RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000449186.2

RPRD1B-202, Transcript of regulation of nuclear pre-mRNA domain containing 1B, humanhuman

TSL 4

Gene RPRD1B, Length 591 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Ribosome .

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPRD1B-202ENST00000449186 hADV29S1A0JD25 119 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-202ENST00000449186 TRIAP1O43715 76 aa6.33□□□□□ -1.4
RPRD1B-202ENST00000449186 CLEC2BQ92478 149 aa6.32□□□□□ -1.4
RPRD1B-202ENST00000449186 SLC25A20O43772 301 aa6.31□□□□□ -1.4
RPRD1B-202ENST00000449186 HRCT1Q6UXD1 115 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-202ENST00000449186 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-202ENST00000449186 LAMTOR3Q9UHA4 124 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-202ENST00000449186 LPAP08519 4548 aa6.3□□□□□ -1.4
RPRD1B-202ENST00000449186 PRR4Q16378 134 aa6.29□□□□□ -1.4
RPRD1B-202ENST00000449186 SSBP3-AS1Q7Z2R9 100 aa6.29□□□□□ -1.4
RPRD1B-202ENST00000449186 TSTD3H0UI37 97 aa6.28□□□□□ -1.4
RPRD1B-202ENST00000449186 PSMB2P49721 201 aa6.28□□□□□ -1.4
RPRD1B-202ENST00000449186 H0YGX0 51 aa6.27□□□□□ -1.41
RPRD1B-202ENST00000449186 BATFQ16520 125 aa6.27□□□□□ -1.41
RPRD1B-202ENST00000449186 UNQ6493/PRO21345Q6UXR8 122 aaPredicted RBP6.27□□□□□ -1.41
RPRD1B-202ENST00000449186 M0R143 59 aa6.25□□□□□ -1.41
RPRD1B-202ENST00000449186 SPAG11AQ6PDA7 123 aa6.25□□□□□ -1.41
RPRD1B-202ENST00000449186 LRP2P98164 4655 aa6.24□□□□□ -1.41
RPRD1B-202ENST00000449186 H3BUT2 72 aa6.24□□□□□ -1.41
RPRD1B-202ENST00000449186 SPINK1P00995 79 aa6.23□□□□□ -1.41
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A1B0GV72 72 aa6.21□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 SCGB1C2P0DMR2 95 aa6.21□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 OCIAD2Q56VL3 154 aa6.21□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 IGFL1Q6UW32 110 aa6.21□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 SNHG12Q9BXW3 62 aa6.21□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 F8WEM9 126 aa6.2□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 COX6CP09669 75 aa6.2□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 FABP2P12104 132 aa6.2□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 IGLV8-61A0A075B6I0 122 aa6.19□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa6.19□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A1B0GX51 115 aa6.19□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 NDUFV3P56181 108 aaKnown RBP6.19□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 UBR4Q5T4S7 5183 aa6.19□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 LST1O00453 97 aa6.18□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 TCL1BO95988 128 aa6.18□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 TAX1BP3O14907 124 aa6.17□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 SNCGO76070 127 aa6.17□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 RPS29P62273 56 aaKnown RBP6.17□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 PPDPFLQ8WWR9 84 aa6.17□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 DNAL4O96015 105 aa6.16□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 CD164Q04900 197 aa6.16□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 ORMDL1Q9P0S3 153 aa6.16□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 PCP4L1A6NKN8 68 aa6.15□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 H3BMG7 143 aa6.15□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 TRACP01848 142 aa6.15□□□□□ -1.42
RPRD1B-202ENST00000449186 XP32Q5T750 250 aa6.14□□□□□ -1.43
