RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000560957.1

AKAP13-223, Transcript of A-kinase anchoring protein 13, human

TSL 3

Gene AKAP13, Length 751 nt, Biotype retained intron, Subcellular localisation Cytoplasm, Cytosol, Nucleus, Ribosome .

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RNA		Protein				Prediction (catRAPID)		Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol	Ensembl Transcript ID	Gene	UniProt Accession	Length	Protein Status	Prediction Score	Prediction z-Score	p-Value	Fold Change
AKAP13-223	ENST00000560957	NAV3	Q8IVL0	2385 aa		0.79	□□□□□ -2.28
AKAP13-223	ENST00000560957	ETDC	A0A1B0GVM5	59 aa		0.79	□□□□□ -2.28
AKAP13-223	ENST00000560957		K7EMI3	77 aa		0.79	□□□□□ -2.28
AKAP13-223	ENST00000560957	SPRR1A	P35321	89 aa		0.79	□□□□□ -2.28
AKAP13-223	ENST00000560957	ASXL3	Q9C0F0	2248 aa		0.79	□□□□□ -2.28
AKAP13-223	ENST00000560957	CROCC2	H7BZ55	1655 aa		0.78	□□□□□ -2.28
AKAP13-223	ENST00000560957	SERF2	P84101	59 aa		0.78	□□□□□ -2.28
AKAP13-223	ENST00000560957	KNTC1	P50748	2209 aa		0.78	□□□□□ -2.28
AKAP13-223	ENST00000560957	MYO7A	Q13402	2215 aa		0.78	□□□□□ -2.28
AKAP13-223	ENST00000560957	COL6A6	A6NMZ7	2263 aa		0.78	□□□□□ -2.28
AKAP13-223	ENST00000560957	ROS1	P08922	2347 aa		0.78	□□□□□ -2.28
AKAP13-223	ENST00000560957	CAD	P27708	2225 aa		0.77	□□□□□ -2.29
AKAP13-223	ENST00000560957	SNRPGP15	A8MWD9	76 aa		0.77	□□□□□ -2.29
AKAP13-223	ENST00000560957	DDX60L	Q5H9U9	1706 aa	Known RBP	0.77	□□□□□ -2.29
AKAP13-223	ENST00000560957	UGGT1	Q9NYU2	1555 aa		0.76	□□□□□ -2.29
AKAP13-223	ENST00000560957	NMES1	Q9C002	83 aa		0.76	□□□□□ -2.29
AKAP13-223	ENST00000560957	CDKN2A-AS1	Q9UH64	79 aa		0.76	□□□□□ -2.29
AKAP13-223	ENST00000560957	MUC16	Q8WXI7	14507 aa		0.76	□□□□□ -2.29
AKAP13-223	ENST00000560957	TJP1	Q07157	1748 aa		0.75	□□□□□ -2.29
AKAP13-223	ENST00000560957	DEPDC5	O75140	1603 aa		0.75	□□□□□ -2.29
AKAP13-223	ENST00000560957	SPRR1B	P22528	89 aa		0.75	□□□□□ -2.29
AKAP13-223	ENST00000560957	CHD9	Q3L8U1	2897 aa		0.75	□□□□□ -2.29
AKAP13-223	ENST00000560957	IGIP	A6NJ69	53 aa		0.74	□□□□□ -2.29
AKAP13-223	ENST00000560957	LYNX1	G3V0Z9	82 aa		0.74	□□□□□ -2.29
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB105A	Q8NG35	78 aa		0.74	□□□□□ -2.29
AKAP13-223	ENST00000560957	NDUFA3	O95167	84 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AKAP13-223	ENST00000560957	CRIP1	P50238	77 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AKAP13-223	ENST00000560957	PRO3102	Q9H379	93 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AKAP13-223	ENST00000560957	EFCAB6	Q5THR3	1501 aa		0.73	□□□□□ -2.29
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCC8	Q09428	1581 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AKAP13-223	ENST00000560957	H1FX-AS1	Q4G0G2	97 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AKAP13-223	ENST00000560957	FXYD6	Q9H0Q3	95 aa		0.72	□□□□□ -2.29
AKAP13-223	ENST00000560957	KIAA0586	Q9BVV6	1533 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957		H0YAA0	97 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957		M0R1W7	72 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	SPINK4	O60575	86 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	FCER1G	P30273	86 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	NCBP2-AS2	Q69YL0	99 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	CMC2	Q9NRP2	79 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	NRXN3	Q9Y4C0	1643 aa		0.71	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	AGL	P35573	1532 aa		0.7	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	AHCTF1	Q8WYP5	2266 aa		0.7	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	PLN	P26678	52 aa		0.7	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC00158	P58513	81 aa		0.7	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	APLN	Q9ULZ1	77 aa		0.7	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCA5	Q8WWZ7	1642 aa		0.7	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	POLQ	O75417	2590 aa		0.69	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	CACNA1E	Q15878	2313 aa		0.69	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	LELP1	Q5T871	98 aa		0.69	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	