RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000392011.6

SH3BP4-202, Transcript of SH3 domain binding protein 4, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SH3BP4, Length 5,194 nt, Biotype protein coding.

RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC01600Q96MT4 127 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 FRYLO94915 3013 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLV5-37A0A075B6J1 123 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 KALRNO60229 2985 aa10.94□□□□□ -0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 C9orf92A6NGG3 77 aa10.93□□□□□ -0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 ITPR1Q14643 2758 aa10.91□□□□□ -0.66
SH3BP4-202ENST00000392011 WIPF1O43516 503 aa10.89□□□□□ -0.67
SH3BP4-202ENST00000392011 Q8NDZ9 215 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP4-202ENST00000392011 COL12A1Q99715 3063 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP4-202ENST00000392011 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa10.88□□□□□ -0.67
SH3BP4-202ENST00000392011 ADGRG4Q8IZF6 3080 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP4-202ENST00000392011 BAHCC1Q9P281 2608 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP4-202ENST00000392011 TNP2Q05952 138 aa10.87□□□□□ -0.67
SH3BP4-202ENST00000392011 AFDN-AS1Q9Y6Z5 254 aaPredicted RBP10.85□□□□□ -0.67
SH3BP4-202ENST00000392011 REV3LO60673 3130 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP4-202ENST00000392011 STAB2Q8WWQ8 2551 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP4-202ENST00000392011 CYP4F30PQ9H0H9 118 aa10.84□□□□□ -0.67
SH3BP4-202ENST00000392011 J3QL48 77 aa10.82□□□□□ -0.68
SH3BP4-202ENST00000392011 UQCR11O14957 56 aa10.82□□□□□ -0.68
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC00336Q6ZUF6 198 aa10.82□□□□□ -0.68
SH3BP4-202ENST00000392011 DNAH14Q0VDD8 3507 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP4-202ENST00000392011 OCR1Q9BZK8 76 aa10.8□□□□□ -0.68
SH3BP4-202ENST00000392011 ASH1LQ9NR48 2969 aaKnown RBP10.76□□□□□ -0.69
SH3BP4-202ENST00000392011 FLG2Q5D862 2391 aaPredicted RBP10.75□□□□□ -0.69
SH3BP4-202ENST00000392011 COL6A3P12111 3177 aa10.74□□□□□ -0.69
SH3BP4-202ENST00000392011 Q8N1X5 172 aa10.72□□□□□ -0.69
SH3BP4-202ENST00000392011 MIR22HGQ0VDD5 57 aa10.71□□□□□ -0.69
SH3BP4-202ENST00000392011 SPANXA2-OT1Q8N9U9 137 aa10.71□□□□□ -0.69
SH3BP4-202ENST00000392011 ITPR2Q14571 2701 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP4-202ENST00000392011 ZZEF1O43149 2961 aa10.7□□□□□ -0.7
SH3BP4-202ENST00000392011 SPRR1AP35321 89 aa10.69□□□□□ -0.7
SH3BP4-202ENST00000392011 PRR26Q8N8Z3 221 aa10.68□□□□□ -0.7
SH3BP4-202ENST00000392011 COX6B2Q6YFQ2 88 aa10.68□□□□□ -0.7
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-202ENST00000392011 LRBAP50851 2863 aa10.66□□□□□ -0.7
SH3BP4-202ENST00000392011 CFAP47Q6ZTR5 3102 aa10.65□□□□□ -0.7
SH3BP4-202ENST00000392011 UTP20O75691 2785 aaKnown RBP10.63□□□□□ -0.71
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP4-202ENST00000392011 CD164Q04900 197 aa10.61□□□□□ -0.71
SH3BP4-202ENST00000392011 PLAC8Q9NZF1 115 aa10.59□□□□□ -0.71
SH3BP4-202ENST00000392011 CYSTM1Q9H1C7 97 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 EYSQ5T1H1 3165 aa10.57□□□□□ -0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa10.55□□□□□ -0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 CELSR2Q9HCU4 2923 aa10.55□□□□□ -0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 SPINT4Q6UDR6 99 aa10.55□□□□□ -0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 HIVEP1P15822 2718 aa10.54□□□□□ -0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 HRES1P13985 223 aa10.52□□□□□ -0.72
SH3BP4-202ENST00000392011 SPEGQ15772 3267 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP10.52□□□□□ -0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A0D9SG42 100 aa10.51□□□□□ -0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 SPRR1BP22528 89 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 RBM12B-AS1Q9P1G2 102 aa10.5□□□□□ -0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 FAM229BQ4G0N7 80 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC00472Q9H8W2 130 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 Q8N9P0 234 aaPredicted RBP10.49□□□□□ -0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC01554Q52M75 96 aa10.49□□□□□ -0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 ZANQ9Y493 2812 aa10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP10.48□□□□□ -0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 Q1T7F1 81 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 CRIPTQ9P021 101 aa10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 NIPBLQ6KC79 2804 aaeCLIP10.46□□□□□ -0.73
SH3BP4-202ENST00000392011 CDC42SE1Q9NRR8 79 aa10.45□□□□□ -0.74
SH3BP4-202ENST00000392011 TENM4Q6N022 2769 aa10.42□□□□□ -0.74
SH3BP4-202ENST00000392011 KTN1-AS1Q86SY8 53 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP4-202ENST00000392011 APCP25054 2843 aa10.41□□□□□ -0.74
SH3BP4-202ENST00000392011 DCHS2Q6V1P9 2916 aa10.38□□□□□ -0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 Q6ZSA8 131 aa10.38□□□□□ -0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 PANO1I0J062 215 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 CRYBG3Q68DQ2 2970 aa10.37□□□□□ -0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 ZCCHC13Q8WW36 166 aaKnown RBP10.36□□□□□ -0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP10-2P60368 255 aa10.35□□□□□ -0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP10-1P60331 282 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 DMXL1Q9Y485 3027 aa10.34□□□□□ -0.75
SH3BP4-202ENST00000392011 Q5W150 140 aa10.33□□□□□ -0.76
SH3BP4-202ENST00000392011 Q5XG85 94 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-202ENST00000392011 LCA10Q71F78 164 aa10.32□□□□□ -0.76
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A1B0GU33 70 aa10.31□□□□□ -0.76
SH3BP4-202ENST00000392011 Q75L30 129 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa10.28□□□□□ -0.76
SH3BP4-202ENST00000392011 LOC400499M0QZD8 3231 aa10.26□□□□□ -0.77
SH3BP4-202ENST00000392011 NF1P21359 2839 aa10.25□□□□□ -0.77
SH3BP4-202ENST00000392011 SPINK7P58062 85 aa10.24□□□□□ -0.77
SH3BP4-202ENST00000392011 OXTP01178 125 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 LINC00483Q53H64 154 aa10.2□□□□□ -0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 FBN2P35556 2912 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 Q6ZR54 194 aa10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP10.19□□□□□ -0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 Q5VV11 94 aa10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 TNRC18O15417 2968 aaPredicted RBP10.18□□□□□ -0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 USP34Q70CQ2 3546 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 LCE6AA0A183 80 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa10.16□□□□□ -0.78
SH3BP4-202ENST00000392011 MYO15AQ9UKN7 3530 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-202ENST00000392011 A0A087X002 238 aa10.14□□□□□ -0.79
SH3BP4-202ENST00000392011 KRTAP29-1A8MX34 341 aaPredicted RBP10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-202ENST00000392011 Q5VSD8 79 aa10.13□□□□□ -0.79
SH3BP4-202ENST00000392011 CSAG1Q6PB30 78 aa10.12□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 91.8 ms