RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000299084.8

SPRED1-201, Transcript of sprouty related EVH1 domain containing 1, humanhuman

APPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC

Gene SPRED1, Length 7,780 nt, Biotype protein coding, Subcellular localisation Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPRED1-201ENST00000299084 PRUNE2Q8WUY3 3088 aa8.91□□□□□ -0.98
SPRED1-201ENST00000299084 RANBP2P49792 3224 aaKnown RBP8.91□□□□□ -0.98
SPRED1-201ENST00000299084 HECTD1Q9ULT8 2610 aa8.9□□□□□ -0.98
SPRED1-201ENST00000299084 LINC01558Q9Y6Z2 57 aa8.9□□□□□ -0.99
SPRED1-201ENST00000299084 ATRQ13535 2644 aa8.89□□□□□ -0.99
SPRED1-201ENST00000299084 OCR1Q9BZK8 76 aa8.88□□□□□ -0.99
SPRED1-201ENST00000299084 KRTAP16-1A8MUX0 517 aa8.88□□□□□ -0.99
SPRED1-201ENST00000299084 A0A0C4DFX4 3053 aa8.88□□□□□ -0.99
SPRED1-201ENST00000299084 PLAC8Q9NZF1 115 aa8.86□□□□□ -0.99
SPRED1-201ENST00000299084 RPL37P61927 97 aaKnown RBP8.85□□□□□ -0.99
SPRED1-201ENST00000299084 MAST4O15021 2626 aa8.85□□□□□ -0.99
SPRED1-201ENST00000299084 CFAP46Q8IYW2 2715 aa8.85□□□□□ -0.99
SPRED1-201ENST00000299084 ADM2Q7Z4H4 148 aa8.84□□□□□ -0.99
SPRED1-201ENST00000299084 KLK9Q2XQG4 91 aa8.81□□□□□ -1
SPRED1-201ENST00000299084 C20orf166-AS1Q96NR2 134 aa8.81□□□□□ -1
SPRED1-201ENST00000299084 TRANK1O15050 2925 aa8.81□□□□□ -1
SPRED1-201ENST00000299084 CDH23Q9H251 3354 aa8.79□□□□□ -1
SPRED1-201ENST00000299084 FP248Q71RG6 208 aaPredicted RBP8.78□□□□□ -1
SPRED1-201ENST00000299084 FLNAP21333 2647 aaKnown RBP8.78□□□□□ -1
SPRED1-201ENST00000299084 LCE6AA0A183 80 aa8.77□□□□□ -1.01
SPRED1-201ENST00000299084 Q5W150 140 aa8.77□□□□□ -1.01
SPRED1-201ENST00000299084 AKAP13Q12802 2813 aa8.76□□□□□ -1.01
SPRED1-201ENST00000299084 ITPR3Q14573 2671 aa8.75□□□□□ -1.01
SPRED1-201ENST00000299084 CHD9Q3L8U1 2897 aa8.74□□□□□ -1.01
SPRED1-201ENST00000299084 CELSR3Q9NYQ7 3312 aa8.74□□□□□ -1.01
SPRED1-201ENST00000299084 Q5VV11 94 aa8.74□□□□□ -1.01
SPRED1-201ENST00000299084 DNAH14Q0VDD8 3507 aa8.73□□□□□ -1.01
SPRED1-201ENST00000299084 TRIOO75962 3097 aa8.73□□□□□ -1.01
SPRED1-201ENST00000299084 A0A096LNT2 108 aa8.73□□□□□ -1.01
SPRED1-201ENST00000299084 CENPEQ02224 2701 aa8.73□□□□□ -1.01
