RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000532463.5

CTNND1-231, Transcript of catenin delta 1, human

TSL 1 (best) BASIC

Gene CTNND1, Length 5,749 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus .

RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
CTNND1-231	ENST00000532463		A0A096LNT2	108 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNND1-231	ENST00000532463	ADM2	Q7Z4H4	148 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNND1-231	ENST00000532463		A6NN06	94 aa		4.95	□□□□□ -1.62
CTNND1-231	ENST00000532463	KRTAP10-11	P60412	298 aa		4.94	□□□□□ -1.62
CTNND1-231	ENST00000532463	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	4.93	□□□□□ -1.62
CTNND1-231	ENST00000532463	DNAH12	Q6ZR08	3092 aa		4.92	□□□□□ -1.62
CTNND1-231	ENST00000532463	SPRR1B	P22528	89 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTNND1-231	ENST00000532463	COL4A2	P08572	1712 aa		4.91	□□□□□ -1.62
CTNND1-231	ENST00000532463	BRCA2	P51587	3418 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTNND1-231	ENST00000532463	PANO1	I0J062	215 aa		4.9	□□□□□ -1.63
CTNND1-231	ENST00000532463	PCSK5	Q92824	1860 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNND1-231	ENST00000532463	SPRR1A	P35321	89 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNND1-231	ENST00000532463	BPTF	Q12830	3046 aa		4.89	□□□□□ -1.63
CTNND1-231	ENST00000532463		Q6ZR54	194 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNND1-231	ENST00000532463	USP24	Q9UPU5	2620 aa		4.88	□□□□□ -1.63
CTNND1-231	ENST00000532463	PLAC8	Q9NZF1	115 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNND1-231	ENST00000532463	HECTD1	Q9ULT8	2610 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNND1-231	ENST00000532463	C10orf95	Q9H7T3	257 aa		4.87	□□□□□ -1.63
CTNND1-231	ENST00000532463	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		4.86	□□□□□ -1.63
CTNND1-231	ENST00000532463		A0A087X002	238 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTNND1-231	ENST00000532463	KRTAP10-3	P60369	221 aa		4.83	□□□□□ -1.64
CTNND1-231	ENST00000532463	TNP1	P09430	55 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTNND1-231	ENST00000532463		A8MU10	97 aa		4.81	□□□□□ -1.64
CTNND1-231	ENST00000532463	LAMA3	Q16787	3333 aa		4.8	□□□□□ -1.64
CTNND1-231	ENST00000532463	PP632	Q6XCG6	107 aa		4.79	□□□□□ -1.64
CTNND1-231	ENST00000532463	RANBP2	P49792	3224 aa	Known RBP	4.79	□□□□□ -1.64
CTNND1-231	ENST00000532463		A8MUU9	505 aa		4.78	□□□□□ -1.64
CTNND1-231	ENST00000532463	MGAM2	Q2M2H8	2515 aa		4.77	□□□□□ -1.65
CTNND1-231	ENST00000532463	MKI67	P46013	3256 aa	Known RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CTNND1-231	ENST00000532463	DMBT1	Q9UGM3	2413 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CTNND1-231	ENST00000532463	KRTAP29-1	A8MX34	341 aa	Predicted RBP	4.77	□□□□□ -1.65
CTNND1-231	ENST00000532463		A0A0C4DFX4	3053 aa		4.76	□□□□□ -1.65
CTNND1-231	ENST00000532463	KRTAP11-1	Q8IUC1	163 aa		4.75	□□□□□ -1.65
CTNND1-231	ENST00000532463		Q5VSD8	79 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNND1-231	ENST00000532463	C5orf42	Q9H799	3197 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNND1-231	ENST00000532463	CHD7	Q9P2D1	2997 aa		4.74	□□□□□ -1.65
CTNND1-231	ENST00000532463	HTT	P42858	3142 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTNND1-231	ENST00000532463	CFAP54	Q96N23	3096 aa		4.72	□□□□□ -1.65
CTNND1-231	ENST00000532463	HELZ2	Q9BYK8	2649 aa	Known RBP	4.71	□□□□□ -1.66
CTNND1-231	ENST00000532463	ATR	Q13535	2644 aa		4.7	□□□□□ -1.66
CTNND1-231	ENST00000532463	CDH23	Q9H251	3354 aa		4.69	□□□□□ -1.66
CTNND1-231	ENST00000532463	KRTAP4-16	G5E9R7	235 aa	Predicted RBP	4.68	□□□□□ -1.66
CTNND1-231	ENST00000532463	AKAP13	Q12802	2813 aa		4.66	□□□□□ -1.66
CTNND1-231	ENST00000532463	LAMA2	P24043	3122 aa	Known RBP	4.66	□□□□□ -1.66
CTNND1-231	ENST00000532463	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTNND1-231	ENST00000532463	SZT2	Q5T011	3432 aa		4.65	□□□□□ -1.67
CTNND1-231	ENST00000532463	PRUNE2	Q8WUY3	3088 aa		4.64	□□□□□ -1.67
CTNND1-231	ENST00000532463	STAB2	Q8WWQ8	2551 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTNND1-231	ENST00000532463		P0C880	135 aa		4.63	□□□□□ -1.67
