RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000553732.1

TGFB3-AS1-201, TGFB3 antisense RNA 1, humanhuman

TSL 4 BASIC

Gene TGFB3-AS1, Length 580 nt, Biotype lincRNA.

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LINC00526Q96FQ7 95 aa4.62□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 UBE2D4Q9Y2X8 147 aa4.62□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 IGLV4-3A0A075B6K6 122 aa4.61□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 GVQW2A0A096LPI5 108 aaPredicted RBP4.61□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 A0A0J9YXY3 114 aa4.61□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TRBV7-7A0A0K0K1E9 115 aa4.61□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 A0A1B0GUV1 79 aa4.61□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 H0Y9J4 135 aa4.61□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ACYP1P07311 99 aa4.61□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RPL39P62891 51 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PHF5AQ7RTV0 110 aaKnown RBP4.61□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAM19A3Q7Z5A8 133 aa4.61□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TMEM243Q9BU79 118 aa4.61□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TMEM126AQ9H061 195 aa4.61□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 A0A087WZ39 114 aa4.6□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 UBE2L6O14933 153 aa4.6□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TRIAP1O43715 76 aa4.6□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 EIF4EBP3O60516 100 aaPredicted RBP4.6□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TIMM17BO60830 172 aa4.6□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TMEM101Q96IK0 257 aa4.6□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 IMUPQ9GZP8 106 aa4.6□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 IGLV5-45A0A087WSX0 123 aa4.59□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 IGHV1-58A0A0C4DH39 117 aa4.59□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TINCRA0A1B0GVN0 87 aa4.59□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CCDC179H3BU77 68 aa4.59□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 H7C2G1 150 aa4.59□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LST1O00453 97 aa4.59□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 C9orf116Q5BN46 136 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 COPS9Q8WXC6 57 aa4.59□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CHCHD10Q8WYQ3 142 aaPredicted RBP4.59□□□□□ -1.67
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LOC107984640A0A0U1RRK4 108 aa4.58□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TEX49A0A1B0GTD5 131 aa4.58□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZNF561-AS1K7EIQ3 104 aa4.58□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa4.58□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SYCNQ0VAF6 134 aa4.58□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAM104AQ969W3 186 aa4.58□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LITAFQ99732 161 aa4.58□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 KRTAP9-7A8MTY7 169 aa4.57□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 GHRHP01286 108 aa4.57□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 HERVK_113P63121 156 aa4.57□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MEIG1Q5JSS6 88 aa4.57□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SMIM20Q8N5G0 67 aa4.57□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 XCL1P47992 114 aa4.56□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 HERV-K104P63124 156 aa4.56□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RETNLBQ9BQ08 111 aa4.56□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PPDPFQ9H3Y8 114 aa4.56□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CDC42SE2Q9NRR3 84 aa4.56□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NDUFA12Q9UI09 145 aa4.56□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 IGKV2D-29A0A075B6S2 120 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 IGKV2-29A2NJV5 120 aaPredicted RBP4.55□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 COX7A2LO14548 114 aa4.55□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 PRSS2P07478 247 aa4.55□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CRYGAP11844 174 aa4.55□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CXCL5P42830 114 aa4.55□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LINC00643Q86TS7 51 aa4.55□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NDUFA1O15239 70 aa4.54□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TRACP01848 142 aa4.54□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RPL18AQ02543 176 aaKnown RBP4.54□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 DAND5Q8N907 189 aa4.54□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 OPRPNQ99935 248 aaPredicted RBP4.54□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 IGLV7-46A0A075B6I9 117 aa4.53□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 IGLV5-39A0A0G2JS06 123 aa4.53□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAM236AA0A1B0GUQ0 79 aa4.53□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAM236BA0A1B0GV22 79 aa4.53□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 UQCRQO14949 82 aa4.53□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LINC00242Q5T6M2 205 aa4.53□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 C9orf153Q5TBE3 101 aa4.53□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 KRTAP11-1Q8IUC1 163 aa4.53□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LINC01561Q8N1V8 128 aa4.53□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 C3orf22Q8N5N4 141 aa4.53□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CLEC2BQ92478 149 aa4.53□□□□□ -1.68
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 A0A1B0GX51 115 aa4.52□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 UBE2BP63146 152 aa4.52□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ADAMTSL4-AS1Q5T5F5 129 aa4.52□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TYMSOSQ8TAI1 123 aa4.52□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CAMK2N2Q96S95 79 aa4.52□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ATOX1O00244 68 aa4.51□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 MALP21145 153 aa4.51□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TPRXLQ17RH7 258 aa4.51□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LINC00308Q8TCZ7 52 aa4.51□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CDKN2A-AS1Q9UH64 79 aa4.51□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAM168BA1KXE4 195 aa4.5□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 J3KT08 172 aa4.5□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 COX7CP15954 63 aa4.5□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SS18Q15532 418 aa4.5□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 FAM19A5Q7Z5A7 132 aaPredicted RBP4.5□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LINC00959A0A1B0GUT2 108 aa4.49□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 KRTAP9-1A8MXZ3 250 aaPredicted RBP4.49□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 SMIM1B2RUZ4 78 aa4.49□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 NPC2P61916 151 aa4.49□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 C5orf38Q86SI9 138 aa4.49□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 A0A087X002 238 aa4.48□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa4.48□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 TRAV13-1A0A0B4J241 112 aa4.48□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 IGHV3OR16-9A0A0B4J2B5 98 aa4.48□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 ZNF861PO60384 105 aa4.48□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RPS28P62857 69 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 RNASE13Q5GAN3 156 aaKnown RBP4.48□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 CD164L2Q6UWJ8 174 aa4.48□□□□□ -1.69
TGFB3-AS1-201ENST00000553732 LINC00337Q8N6G1 96 aa4.48□□□□□ -1.69
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 44.1 ms