RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000261266.9

PTPRB-201, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

APPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC

Gene PTPRB, Length 6,110 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa4.31□□□□□ -1.72
PTPRB-201ENST00000261266 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP4.3□□□□□ -1.72
PTPRB-201ENST00000261266 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP4.29□□□□□ -1.72
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP23-1A1A580 65 aa4.28□□□□□ -1.72
PTPRB-201ENST00000261266 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP4.28□□□□□ -1.73
PTPRB-201ENST00000261266 DSPP15924 2871 aaKnown RBP4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-201ENST00000261266 TENM4Q6N022 2769 aa4.27□□□□□ -1.73
PTPRB-201ENST00000261266 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP4.26□□□□□ -1.73
PTPRB-201ENST00000261266 SZT2Q5T011 3432 aa4.26□□□□□ -1.73
PTPRB-201ENST00000261266 C5orf42Q9H799 3197 aa4.25□□□□□ -1.73
PTPRB-201ENST00000261266 FLNCQ14315 2725 aa4.24□□□□□ -1.73
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP10-6P60371 365 aaPredicted RBP4.23□□□□□ -1.73
PTPRB-201ENST00000261266 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa4.23□□□□□ -1.73
PTPRB-201ENST00000261266 ALMS1Q8TCU4 4167 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRB-201ENST00000261266 COL6A3P12111 3177 aa4.22□□□□□ -1.73
PTPRB-201ENST00000261266 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP4.21□□□□□ -1.74
PTPRB-201ENST00000261266 LAMA1P25391 3075 aa4.21□□□□□ -1.74
PTPRB-201ENST00000261266 TRIOO75962 3097 aa4.19□□□□□ -1.74
PTPRB-201ENST00000261266 UNC80Q8N2C7 3258 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRB-201ENST00000261266 INE1O15225 51 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRB-201ENST00000261266 MT1HL1P0DM35 61 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRB-201ENST00000261266 CDH23Q9H251 3354 aa4.17□□□□□ -1.74
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa4.15□□□□□ -1.75
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP4.13□□□□□ -1.75
PTPRB-201ENST00000261266 VCANP13611 3396 aa4.13□□□□□ -1.75
PTPRB-201ENST00000261266 USP34Q70CQ2 3546 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRB-201ENST00000261266 CFAP54Q96N23 3096 aa4.11□□□□□ -1.75
PTPRB-201ENST00000261266 LRBAP50851 2863 aa4.1□□□□□ -1.75
PTPRB-201ENST00000261266 XIRP2A4UGR9 3374 aa4.09□□□□□ -1.75
PTPRB-201ENST00000261266 WDFY4Q6ZS81 3184 aa4.08□□□□□ -1.76
PTPRB-201ENST00000261266 EYSQ5T1H1 3165 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRB-201ENST00000261266 PDZD2O15018 2839 aa4.04□□□□□ -1.76
PTPRB-201ENST00000261266 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP4.03□□□□□ -1.76
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP10-12P60413 245 aa4.03□□□□□ -1.76
PTPRB-201ENST00000261266 VPS13AQ96RL7 3174 aa4.02□□□□□ -1.77
PTPRB-201ENST00000261266 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP4.01□□□□□ -1.77
PTPRB-201ENST00000261266 LCE2BO14633 110 aa3.99□□□□□ -1.77
PTPRB-201ENST00000261266 FRYLO94915 3013 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRB-201ENST00000261266 DNAH2Q9P225 4427 aa3.98□□□□□ -1.77
PTPRB-201ENST00000261266 FRYQ5TBA9 3013 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRB-201ENST00000261266 TENM2Q9NT68 2774 aa3.96□□□□□ -1.78
PTPRB-201ENST00000261266 REV3LO60673 3130 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRB-201ENST00000261266 MXRA5Q9NR99 2828 aa3.95□□□□□ -1.78
PTPRB-201ENST00000261266 DMXL1Q9Y485 3027 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRB-201ENST00000261266 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP3.94□□□□□ -1.78
PTPRB-201ENST00000261266 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRB-201ENST00000261266 ATMQ13315 3056 aa3.94□□□□□ -1.78
