RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000571185.1

ITGAE-204, Transcript of integrin subunit alpha E, humanhuman

TSL 3

Gene ITGAE, Length 1,004 nt, Biotype processed transcript, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAE-204ENST00000571185 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa9.07□□□□□ -0.96
ITGAE-204ENST00000571185 CLEC2BQ92478 149 aa9.07□□□□□ -0.96
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ITGAE-204ENST00000571185 C4orf48Q5BLP8 95 aa9.03□□□□□ -0.96
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ITGAE-204ENST00000571185 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa8.87□□□□□ -0.99
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ITGAE-204ENST00000571185 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.83□□□□□ -1
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ITGAE-204ENST00000571185 MTURNQ8N3F0 131 aa8.73□□□□□ -1.01
ITGAE-204ENST00000571185 DSCR8Q96T75 97 aa8.73□□□□□ -1.01
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ITGAE-204ENST00000571185 A0A087WSZ3 146 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGAE-204ENST00000571185 A0A0U1RQV1 116 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGAE-204ENST00000571185 H3BT86 120 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGAE-204ENST00000571185 CCKP06307 115 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGAE-204ENST00000571185 CDIP1Q9H305 208 aa8.71□□□□□ -1.02
ITGAE-204ENST00000571185 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGAE-204ENST00000571185 SS18L2Q9UHA2 77 aa8.7□□□□□ -1.02
ITGAE-204ENST00000571185 K7EP34 96 aa8.69□□□□□ -1.02
ITGAE-204ENST00000571185 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGAE-204ENST00000571185 VPS25Q9BRG1 176 aa8.67□□□□□ -1.02
ITGAE-204ENST00000571185 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGAE-204ENST00000571185 Q6ZQT0 140 aa8.65□□□□□ -1.02
ITGAE-204ENST00000571185 C14orf132Q9NPU4 83 aa8.65□□□□□ -1.02
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ITGAE-204ENST00000571185 Q96NJ1 140 aa8.62□□□□□ -1.03
ITGAE-204ENST00000571185 PRO0461Q9UI25 63 aa8.62□□□□□ -1.03
ITGAE-204ENST00000571185 MUC17Q685J3 4493 aa8.61□□□□□ -1.03
ITGAE-204ENST00000571185 C9orf92A6NGG3 77 aa8.6□□□□□ -1.03
ITGAE-204ENST00000571185 XP32Q5T750 250 aa8.57□□□□□ -1.04
ITGAE-204ENST00000571185 C21orf62-AS1Q17RA5 79 aa8.56□□□□□ -1.04
ITGAE-204ENST00000571185 A0A1B0GW54 56 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGAE-204ENST00000571185 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.55□□□□□ -1.04
ITGAE-204ENST00000571185 SIGMAR1Q99720 223 aa8.54□□□□□ -1.04
ITGAE-204ENST00000571185 IGKV4-1P06312 121 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGAE-204ENST00000571185 DEFB116Q30KQ4 102 aa8.53□□□□□ -1.04
ITGAE-204ENST00000571185 F8W1H4 67 aa8.52□□□□□ -1.05
ITGAE-204ENST00000571185 LCE2AQ5TA79 106 aaPredicted RBP8.52□□□□□ -1.05
ITGAE-204ENST00000571185 SEC61BP60468 96 aaKnown RBP8.48□□□□□ -1.05
ITGAE-204ENST00000571185 FAT4Q6V0I7 4981 aa8.48□□□□□ -1.05
ITGAE-204ENST00000571185 J3KT08 172 aa8.46□□□□□ -1.06
ITGAE-204ENST00000571185 A0A1B0GV90 55 aa8.45□□□□□ -1.06
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