RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000550358.5

PTPRB-208, Transcript of protein tyrosine phosphatase, receptor type B, humanhuman

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Gene PTPRB, Length 6,583 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Endoplasmic reticulum, Nucleus .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRB-208ENST00000550358 Q5VSD8 79 aa5.14□□□□□ -1.59
PTPRB-208ENST00000550358 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP5.13□□□□□ -1.59
PTPRB-208ENST00000550358 TRIOO75962 3097 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRB-208ENST00000550358 UNC79Q9P2D8 2635 aa5.13□□□□□ -1.59
PTPRB-208ENST00000550358 CAMK2N1Q7Z7J9 78 aa5.12□□□□□ -1.59
PTPRB-208ENST00000550358 LUZP6Q538Z0 58 aa5.11□□□□□ -1.59
PTPRB-208ENST00000550358 FASNP49327 2511 aaKnown RBP5.1□□□□□ -1.59
PTPRB-208ENST00000550358 SZT2Q5T011 3432 aa5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP5.09□□□□□ -1.59
PTPRB-208ENST00000550358 A0A0D9SG42 100 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-208ENST00000550358 Q8NDZ9 215 aa5.09□□□□□ -1.6
PTPRB-208ENST00000550358 SPINK7P58062 85 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-208ENST00000550358 FN1P02751 2386 aaKnown RBP5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-208ENST00000550358 M0R2T5 61 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP10-1P60331 282 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-208ENST00000550358 LINC01554Q52M75 96 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-208ENST00000550358 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa5.08□□□□□ -1.6
PTPRB-208ENST00000550358 Q5XG85 94 aa5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-208ENST00000550358 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-208ENST00000550358 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP5.07□□□□□ -1.6
PTPRB-208ENST00000550358 TLN2Q9Y4G6 2542 aa5.05□□□□□ -1.6
PTPRB-208ENST00000550358 JMJD1CQ15652 2540 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-208ENST00000550358 FLNCQ14315 2725 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-208ENST00000550358 COL6A3P12111 3177 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-208ENST00000550358 BPTFQ12830 3046 aa5.04□□□□□ -1.6
PTPRB-208ENST00000550358 CFAP54Q96N23 3096 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRB-208ENST00000550358 CDH23Q9H251 3354 aa5.02□□□□□ -1.61
PTPRB-208ENST00000550358 DSPP15924 2871 aaKnown RBP5.02□□□□□ -1.61
PTPRB-208ENST00000550358 R4GN34 69 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP10-2P60368 255 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRB-208ENST00000550358 F8P00451 2351 aa5.01□□□□□ -1.61
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP5□□□□□ -1.61
PTPRB-208ENST00000550358 C5orf42Q9H799 3197 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-208ENST00000550358 RPL37P61927 97 aaKnown RBP4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-208ENST00000550358 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa4.99□□□□□ -1.61
PTPRB-208ENST00000550358 Q6ZRN7 208 aaPredicted RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-208ENST00000550358 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP4.98□□□□□ -1.61
PTPRB-208ENST00000550358 A0A0C4DFX4 3053 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-208ENST00000550358 Q5VV11 94 aa4.97□□□□□ -1.61
PTPRB-208ENST00000550358 HECTD1Q9ULT8 2610 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-208ENST00000550358 ROMO1P60602 79 aa4.96□□□□□ -1.62
PTPRB-208ENST00000550358 UNC80Q8N2C7 3258 aa4.95□□□□□ -1.62
PTPRB-208ENST00000550358 PLAC4Q8WY50 150 aa4.94□□□□□ -1.62
PTPRB-208ENST00000550358 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP4.93□□□□□ -1.62
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa4.92□□□□□ -1.62
PTPRB-208ENST00000550358 DMXL1Q9Y485 3027 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-208ENST00000550358 MAST4O15021 2626 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-208ENST00000550358 XIRP2A4UGR9 3374 aa4.91□□□□□ -1.62
PTPRB-208ENST00000550358 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP4.9□□□□□ -1.62
PTPRB-208ENST00000550358 M0QZ58 72 aa4.9□□□□□ -1.63
PTPRB-208ENST00000550358 PANO1I0J062 215 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-208ENST00000550358 KALRNO60229 2985 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-208ENST00000550358 BAHCC1Q9P281 2608 aa4.89□□□□□ -1.63
PTPRB-208ENST00000550358 MTORP42345 2549 aa4.88□□□□□ -1.63
PTPRB-208ENST00000550358 A0A0A0MQY5 61 aa4.87□□□□□ -1.63
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PTPRB-208ENST00000550358 SPATA8Q6RVD6 105 aa4.86□□□□□ -1.63
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PTPRB-208ENST00000550358 POLQO75417 2590 aa4.85□□□□□ -1.63
PTPRB-208ENST00000550358 EYSQ5T1H1 3165 aa4.84□□□□□ -1.64
PTPRB-208ENST00000550358 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa4.82□□□□□ -1.64
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PTPRB-208ENST00000550358 FRYQ5TBA9 3013 aa4.82□□□□□ -1.64
PTPRB-208ENST00000550358 APCP25054 2843 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-208ENST00000550358 CYSTM1Q9H1C7 97 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-208ENST00000550358 FRYLO94915 3013 aa4.81□□□□□ -1.64
PTPRB-208ENST00000550358 NOTCH2NLQ7Z3S9 236 aa4.8□□□□□ -1.64
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PTPRB-208ENST00000550358 ITPR3Q14573 2671 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-208ENST00000550358 NSD1Q96L73 2696 aaPredicted RBP4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa4.8□□□□□ -1.64
PTPRB-208ENST00000550358 A8MUU9 505 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP7-1Q8IUC3 87 aa4.79□□□□□ -1.64
PTPRB-208ENST00000550358 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa4.79□□□□□ -1.64
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PTPRB-208ENST00000550358 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP4.77□□□□□ -1.65
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PTPRB-208ENST00000550358 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-208ENST00000550358 WDFY4Q6ZS81 3184 aa4.75□□□□□ -1.65
PTPRB-208ENST00000550358 LAMA1P25391 3075 aa4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-208ENST00000550358 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP4.74□□□□□ -1.65
PTPRB-208ENST00000550358 HIVEP1P15822 2718 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-208ENST00000550358 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-208ENST00000550358 VPS13AQ96RL7 3174 aa4.73□□□□□ -1.65
PTPRB-208ENST00000550358 VCANP13611 3396 aa4.71□□□□□ -1.65
PTPRB-208ENST00000550358 PRAC1Q96KF2 57 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRB-208ENST00000550358 TEX15Q9BXT5 2789 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRB-208ENST00000550358 DCHS1Q96JQ0 3298 aa4.7□□□□□ -1.66
PTPRB-208ENST00000550358 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP4.69□□□□□ -1.66
PTPRB-208ENST00000550358 FBN2P35556 2912 aa4.69□□□□□ -1.66
PTPRB-208ENST00000550358 OTOGQ6ZRI0 2925 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRB-208ENST00000550358 USP34Q70CQ2 3546 aa4.68□□□□□ -1.66
PTPRB-208ENST00000550358 FREM2Q5SZK8 3169 aa4.67□□□□□ -1.66
PTPRB-208ENST00000550358 NBEAQ8NFP9 2946 aa4.66□□□□□ -1.66
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