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP19-4Q3LI73 84 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRB-201ENST00000261266 COL12A1Q99715 3063 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRB-201ENST00000261266 MUC3AQ02505 3323 aa3.92□□□□□ -1.78
PTPRB-201ENST00000261266 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP3.91□□□□□ -1.78
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PTPRB-201ENST00000261266 LCE2CQ5TA81 110 aa3.89□□□□□ -1.79
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PTPRB-201ENST00000261266 TENM1Q9UKZ4 2725 aa3.88□□□□□ -1.79
PTPRB-201ENST00000261266 TENM3Q9P273 2699 aa3.87□□□□□ -1.79
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PTPRB-201ENST00000261266 NBEAQ8NFP9 2946 aa3.86□□□□□ -1.79
PTPRB-201ENST00000261266 NF1P21359 2839 aa3.86□□□□□ -1.79
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PTPRB-201ENST00000261266 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa3.85□□□□□ -1.79
PTPRB-201ENST00000261266 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa3.84□□□□□ -1.79
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PTPRB-201ENST00000261266 ZZEF1O43149 2961 aa3.84□□□□□ -1.8
PTPRB-201ENST00000261266 TACC2O95359 2948 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRB-201ENST00000261266 ZANQ9Y493 2812 aa3.83□□□□□ -1.8
PTPRB-201ENST00000261266 TGP01266 2768 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRB-201ENST00000261266 DNAH14Q0VDD8 3507 aa3.82□□□□□ -1.8
PTPRB-201ENST00000261266 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa3.81□□□□□ -1.8
PTPRB-201ENST00000261266 CELSR2Q9HCU4 2923 aa3.8□□□□□ -1.8
PTPRB-201ENST00000261266 LCE3AQ5TA76 89 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRB-201ENST00000261266 DNAH10Q8IVF4 4471 aa3.79□□□□□ -1.8
PTPRB-201ENST00000261266 OTOGQ6ZRI0 2925 aa3.78□□□□□ -1.8
PTPRB-201ENST00000261266 DNAH1Q9P2D7 4330 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRB-201ENST00000261266 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa3.77□□□□□ -1.81
PTPRB-201ENST00000261266 MYO15AQ9UKN7 3530 aa3.75□□□□□ -1.81
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa3.75□□□□□ -1.81
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PTPRB-201ENST00000261266 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRB-201ENST00000261266 CELSR1Q9NYQ6 3014 aa3.71□□□□□ -1.82
PTPRB-201ENST00000261266 SPEGQ15772 3267 aa3.71□□□□□ -1.82
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PTPRB-201ENST00000261266 DNAH6Q9C0G6 4158 aa3.69□□□□□ -1.82
PTPRB-201ENST00000261266 LOC400499M0QZD8 3231 aa3.68□□□□□ -1.82
PTPRB-201ENST00000261266 KRTAP8-1Q8IUC2 63 aa3.67□□□□□ -1.82
PTPRB-201ENST00000261266 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP3.66□□□□□ -1.82
PTPRB-201ENST00000261266 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa3.65□□□□□ -1.82
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PTPRB-201ENST00000261266 LORP23490 312 aaPredicted RBP3.65□□□□□ -1.83
PTPRB-201ENST00000261266 DNAH11Q96DT5 4516 aa3.64□□□□□ -1.83
PTPRB-201ENST00000261266 VWFP04275 2813 aa3.63□□□□□ -1.83
PTPRB-201ENST00000261266 DNAH9Q9NYC9 4486 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRB-201ENST00000261266 DMDP11532 3685 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRB-201ENST00000261266 DNAH17Q9UFH2 4485 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRB-201ENST00000261266 MYCBP2O75592 4640 aa3.62□□□□□ -1.83
PTPRB-201ENST00000261266 HERC1Q15751 4861 aa3.61□□□□□ -1.83
PTPRB-201ENST00000261266 FBN3Q75N90 2809 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRB-201ENST00000261266 LAMA5O15230 3695 aa3.6□□□□□ -1.83
PTPRB-201ENST00000261266 MT2AP02795 61 aa3.59□□□□□ -1.83
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