RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000463378.5

RBBP4-208, Transcript of RB binding protein 4, chromatin remodeling factor, human

TSL 5

Gene RBBP4, Length 882 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
RBBP4-208	ENST00000463378	IGF2R	P11717	2491 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	SPTAN1	Q13813	2472 aa	Known RBP	2.87	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	2.87	□□□□□ -1.95	5e-8	■■■■■ 58.7
RBBP4-208	ENST00000463378	DCHS2	Q6V1P9	2916 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	CFAP47	Q6ZTR5	3102 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	IGLV5-48	A0A075B6I7	105 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	hDV103S1	A0JD37	113 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378		H3BNG1	76 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	DEFB4A	O15263	64 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	LCA10	Q71F78	164 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	KCNQ1DN	Q9H478	68 aa		2.87	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	HCG22	E2RYF7	251 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	UBE2B	P63146	152 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	KRTAP5-1	Q6L8H4	278 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	CYP4F30P	Q9H0H9	118 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	SMG1	Q96Q15	3661 aa	Known RBP	2.86	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	ADGRG4	Q8IZF6	3080 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	BOD1L1	Q8NFC6	3051 aa		2.86	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	LOC400499	M0QZD8	3231 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	WDFY4	Q6ZS81	3184 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	PRB1	P04280	392 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	SPRR4	Q96PI1	79 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	LIMD2	Q9BT23	127 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	HIVEP3	Q5T1R4	2406 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	AKAP6	Q13023	2319 aa		2.85	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	ZFHX4	Q86UP3	3567 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A0G2JQZ4	141 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	LCE6A	A0A183	80 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC01554	Q52M75	96 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378		Q6ZRX8	168 aa		2.84	□□□□□ -1.95
RBBP4-208	ENST00000463378	TRAV22	A0A0B4J277	110 aa		2.83	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	CREBBP	Q92793	2442 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	PIEZO1	Q92508	2521 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	CR1	P17927	2039 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	SPEN	Q96T58	3664 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378		K7EQZ3	153 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC01556	Q5JQF7	62 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	WFDC10B	Q8IUB3	73 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	ZCCHC13	Q8WW36	166 aa	Known RBP	2.82	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC00208	Q96KT6	92 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	CSPG4	Q6UVK1	2322 aa		2.82	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	NCOR2	Q9Y618	2525 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	SPTBN4	Q9H254	2564 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378		H0Y9P7	68 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	CHKB-CPT1B	H3BT56	60 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	ATM	Q13315	3056 aa		2.81	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	DCHS1	Q96JQ0	3298 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	CHD8	Q9HCK8	2581 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	ACACB	O00763	2458 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	DOPEY1	Q5JWR5	2465 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	SPRR1A	P35321	89 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	KRTAP26-1	Q6PEX3	210 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	CASC2	Q6XLA1	102 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	SPG11	Q96JI7	2443 aa		2.8	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	DMXL1	Q9Y485	3027 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	CACNA1A	O00555	2505 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	DEFB131B	A0A096LNP1	70 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	ATP11AUN	Q6ZP68	121 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	PRR15L	Q9BU68	103 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	CSMD1	Q96PZ7	3565 aa		2.79	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	PKD1L2	Q7Z442	2459 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378		A0A087WSZ3	146 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	KRTAP5-4	Q6L8H1	288 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	PP632	Q6XCG6	107 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	SPTSSB	Q8NFR3	76 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	TP53AIP1	Q9HCN2	124 aa		2.78	□□□□□ -1.96
RBBP4-208	ENST00000463378	ANKRD17	O75179	2603 aa	Known RBP	2.77	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	BSN	Q9UPA5	3926 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	USP9Y	O00507	2555 aa	Predicted RBP	2.76	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	MYO18B	Q8IUG5	2567 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	CELSR1	Q9NYQ6	3014 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	KRTAP5-9	P26371	169 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	TPRXL	Q17RH7	258 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378		Q5VV11	94 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	WNK1	Q9H4A3	2382 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	FAM208B	Q5VWN6	2430 aa		2.76	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	NAV2	Q8IVL1	2488 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	LOC101927531	A0A1B0GV80	90 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	RPL37A	P61513	92 aa	Known RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	LCE3A	Q5TA76	89 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	COA5	Q86WW8	74 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	KRTAP4-4	Q9BYR3	166 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	MAP1A	P78559	2803 aa	Predicted RBP	2.75	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	CHD6	Q8TD26	2715 aa		2.75	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	MYO9A	B2RTY4	2548 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	ASPM	Q8IZT6	3477 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	C7orf65	Q6ZTY9	151 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	CDC42SE1	Q9NRR8	79 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	USP9X	Q93008	2570 aa	Predicted RBP	2.74	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	LRRK2	Q5S007	2527 aa		2.74	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	ASH1L	Q9NR48	2969 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	PTPN13	Q12923	2485 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	CNBP	P62633	177 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	PRLH	P81277	87 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	PHF5A	Q7RTV0	110 aa	Known RBP	2.73	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	C9orf163	Q8N9P6	203 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	LINC01558	Q9Y6Z2	57 aa		2.73	□□□□□ -1.97
RBBP4-208	ENST00000463378	LAMA5	O15230	3695 aa		2.72	□□□□□ -1.97

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