SPRED1-201ENST00000299084 FLNBO75369 2602 aaKnown RBP8.72□□□□□ -1.01
SPRED1-201ENST00000299084 MGAQ8IWI9 3026 aa8.72□□□□□ -1.01
SPRED1-201ENST00000299084 VPS13AQ96RL7 3174 aa8.71□□□□□ -1.02
SPRED1-201ENST00000299084 DMBT1Q9UGM3 2413 aaPredicted RBP8.7□□□□□ -1.02
SPRED1-201ENST00000299084 MMP24-AS1A0A0U1RRL7 71 aa8.68□□□□□ -1.02
SPRED1-201ENST00000299084 STAB1Q9NY15 2570 aa8.68□□□□□ -1.02
SPRED1-201ENST00000299084 UNC80Q8N2C7 3258 aa8.68□□□□□ -1.02
SPRED1-201ENST00000299084 SPATA8Q6RVD6 105 aa8.67□□□□□ -1.02
SPRED1-201ENST00000299084 HELZ2Q9BYK8 2649 aaKnown RBP8.65□□□□□ -1.03
SPRED1-201ENST00000299084 WDFY4Q6ZS81 3184 aa8.65□□□□□ -1.03
SPRED1-201ENST00000299084 Q8NDZ9 215 aa8.64□□□□□ -1.03
SPRED1-201ENST00000299084 Q5XG85 94 aa8.64□□□□□ -1.03
SPRED1-201ENST00000299084 KRTAP1-3Q8IUG1 177 aa8.63□□□□□ -1.03
SPRED1-201ENST00000299084 KRTAP10-1P60331 282 aa8.59□□□□□ -1.03
SPRED1-201ENST00000299084 KRTAP1-1Q07627 177 aa8.57□□□□□ -1.04
SPRED1-201ENST00000299084 NBEAL1Q6ZS30 2694 aa8.56□□□□□ -1.04
SPRED1-201ENST00000299084 LAMA1P25391 3075 aa8.56□□□□□ -1.04
SPRED1-201ENST00000299084 SPRR1BP22528 89 aa8.56□□□□□ -1.04
SPRED1-201ENST00000299084 A8MUU9 505 aa8.54□□□□□ -1.04
SPRED1-201ENST00000299084 PANO1I0J062 215 aa8.53□□□□□ -1.04
SPRED1-201ENST00000299084 CHD6Q8TD26 2715 aa8.52□□□□□ -1.05
SPRED1-201ENST00000299084 KRTAP10-2P60368 255 aa8.51□□□□□ -1.05
SPRED1-201ENST00000299084 STAB2Q8WWQ8 2551 aa8.51□□□□□ -1.05
SPRED1-201ENST00000299084 NDUFAF8A1L188 74 aa8.49□□□□□ -1.05
SPRED1-201ENST00000299084 LINC00472Q9H8W2 130 aa8.49□□□□□ -1.05
SPRED1-201ENST00000299084 MAP1AP78559 2803 aaPredicted RBP8.48□□□□□ -1.05
SPRED1-201ENST00000299084 SZT2Q5T011 3432 aa8.48□□□□□ -1.05
SPRED1-201ENST00000299084 FRYQ5TBA9 3013 aa8.47□□□□□ -1.05
SPRED1-201ENST00000299084 Q6ZR54 194 aa8.47□□□□□ -1.05
SPRED1-201ENST00000299084 CYSTM1Q9H1C7 97 aa8.47□□□□□ -1.05
SPRED1-201ENST00000299084 TEX15Q9BXT5 2789 aa8.46□□□□□ -1.05
SPRED1-201ENST00000299084 VCANP13611 3396 aa8.46□□□□□ -1.06
SPRED1-201ENST00000299084 TNP1P09430 55 aa8.44□□□□□ -1.06
SPRED1-201ENST00000299084 C10orf95Q9H7T3 257 aa8.44□□□□□ -1.06
SPRED1-201ENST00000299084 REV3LO60673 3130 aa8.44□□□□□ -1.06
SPRED1-201ENST00000299084 ZNF292O60281 2723 aa8.44□□□□□ -1.06