RPRD1B-202ENST00000449186 Q6JHZ5 121 aa6.14□□□□□ -1.43
RPRD1B-202ENST00000449186 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa6.13□□□□□ -1.43
RPRD1B-202ENST00000449186 C9orf118A6NHY6 69 aa6.13□□□□□ -1.43
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP13-3Q3SY46 172 aa6.13□□□□□ -1.43
RPRD1B-202ENST00000449186 BAALC-AS2P0C853 105 aa6.12□□□□□ -1.43
RPRD1B-202ENST00000449186 C1orf195Q5TG92 126 aa6.12□□□□□ -1.43
RPRD1B-202ENST00000449186 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP6.12□□□□□ -1.43
RPRD1B-202ENST00000449186 LIMD2Q9BT23 127 aa6.12□□□□□ -1.43
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A1W2PNM2 257 aa6.11□□□□□ -1.43
RPRD1B-202ENST00000449186 ATXN8Q156A1 80 aa6.11□□□□□ -1.43
RPRD1B-202ENST00000449186 TPRXLQ17RH7 258 aa6.11□□□□□ -1.43
RPRD1B-202ENST00000449186 TMEM256-PLSCR3K7ERE1 68 aa6.1□□□□□ -1.43
RPRD1B-202ENST00000449186 Q5XG85 94 aa6.1□□□□□ -1.43
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A1W2PPM0 123 aa6.09□□□□□ -1.43
RPRD1B-202ENST00000449186 MTURNQ8N3F0 131 aa6.09□□□□□ -1.43
RPRD1B-202ENST00000449186 CDIP1Q9H305 208 aa6.09□□□□□ -1.43
RPRD1B-202ENST00000449186 UBE2V1Q13404 147 aa6.08□□□□□ -1.44
RPRD1B-202ENST00000449186 ANKRD29Q8N6D5 301 aa6.08□□□□□ -1.44
RPRD1B-202ENST00000449186 A0A087WSZ3 146 aa6.07□□□□□ -1.44
RPRD1B-202ENST00000449186 C9orf92A6NGG3 77 aa6.07□□□□□ -1.44
RPRD1B-202ENST00000449186 C9JAW5 83 aa6.07□□□□□ -1.44
RPRD1B-202ENST00000449186 GHRHP01286 108 aa6.07□□□□□ -1.44
RPRD1B-202ENST00000449186 Q6Q795 121 aa6.06□□□□□ -1.44
RPRD1B-202ENST00000449186 TEN1Q86WV5 123 aa6.06□□□□□ -1.44
RPRD1B-202ENST00000449186 COL5A1-AS1Q5SY13 56 aa6.05□□□□□ -1.44
RPRD1B-202ENST00000449186 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa6.04□□□□□ -1.44
RPRD1B-202ENST00000449186 TRBV7-4A0A0J9YYF1 115 aa6.04□□□□□ -1.44
RPRD1B-202ENST00000449186 H3BQ85 93 aa6.04□□□□□ -1.44
RPRD1B-202ENST00000449186 LYRM7Q5U5X0 104 aa6.04□□□□□ -1.44
RPRD1B-202ENST00000449186 CCKP06307 115 aa6.03□□□□□ -1.44
RPRD1B-202ENST00000449186 RBM3P98179 157 aaKnown RBP6.03□□□□□ -1.44
RPRD1B-202ENST00000449186 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa6.03□□□□□ -1.44
RPRD1B-202ENST00000449186 Q96NJ1 140 aa6.03□□□□□ -1.44
RPRD1B-202ENST00000449186 VPS25Q9BRG1 176 aa6.03□□□□□ -1.44
RPRD1B-202ENST00000449186 RNF213Q63HN8 5207 aa6.02□□□□□ -1.45
RPRD1B-202ENST00000449186 SPCS1Q9Y6A9 102 aa6.02□□□□□ -1.45
RPRD1B-202ENST00000449186 MUC17Q685J3 4493 aa6.02□□□□□ -1.45
RPRD1B-202ENST00000449186 DEFB116Q30KQ4 102 aa6□□□□□ -1.45
RPRD1B-202ENST00000449186 DSCR8Q96T75 97 aa6□□□□□ -1.45
RPRD1B-202ENST00000449186 C14orf132Q9NPU4 83 aa6□□□□□ -1.45
RPRD1B-202ENST00000449186 Q6ZQT0 140 aa5.98□□□□□ -1.45
RPRD1B-202ENST00000449186 OBSCN-AS1Q96MR7 158 aa5.98□□□□□ -1.45
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP4-1Q9BYQ7 146 aa5.98□□□□□ -1.45
RPRD1B-202ENST00000449186 SS18L2Q9UHA2 77 aa5.97□□□□□ -1.45
RPRD1B-202ENST00000449186 LOC110117498A0A087WWA1 95 aa5.96□□□□□ -1.46
RPRD1B-202ENST00000449186 K7EP34 96 aa5.96□□□□□ -1.46
RPRD1B-202ENST00000449186 KRTAP4-8Q9BYQ9 185 aa5.96□□□□□ -1.46
RPRD1B-202ENST00000449186 PRO0461Q9UI25 63 aa5.96□□□□□ -1.46
RPRD1B-202ENST00000449186 MUC2Q02817 5179 aa5.95□□□□□ -1.46
RPRD1B-202ENST00000449186 JMJD7-PLA2G4BH0Y9G9 81 aa5.95□□□□□ -1.46
RPRD1B-202ENST00000449186 H3BT86 120 aa5.95□□□□□ -1.46
RPRD1B-202ENST00000449186 LINC00472Q9H8W2 130 aa5.95□□□□□ -1.46
RPRD1B-202ENST00000449186 SIGMAR1Q99720 223 aa5.94□□□□□ -1.46
RPRD1B-202ENST00000449186 IGKV4-1P06312 121 aa5.93□□□□□ -1.46
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 55.5 ms