RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000259351.9

RALGPS1-201, Transcript of Ral GEF with PH domain and SH3 binding motif 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene RALGPS1, Length 6,336 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RALGPS1-201ENST00000259351 EYSQ5T1H1 3165 aa7.48□□□□□ -1.21
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RALGPS1-201ENST00000259351 DCHS2Q6V1P9 2916 aa7.47□□□□□ -1.21
RALGPS1-201ENST00000259351 H3BS24 57 aa7.46□□□□□ -1.22
RALGPS1-201ENST00000259351 SPEGQ15772 3267 aa7.46□□□□□ -1.22
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa7.45□□□□□ -1.22
RALGPS1-201ENST00000259351 ZANQ9Y493 2812 aa7.45□□□□□ -1.22
RALGPS1-201ENST00000259351 ROMO1P60602 79 aa7.44□□□□□ -1.22
RALGPS1-201ENST00000259351 ADM2Q7Z4H4 148 aa7.4□□□□□ -1.22
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RALGPS1-201ENST00000259351 A8MU10 97 aa7.32□□□□□ -1.24
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa7.31□□□□□ -1.24
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RALGPS1-201ENST00000259351 MYO15AQ9UKN7 3530 aa7.3□□□□□ -1.24
RALGPS1-201ENST00000259351 FBN2P35556 2912 aa7.29□□□□□ -1.24
RALGPS1-201ENST00000259351 TENM3Q9P273 2699 aa7.28□□□□□ -1.24
RALGPS1-201ENST00000259351 NF1P21359 2839 aa7.28□□□□□ -1.24
RALGPS1-201ENST00000259351 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa7.27□□□□□ -1.25
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa7.26□□□□□ -1.25
RALGPS1-201ENST00000259351 DMXL1Q9Y485 3027 aa7.25□□□□□ -1.25
RALGPS1-201ENST00000259351 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP7.23□□□□□ -1.25
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RALGPS1-201ENST00000259351 A6NN06 94 aa7.21□□□□□ -1.26
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RALGPS1-201ENST00000259351 A8MUU9 505 aa7.17□□□□□ -1.26
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RALGPS1-201ENST00000259351 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa7.06□□□□□ -1.28
RALGPS1-201ENST00000259351 PKD1L1Q8TDX9 2849 aa7.06□□□□□ -1.28
RALGPS1-201ENST00000259351 WDFY3Q8IZQ1 3526 aa7.04□□□□□ -1.28
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RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa6.93□□□□□ -1.3
RALGPS1-201ENST00000259351 RELNP78509 3460 aa6.93□□□□□ -1.3
RALGPS1-201ENST00000259351 TGP01266 2768 aa6.91□□□□□ -1.3
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RALGPS1-201ENST00000259351 TNP1P09430 55 aa6.87□□□□□ -1.31
RALGPS1-201ENST00000259351 C10orf95Q9H7T3 257 aa6.87□□□□□ -1.31
RALGPS1-201ENST00000259351 XP32Q5T750 250 aa6.85□□□□□ -1.31
RALGPS1-201ENST00000259351 ASPMQ8IZT6 3477 aa6.83□□□□□ -1.32
RALGPS1-201ENST00000259351 ZFHX4Q86UP3 3567 aa6.81□□□□□ -1.32
RALGPS1-201ENST00000259351 A0A1B0GVY2 172 aa6.81□□□□□ -1.32
RALGPS1-201ENST00000259351 H0YAA0 97 aa6.8□□□□□ -1.32
RALGPS1-201ENST00000259351 SRRM2Q9UQ35 2752 aaKnown RBP6.79□□□□□ -1.32
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RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP10-8P60410 259 aa6.74□□□□□ -1.33
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RALGPS1-201ENST00000259351 TPRXLQ17RH7 258 aa6.62□□□□□ -1.35
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RALGPS1-201ENST00000259351 DMDP11532 3685 aa6.61□□□□□ -1.35
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.59□□□□□ -1.35
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP10-10P60014 251 aa6.57□□□□□ -1.36
RALGPS1-201ENST00000259351 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP6.55□□□□□ -1.36
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RALGPS1-201ENST00000259351 ZFHX3Q15911 3703 aa6.52□□□□□ -1.37
RALGPS1-201ENST00000259351 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa6.49□□□□□ -1.37
RALGPS1-201ENST00000259351 FBN3Q75N90 2809 aa6.48□□□□□ -1.37
RALGPS1-201ENST00000259351 SVEP1Q4LDE5 3571 aa6.47□□□□□ -1.37
RALGPS1-201ENST00000259351 OTOGQ6ZRI0 2925 aa6.45□□□□□ -1.38
RALGPS1-201ENST00000259351 MUC3AQ02505 3323 aa6.43□□□□□ -1.38
RALGPS1-201ENST00000259351 COL7A1Q02388 2944 aa6.4□□□□□ -1.39
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP12-2P59991 146 aa6.39□□□□□ -1.39
RALGPS1-201ENST00000259351 MEGF8Q7Z7M0 2845 aa6.37□□□□□ -1.39
RALGPS1-201ENST00000259351 PRO2289Q9P1D8 64 aa6.34□□□□□ -1.39
RALGPS1-201ENST00000259351 CSMD2Q7Z408 3487 aa6.34□□□□□ -1.39
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP3-1Q9BYR8 98 aa6.29□□□□□ -1.4
RALGPS1-201ENST00000259351 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP6.28□□□□□ -1.4
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RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP13-4Q3LI77 160 aa6.18□□□□□ -1.42
RALGPS1-201ENST00000259351 TRRAPQ9Y4A5 3859 aa6.16□□□□□ -1.42
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RALGPS1-201ENST00000259351 ANK3Q12955 4377 aaKnown RBP6.04□□□□□ -1.44
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP15-1Q3LI76 137 aa5.95□□□□□ -1.46
RALGPS1-201ENST00000259351 MT1HL1P0DM35 61 aa5.92□□□□□ -1.46
RALGPS1-201ENST00000259351 BSNQ9UPA5 3926 aa5.89□□□□□ -1.47
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP3-2Q9BYR7 98 aa5.87□□□□□ -1.47
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP3-3Q9BYR6 98 aa5.87□□□□□ -1.47
RALGPS1-201ENST00000259351 VPS13CQ709C8 3753 aa5.82□□□□□ -1.48
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP4-5Q9BYR2 181 aa5.8□□□□□ -1.48
RALGPS1-201ENST00000259351 CSMD3Q7Z407 3707 aa5.79□□□□□ -1.48
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP10-4P60372 401 aaPredicted RBP5.75□□□□□ -1.49
RALGPS1-201ENST00000259351 HUWE1Q7Z6Z7 4374 aaKnown RBP5.71□□□□□ -1.5
RALGPS1-201ENST00000259351 CRCT1Q9UGL9 99 aa5.69□□□□□ -1.5
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP10-12P60413 245 aa5.68□□□□□ -1.5
RALGPS1-201ENST00000259351 LORP23490 312 aaPredicted RBP5.61□□□□□ -1.51
RALGPS1-201ENST00000259351 KRTAP12-3P60328 96 aa5.56□□□□□ -1.52
RALGPS1-201ENST00000259351 LCE3AQ5TA76 89 aa5.53□□□□□ -1.52
RALGPS1-201ENST00000259351 INE1O15225 51 aa5.49□□□□□ -1.53
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