7.26□□□□□ -1.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 TNP1P09430 55 aa7.24□□□□□ -1.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 TENM2Q9NT68 2774 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 CSMD1Q96PZ7 3565 aa7.22□□□□□ -1.25
TRAPPC10-201ENST00000291574 XP32Q5T750 250 aa7.15□□□□□ -1.26
TRAPPC10-201ENST00000291574 P0C880 135 aa7.13□□□□□ -1.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 CUBNO60494 3623 aa7.12□□□□□ -1.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 SVEP1Q4LDE5 3571 aa7.11□□□□□ -1.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP7.11□□□□□ -1.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 FBN1P35555 2871 aaKnown RBP7.1□□□□□ -1.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP10-8P60410 259 aa7.09□□□□□ -1.27
TRAPPC10-201ENST00000291574 PP632Q6XCG6 107 aa7.06□□□□□ -1.28
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa7.03□□□□□ -1.28
TRAPPC10-201ENST00000291574 A0A1B0GVY2 172 aa7.02□□□□□ -1.29
TRAPPC10-201ENST00000291574 OTOGQ6ZRI0 2925 aa7□□□□□ -1.29
TRAPPC10-201ENST00000291574 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.92□□□□□ -1.3
TRAPPC10-201ENST00000291574 FBN3Q75N90 2809 aa6.88□□□□□ -1.31
TRAPPC10-201ENST00000291574 TPRXLQ17RH7 258 aa6.87□□□□□ -1.31
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP12-2P59991 146 aa6.83□□□□□ -1.32
TRAPPC10-201ENST00000291574 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.77□□□□□ -1.33
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP10-10P60014 251 aa6.77□□□□□ -1.33
TRAPPC10-201ENST00000291574 COL7A1Q02388 2944 aa6.76□□□□□ -1.33
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP21-3Q3LHN1 58 aa6.75□□□□□ -1.33
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZFHX3Q15911 3703 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.73□□□□□ -1.33
TRAPPC10-201ENST00000291574 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.72□□□□□ -1.33
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP12-1P59990 96 aa6.7□□□□□ -1.34
TRAPPC10-201ENST00000291574 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.69□□□□□ -1.34
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.6□□□□□ -1.35
TRAPPC10-201ENST00000291574 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.56□□□□□ -1.36
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP6.55□□□□□ -1.36
TRAPPC10-201ENST00000291574 BSNQ9UPA5 3926 aa6.52□□□□□ -1.37
TRAPPC10-201ENST00000291574 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.48□□□□□ -1.37
TRAPPC10-201ENST00000291574 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.31□□□□□ -1.4
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC10-201ENST00000291574 VPS13CQ709C8 3753 aa6.3□□□□□ -1.4
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa6.28□□□□□ -1.4
TRAPPC10-201ENST00000291574 MT1HL1P0DM35 61 aa6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC10-201ENST00000291574 CSMD3Q7Z407 3707 aa6.13□□□□□ -1.43
TRAPPC10-201ENST00000291574 ZNF469Q96JG9 3925 aaPredicted RBP6.1□□□□□ -1.43
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP6□□□□□ -1.45
TRAPPC10-201ENST00000291574 INE1O15225 51 aa5.99□□□□□ -1.45
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP10-12P60413 245 aa5.96□□□□□ -1.46
TRAPPC10-201ENST00000291574 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.94□□□□□ -1.46
TRAPPC10-201ENST00000291574 AKAP9Q99996 3911 aa5.92□□□□□ -1.46
TRAPPC10-201ENST00000291574 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.9□□□□□ -1.47
TRAPPC10-201ENST00000291574 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.89□□□□□ -1.47
TRAPPC10-201ENST00000291574 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.88□□□□□ -1.47
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