RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000470815.1

HERC3-208, Transcript of HECT and RLD domain containing E3 ubiquitin protein ligase 3, humanhuman

TSL 4

Gene HERC3, Length 564 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3-208ENST00000470815 TNRC6CQ9HCJ0 1690 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
HERC3-208ENST00000470815 CCDC18Q5T9S5 1454 aa-0.21□□□□□ -2.44
HERC3-208ENST00000470815 STAB2Q8WWQ8 2551 aa-0.21□□□□□ -2.44
HERC3-208ENST00000470815 LRP1BQ9NZR2 4599 aa-0.21□□□□□ -2.44
HERC3-208ENST00000470815 DEFB130BP0DP73 79 aa-0.21□□□□□ -2.44
HERC3-208ENST00000470815 DEFB130AP0DP74 79 aa-0.21□□□□□ -2.44
HERC3-208ENST00000470815 NWD1Q149M9 1564 aa-0.21□□□□□ -2.44
HERC3-208ENST00000470815 LAMA5O15230 3695 aa-0.21□□□□□ -2.44
HERC3-208ENST00000470815 PIK3C2BO00750 1634 aa-0.21□□□□□ -2.44
HERC3-208ENST00000470815 MAP3K4Q9Y6R4 1608 aa-0.21□□□□□ -2.44
HERC3-208ENST00000470815 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP-0.21□□□□□ -2.44
HERC3-208ENST00000470815 C4AP0C0L4 1744 aa-0.21□□□□□ -2.44
HERC3-208ENST00000470815 C4BP0C0L5 1744 aa-0.21□□□□□ -2.44
HERC3-208ENST00000470815 NBASA2RRP1 2371 aa-0.21□□□□□ -2.44
HERC3-208ENST00000470815 ARHGAP35Q9NRY4 1499 aa-0.22□□□□□ -2.44
HERC3-208ENST00000470815 RB1CC1Q8TDY2 1594 aa-0.22□□□□□ -2.44
HERC3-208ENST00000470815 H3BNG1 76 aa-0.22□□□□□ -2.44
HERC3-208ENST00000470815 CRIP1P50238 77 aa-0.22□□□□□ -2.44
HERC3-208ENST00000470815 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa-0.22□□□□□ -2.44
HERC3-208ENST00000470815 SCN11AQ9UI33 1791 aa-0.22□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 ARFGEF2Q9Y6D5 1785 aa-0.22□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 SONP18583 2426 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 HECTD1Q9ULT8 2610 aa-0.23□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa-0.23□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 H3BVH4 76 aa-0.23□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 SPRR2EP22531 72 aa-0.23□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 MT4P47944 62 aa-0.23□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 DSPP15924 2871 aaKnown RBP-0.23□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 SETD2Q9BYW2 2564 aaPredicted RBP-0.23□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 MAGI3Q5TCQ9 1506 aa-0.23□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 DCAF1Q9Y4B6 1507 aa-0.23□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 CREBBPQ92793 2442 aa-0.24□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 COL6A5A8TX70 2615 aa-0.24□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 PDZD2O15018 2839 aa-0.24□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 NBPF19A0A087WUL8 3843 aa-0.24□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 LYNX1G3V0Z9 82 aa-0.24□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 IAPPP10997 89 aa-0.24□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 KRTAP19-8Q3LI54 63 aa-0.24□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 ENHOQ6UWT2 76 aa-0.24□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 FLGP20930 4061 aaPredicted RBP-0.24□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 NESP48681 1621 aa-0.24□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 LYSTQ99698 3801 aa-0.24□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 WIZO95785 1651 aa-0.24□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 PKHD1P08F94 4074 aa-0.24□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 RIF1Q5UIP0 2472 aaKnown RBP-0.25□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 TGP01266 2768 aa-0.25□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP-0.25□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 DEFB131BA0A096LNP1 70 aa-0.25□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 CD163L1Q9NR16 1453 aa-0.25□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 ABCC1P33527 1531 aa-0.25□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 KDM5DQ9BY66 1539 aa-0.25□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 TIAM2Q8IVF5 1701 aa-0.25□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 DMXL1Q9Y485 3027 aa-0.26□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 RICTORQ6R327 1708 aa-0.26□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 PRLHP81277 87 aa-0.26□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 KCNQ1DNQ9H478 68 aa-0.26□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 HILPDAQ9Y5L2 63 aa-0.26□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 NF1P21359 2839 aa-0.26□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 LAMA2P24043 3122 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 PLCH1Q4KWH8 1693 aa-0.27□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 PLXNC1O60486 1568 aa-0.27□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 USP9YO00507 2555 aaPredicted RBP-0.27□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 CCDC88BA6NC98 1476 aa-0.27□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa-0.27□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 RRBP1Q9P2E9 1410 aaKnown RBP-0.27□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 MT1AP04731 61 aa-0.27□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 PKD1P98161 4303 aa-0.27□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 DIP2AQ14689 1571 aa-0.28□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 ANKARQ7Z5J8 1434 aa-0.28□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 ANKRD50Q9ULJ7 1429 aa-0.28□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 DNAH7Q8WXX0 4024 aa-0.28□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 SPRR2FQ96RM1 72 aa-0.28□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 UBL5Q9BZL1 73 aa-0.28□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 S4R3F8 94 aa-0.28□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 DEPDC5O75140 1603 aa-0.28□□□□□ -2.45
HERC3-208ENST00000470815 ZZEF1O43149 2961 aa-0.29□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 DDX60LQ5H9U9 1706 aaKnown RBP-0.29□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 CUBNO60494 3623 aa-0.29□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa-0.29□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 C9orf92A6NGG3 77 aa-0.29□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 DEFB106AQ8N104 65 aa-0.29□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 CFAP74Q9C0B2 1584 aa-0.29□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 TACC2O95359 2948 aa-0.29□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 MXRA5Q9NR99 2828 aa-0.29□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 HTTP42858 3142 aa-0.29□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 COL12A1Q99715 3063 aa-0.29□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 SPG11Q96JI7 2443 aa-0.29□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 TJP1Q07157 1748 aa-0.3□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 CFAP43Q8NDM7 1665 aa-0.3□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 PLECQ15149 4684 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
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HERC3-208ENST00000470815 ATXN8Q156A1 80 aa-0.3□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 SMCO4Q9NRQ5 59 aa-0.3□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 LMTK2Q8IWU2 1503 aa-0.3□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 USP9XQ93008 2570 aaPredicted RBP-0.3□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 RALGAPBQ86X10 1494 aa-0.3□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 FASNP49327 2511 aaKnown RBP-0.3□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 MYO15AQ9UKN7 3530 aa-0.3□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 DYNC1H1Q14204 4646 aaKnown RBP-0.31□□□□□ -2.46
HERC3-208ENST00000470815 ABCA8O94911 1581 aa-0.31□□□□□ -2.46
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