CTNND1-231	ENST00000532463	CFAP46	Q8IYW2	2715 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTNND1-231	ENST00000532463	KRTAP1-3	Q8IUG1	177 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTNND1-231	ENST00000532463	XIRP2	A4UGR9	3374 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTNND1-231	ENST00000532463	DNAH14	Q0VDD8	3507 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTNND1-231	ENST00000532463	UNC80	Q8N2C7	3258 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTNND1-231	ENST00000532463	LCE6A	A0A183	80 aa		4.62	□□□□□ -1.67
CTNND1-231	ENST00000532463	MAST4	O15021	2626 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTNND1-231	ENST00000532463	NOTCH2NL	Q7Z3S9	236 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTNND1-231	ENST00000532463	FLNA	P21333	2647 aa	Known RBP	4.61	□□□□□ -1.67
CTNND1-231	ENST00000532463	CHD6	Q8TD26	2715 aa		4.61	□□□□□ -1.67
CTNND1-231	ENST00000532463	KRTAP1-1	Q07627	177 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTNND1-231	ENST00000532463	FREM2	Q5SZK8	3169 aa		4.6	□□□□□ -1.67
CTNND1-231	ENST00000532463	RPS29	P62273	56 aa	Known RBP	4.59	□□□□□ -1.67
CTNND1-231	ENST00000532463	USP34	Q70CQ2	3546 aa		4.59	□□□□□ -1.67
CTNND1-231	ENST00000532463	STAB1	Q9NY15	2570 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTNND1-231	ENST00000532463	ITPR3	Q14573	2671 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTNND1-231	ENST00000532463	CENPE	Q02224	2701 aa		4.58	□□□□□ -1.68
CTNND1-231	ENST00000532463	KRTAP10-1	P60331	282 aa		4.57	□□□□□ -1.68
CTNND1-231	ENST00000532463	SETX	Q7Z333	2677 aa	Known RBP	4.57	□□□□□ -1.68
CTNND1-231	ENST00000532463	BAHCC1	Q9P281	2608 aa		4.56	□□□□□ -1.68
CTNND1-231	ENST00000532463	MYO15A	Q9UKN7	3530 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTNND1-231	ENST00000532463	EYS	Q5T1H1	3165 aa		4.55	□□□□□ -1.68
CTNND1-231	ENST00000532463	TEP1	Q99973	2627 aa	Known RBP	4.55	□□□□□ -1.68
CTNND1-231	ENST00000532463	NBEAL1	Q6ZS30	2694 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNND1-231	ENST00000532463	ZNF292	O60281	2723 aa		4.54	□□□□□ -1.68
CTNND1-231	ENST00000532463	SPTBN5	Q9NRC6	3674 aa	Known RBP	4.54	□□□□□ -1.68
CTNND1-231	ENST00000532463	KRTAP1-5	Q9BYS1	174 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNND1-231	ENST00000532463	TRANK1	O15050	2925 aa		4.53	□□□□□ -1.68
CTNND1-231	ENST00000532463	KRTAP10-8	P60410	259 aa		4.52	□□□□□ -1.69
CTNND1-231	ENST00000532463	MGA	Q8IWI9	3026 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CTNND1-231	ENST00000532463	GCN1	Q92616	2671 aa	Known RBP	4.51	□□□□□ -1.69
CTNND1-231	ENST00000532463	UNC79	Q9P2D8	2635 aa		4.51	□□□□□ -1.69
CTNND1-231	ENST00000532463	KRTAP10-2	P60368	255 aa		4.5	□□□□□ -1.69
CTNND1-231	ENST00000532463	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CTNND1-231	ENST00000532463	NOTCH1	P46531	2555 aa		4.49	□□□□□ -1.69
CTNND1-231	ENST00000532463	DSP	P15924	2871 aa	Known RBP	4.48	□□□□□ -1.69
CTNND1-231	ENST00000532463	NBEAL2	Q6ZNJ1	2754 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CTNND1-231	ENST00000532463	TRIO	O75962	3097 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CTNND1-231	ENST00000532463	VCAN	P13611	3396 aa		4.48	□□□□□ -1.69
CTNND1-231	ENST00000532463	SPEG	Q15772	3267 aa		4.46	□□□□□ -1.7
CTNND1-231	ENST00000532463	TEX15	Q9BXT5	2789 aa		4.44	□□□□□ -1.7
CTNND1-231	ENST00000532463	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	4.44	□□□□□ -1.7
CTNND1-231	ENST00000532463		Q6ZRN7	208 aa	Predicted RBP	4.44	□□□□□ -1.7
CTNND1-231	ENST00000532463	IGSF10	Q6WRI0	2623 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CTNND1-231	ENST00000532463	KRTAP21-3	Q3LHN1	58 aa		4.43	□□□□□ -1.7
CTNND1-231	ENST00000532463	FRY	Q5TBA9	3013 aa		4.42	□□□□□ -1.7
CTNND1-231	ENST00000532463	COL6A3	P12111	3177 aa		4.4	□□□□□ -1.7
CTNND1-231	ENST00000532463	COL6A5	A8TX70	2615 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CTNND1-231	ENST00000532463	VPS13A	Q96RL7	3174 aa		4.4	□□□□□ -1.71
CTNND1-231	ENST00000532463	CELSR3	Q9NYQ7	3312 aa		4.39	□□□□□ -1.71
CTNND1-231	ENST00000532463		H0YAA0	97 aa		4.39	□□□□□ -1.71

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