RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000533179.1

SOX9-AS1-211, SOX9 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 3 BASIC

Gene SOX9-AS1, Length 460 nt, Biotype lincRNA, Subcellular localisation Cytoplasm .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UBE2DNLQ8IWF7 75 aa3.62□□□□□ -1.83
SOX9-AS1-211ENST00000533179 USMG5Q96IX5 58 aa3.62□□□□□ -1.83
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZFHX4Q86UP3 3567 aa3.61□□□□□ -1.83
SOX9-AS1-211ENST00000533179 COX6A2Q02221 97 aa3.61□□□□□ -1.83
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa3.61□□□□□ -1.83
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ANKRD11Q6UB99 2663 aaPredicted RBP3.6□□□□□ -1.83
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ACACAQ13085 2346 aa3.6□□□□□ -1.83
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KRTAP10-9P60411 292 aa3.6□□□□□ -1.83
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DMXL2Q8TDJ6 3036 aa3.6□□□□□ -1.83
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ATMQ13315 3056 aa3.6□□□□□ -1.83
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DSPP15924 2871 aaKnown RBP3.6□□□□□ -1.83
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRPF8Q6P2Q9 2335 aaKnown RBP eCLIP3.59□□□□□ -1.83
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RPL37P61927 97 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.83
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KRTAP13-2Q52LG2 175 aa3.59□□□□□ -1.83
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PIEZO2Q9H5I5 2752 aa3.59□□□□□ -1.83
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ASPMQ8IZT6 3477 aa3.59□□□□□ -1.83
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SPENQ96T58 3664 aaKnown RBP3.59□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 USF3Q68DE3 2245 aa3.59□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ICE1Q9Y2F5 2266 aa3.59□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 H3BUA1 57 aa3.58□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 J3QKU1 62 aa3.58□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa3.58□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DCHS1Q96JQ0 3298 aa3.57□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DEFB131AP59861 70 aa3.57□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRR9Q5T870 116 aa3.57□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PRRC2CQ9Y520 2896 aaKnown RBP3.57□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SPTBN2O15020 2390 aa3.56□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KLK9Q2XQG4 91 aa3.56□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PLCE1Q9P212 2302 aa3.56□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DOPEY2Q9Y3R5 2298 aa3.56□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGF2RP11717 2491 aa3.55□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 BSNQ9UPA5 3926 aa3.55□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RHPN1-AS1Q9BWJ2 59 aa3.55□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa3.55□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KALRNO60229 2985 aa3.55□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PCNX1Q96RV3 2341 aa3.55□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PKDREJQ9NTG1 2253 aa3.55□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 COL6A6A6NMZ7 2263 aa3.54□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 Q6ZSA8 131 aa3.54□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RP1L1Q8IWN7 2480 aaPredicted RBP3.53□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CEP295Q9C0D2 2601 aa3.53□□□□□ -1.84
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa3.52□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LRBAP50851 2863 aa3.52□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ROS1P08922 2347 aa3.52□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LAMA5O15230 3695 aa3.51□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DEFB1P60022 68 aa3.51□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DEFB136Q30KP8 78 aa3.51□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ANKHD1Q8IWZ3 2542 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TLN1Q9Y490 2541 aaKnown RBP3.51□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HRNRQ86YZ3 2850 aaPredicted RBP3.51□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa3.51□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ITPR1Q14643 2758 aa3.5□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 H1FX-AS1Q4G0G2 97 aa3.5□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LCE1FQ5T754 118 aa3.5□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NCOR2Q9Y618 2525 aa3.5□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ATRXP46100 2492 aa3.5□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NBEAQ8NFP9 2946 aa3.5□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZZEF1O43149 2961 aa3.48□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NAV3Q8IVL0 2385 aa3.48□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TOMM7Q9P0U1 55 aa3.48□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 MAP1BP46821 2468 aaKnown RBP3.48□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SPTBN4Q9H254 2564 aa3.48□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DCHS2Q6V1P9 2916 aa3.47□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HIVEP3Q5T1R4 2406 aa3.47□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 HTN1P15515 57 aa3.47□□□□□ -1.85
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PKD1L2Q7Z442 2459 aa3.46□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CACNA1BQ00975 2339 aa3.46□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UNQ6190/PRO20217Q6UXQ8 127 aa3.46□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SMR3AQ99954 134 aa3.46□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SPTA1P02549 2419 aa3.46□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SMG1Q96Q15 3661 aaKnown RBP3.45□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CHD8Q9HCK8 2581 aa3.45□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-211ENST00000533179 C10orf95Q9H7T3 257 aa3.45□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CACNA1AO00555 2505 aa3.45□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DEFB130BP0DP73 79 aa3.44□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DEFB130AP0DP74 79 aa3.44□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ABCA2Q9BZC7 2435 aa3.44□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-211ENST00000533179 RELNP78509 3460 aa3.43□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DEFB104AQ8WTQ1 72 aa3.43□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-211ENST00000533179 PIEZO1Q92508 2521 aa3.43□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-211ENST00000533179 NBASA2RRP1 2371 aa3.43□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-211ENST00000533179 IGSF10Q6WRI0 2623 aa3.42□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TPRP12270 2363 aaKnown RBP3.42□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-211ENST00000533179 A8MTW9 85 aa3.41□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-211ENST00000533179 SPTBN1Q01082 2364 aaKnown RBP3.4□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-211ENST00000533179 WNK2Q9Y3S1 2297 aa3.4□□□□□ -1.86
SOX9-AS1-211ENST00000533179 DOPEY1Q5JWR5 2465 aa3.4□□□□□ -1.87
SOX9-AS1-211ENST00000533179 LELP1Q5T871 98 aa3.4□□□□□ -1.87
SOX9-AS1-211ENST00000533179 USP24Q9UPU5 2620 aa3.4□□□□□ -1.87
SOX9-AS1-211ENST00000533179 TACC2O95359 2948 aa3.4□□□□□ -1.87
SOX9-AS1-211ENST00000533179 FBN2P35556 2912 aa3.4□□□□□ -1.87
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UBR5O95071 2799 aaPredicted RBP3.4□□□□□ -1.87
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ZNF462Q96JM2 2506 aa3.38□□□□□ -1.87
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KRTAP10-3P60369 221 aa3.38□□□□□ -1.87
SOX9-AS1-211ENST00000533179 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa3.38□□□□□ -1.87
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CLPSL2Q6UWE3 100 aa3.38□□□□□ -1.87
SOX9-AS1-211ENST00000533179 ACACBO00763 2458 aa3.38□□□□□ -1.87
SOX9-AS1-211ENST00000533179 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP3.38□□□□□ -1.87
SOX9-AS1-211ENST00000533179 AKAP6Q13023 2319 aa3.37□□□□□ -1.87
SOX9-AS1-211ENST00000533179 CFAP46Q8IYW2 2715 aa3.37□□□□□ -1.87
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 10.3 ms