BPTF	Q12830	3046 aa		0.68	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	C4A	P0C0L4	1744 aa		0.68	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	C4B	P0C0L5	1744 aa		0.68	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	WFDC13	Q8IUB5	93 aa		0.68	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF462	Q96JM2	2506 aa		0.68	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	GOLGA4	Q13439	2230 aa	Known RBP	0.68	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	CELSR2	Q9HCU4	2923 aa		0.68	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957		H0YGX0	51 aa		0.67	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	REV3L	O60673	3130 aa		0.67	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	PRPF8	Q6P2Q9	2335 aa	Known RBP eCLIP	0.67	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	ZNF292	O60281	2723 aa		0.66	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	URB1	O60287	2271 aa	Known RBP	0.66	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	SPINK6	Q6UWN8	80 aa		0.66	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP19-3	Q7Z4W3	81 aa		0.66	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	TTC28	Q96AY4	2481 aa		0.66	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	IQGAP2	Q13576	1575 aa		0.66	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957		A0A1B0GUL6	1792 aa		0.65	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	TENM4	Q6N022	2769 aa		0.65	□□□□□ -2.3
AKAP13-223	ENST00000560957	LINC01546	A6NGU7	62 aa		0.65	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB109B	Q30KR1	87 aa		0.65	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	KLK9	Q2XQG4	91 aa		0.64	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	SMR3A	Q99954	134 aa		0.64	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	TMEM167B	Q9NRX6	74 aa		0.64	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	BDP1	A6H8Y1	2624 aa		0.64	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	ANK2	Q01484	3957 aa		0.64	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	CACNA1H	O95180	2353 aa		0.63	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	PIEZO1	Q92508	2521 aa		0.63	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	IAPP	P10997	89 aa		0.63	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	TRANK1	O15050	2925 aa		0.63	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	OTOG	Q6ZRI0	2925 aa		0.63	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	TNC	P24821	2201 aa		0.62	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	SMIM27	A0A1W2PRY6	76 aa		0.62	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB130B	P0DP73	79 aa		0.62	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	DEFB130A	P0DP74	79 aa		0.62	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	MINOS1	Q5TGZ0	78 aa		0.62	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	TENM3	Q9P273	2699 aa		0.62	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	APC	P25054	2843 aa		0.62	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	PTPRZ1	P23471	2315 aa	Predicted RBP	0.61	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	CNOT1	A5YKK6	2376 aa	Known RBP	0.61	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	PRH1	P02810	166 aa		0.61	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP2-3	P0C7H8	128 aa		0.61	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP2-4	Q9BYR9	128 aa		0.61	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	KRTAP2-1	Q9BYU5	128 aa		0.61	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	C6orf48	Q9UBA6	75 aa		0.61	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	CSMD3	Q7Z407	3707 aa		0.61	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	ABCA12	Q86UK0	2595 aa		0.61	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	C2CD3	Q4AC94	2353 aa		0.61	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	TOGARAM1	Q9Y4F4	1720 aa		0.61	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	ANKRD36C	Q5JPF3	1778 aa		0.6	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	LOC730098	B7Z3J9	87 aa		0.6	□□□□□ -2.31
AKAP13-223	ENST00000560957	TOMM5	Q8N4H5	51 aa		0.6	□□□□□ -2.31

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