SPRED1-201ENST00000299084 SPRR1AP35321 89 aa8.43□□□□□ -1.06
SPRED1-201ENST00000299084 DSPP15924 2871 aaKnown RBP8.42□□□□□ -1.06
SPRED1-201ENST00000299084 KRTAP25-1Q3LHN0 102 aa8.39□□□□□ -1.07
SPRED1-201ENST00000299084 FREM2Q5SZK8 3169 aa8.39□□□□□ -1.07
SPRED1-201ENST00000299084 KRTAP26-1Q6PEX3 210 aa8.38□□□□□ -1.07
SPRED1-201ENST00000299084 ASB16-AS1Q495Z4 193 aa8.38□□□□□ -1.07
SPRED1-201ENST00000299084 P0C880 135 aa8.36□□□□□ -1.07
SPRED1-201ENST00000299084 COL6A3P12111 3177 aa8.35□□□□□ -1.07
SPRED1-201ENST00000299084 A8MU10 97 aa8.33□□□□□ -1.08
SPRED1-201ENST00000299084 TEP1Q99973 2627 aaKnown RBP8.31□□□□□ -1.08
SPRED1-201ENST00000299084 KRTAP1-5Q9BYS1 174 aa8.3□□□□□ -1.08
SPRED1-201ENST00000299084 GCN1Q92616 2671 aaKnown RBP8.3□□□□□ -1.08
SPRED1-201ENST00000299084 SPTBN5Q9NRC6 3674 aaKnown RBP8.29□□□□□ -1.08
SPRED1-201ENST00000299084 FRYLO94915 3013 aa8.29□□□□□ -1.08
SPRED1-201ENST00000299084 UNC79Q9P2D8 2635 aa8.28□□□□□ -1.08
SPRED1-201ENST00000299084 KALRNO60229 2985 aa8.27□□□□□ -1.09
SPRED1-201ENST00000299084 NOTCH1P46531 2555 aa8.27□□□□□ -1.09
SPRED1-201ENST00000299084 A0A087X002 238 aa8.26□□□□□ -1.09
SPRED1-201ENST00000299084 LRBAP50851 2863 aa8.26□□□□□ -1.09
SPRED1-201ENST00000299084 BAHCC1Q9P281 2608 aa8.26□□□□□ -1.09
SPRED1-201ENST00000299084 USP34Q70CQ2 3546 aa8.25□□□□□ -1.09
SPRED1-201ENST00000299084 KRTAP10-8P60410 259 aa8.25□□□□□ -1.09
SPRED1-201ENST00000299084 COL6A5A8TX70 2615 aa8.25□□□□□ -1.09
SPRED1-201ENST00000299084 RPS29P62273 56 aaKnown RBP8.24□□□□□ -1.09
SPRED1-201ENST00000299084 BOD1L1Q8NFC6 3051 aa8.24□□□□□ -1.09
SPRED1-201ENST00000299084 KMT2BQ9UMN6 2715 aaPredicted RBP8.23□□□□□ -1.09
SPRED1-201ENST00000299084 SETXQ7Z333 2677 aaKnown RBP8.21□□□□□ -1.09
SPRED1-201ENST00000299084 ITPR2Q14571 2701 aa8.21□□□□□ -1.1
SPRED1-201ENST00000299084 PRO2289Q9P1D8 64 aa8.17□□□□□ -1.1
SPRED1-201ENST00000299084 SPEGQ15772 3267 aa8.15□□□□□ -1.1
SPRED1-201ENST00000299084 IGSF10Q6WRI0 2623 aa8.14□□□□□ -1.11
SPRED1-201ENST00000299084 NBEAL2Q6ZNJ1 2754 aa8.14□□□□□ -1.11
SPRED1-201ENST00000299084 EYSQ5T1H1 3165 aa8.13□□□□□ -1.11
SPRED1-201ENST00000299084 A6NN06 94 aa8.09□□□□□ -1.11
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