RNA–Protein interactions for RNA: ENST00000552222.5

CS-231, Transcript of citrate synthase, humanhuman

TSL 4

Gene CS, Length 555 nt, Biotype nonsense mediated decay, Subcellular localisation Cytosol .

Download Table  
RNA Protein Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Gene UniProt Accession Length Protein Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CS-231ENST00000552222 PRR26Q8N8Z3 221 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 LINC00308Q8TCZ7 52 aa8.36□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 A0A0U1RQV1 116 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 M0R378 163 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 NDUFC2O95298 119 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 NPC2P61916 151 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 PRR4Q16378 134 aa8.35□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 SPANXB1Q9NS25 103 aaPredicted RBP8.35□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 RPL37AP8A6NKH3 93 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 Q6ZVH6 145 aa8.34□□□□□ -1.07
CS-231ENST00000552222 IGLV1-50A0A075B6I6 118 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-231ENST00000552222 NCR3O14931 201 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-231ENST00000552222 C1orf137Q5JT78 98 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-231ENST00000552222 CEND1Q8N111 149 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-231ENST00000552222 PPDPFQ9H3Y8 114 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-231ENST00000552222 CRCT1Q9UGL9 99 aa8.33□□□□□ -1.08
CS-231ENST00000552222 IGKV2-28A0A075B6P5 120 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-231ENST00000552222 TRBV10-2A0A0K0K1G8 114 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-231ENST00000552222 IGKV2D-28P01615 120 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-231ENST00000552222 IFITM1P13164 125 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-231ENST00000552222 HIST1H4GQ99525 98 aa8.32□□□□□ -1.08
CS-231ENST00000552222 A6NDN8 102 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-231ENST00000552222 COPS9Q8WXC6 57 aa8.31□□□□□ -1.08
CS-231ENST00000552222 IGLV7-43P04211 117 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-231ENST00000552222 FXYD2P54710 66 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-231ENST00000552222 MUSTN1Q8IVN3 82 aa8.29□□□□□ -1.08
CS-231ENST00000552222 TRBV10-3A0A0K0K1G6 114 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-231ENST00000552222 BCE1O60756 84 aa8.28□□□□□ -1.08
CS-231ENST00000552222 A0A1B0GV90 55 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-231ENST00000552222 IGLV6-57P01721 117 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-231ENST00000552222 TMEM126AQ9H061 195 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-231ENST00000552222 KCNQ1DNQ9H478 68 aa8.27□□□□□ -1.09
CS-231ENST00000552222 TMEM238LA0A1B0GVL6 79 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-231ENST00000552222 A0A1B0GWB2 263 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-231ENST00000552222 A6NJY4 79 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-231ENST00000552222 PRYO14603 147 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-231ENST00000552222 TAX1BP3O14907 124 aa8.26□□□□□ -1.09
CS-231ENST00000552222 S100A7L2Q5SY68 101 aa8.25□□□□□ -1.09
CS-231ENST00000552222 ZNF861PO60384 105 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-231ENST00000552222 KRTAP13-1Q8IUC0 172 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-231ENST00000552222 LINC00337Q8N6G1 96 aa8.24□□□□□ -1.09
CS-231ENST00000552222 SPRR1AP35321 89 aa8.23□□□□□ -1.09
CS-231ENST00000552222 NHP2Q9NX24 153 aaKnown RBP8.23□□□□□ -1.09
CS-231ENST00000552222 KRTAP4-16G5E9R7 235 aaPredicted RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-231ENST00000552222 RPL28P46779 137 aaKnown RBP8.22□□□□□ -1.09
CS-231ENST00000552222 DIRC1Q969H9 104 aa8.22□□□□□ -1.09
CS-231ENST00000552222 A4D1N5 150 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 C9orf118A6NHY6 69 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 H0Y9J4 135 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 UBE2AP49459 152 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 OR13C6PQ8NH95 151 aa8.21□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 TRAV23DV6A0A075B6W5 121 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 PRLHP81277 87 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 LCE2DQ5TA82 110 aaPredicted RBP8.2□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 FAM19A1Q7Z5A9 133 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 CBY1Q9Y3M2 126 aa8.2□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 K7ERJ3 54 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 TSPAN13O95857 204 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 MUC17Q685J3 4493 aa8.19□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 TRAV13-2A0A0B4J235 113 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 A0A0B4J2C4 111 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 ETDCA0A1B0GVM5 59 aa8.18□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 ZNF73O43830 326 aaPredicted RBP8.18□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 B5MCH6 92 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 CFC1BP0CG36 223 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 CFC1P0CG37 223 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 RAB37Q96AX2 223 aa8.17□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 KRTAP1-4P0C5Y4 121 aa8.16□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 H3BUT2 72 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 PRO1854Q9UHT4 67 aa8.15□□□□□ -1.1
CS-231ENST00000552222 A0A1W2PPM0 123 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-231ENST00000552222 Q6ZRX8 168 aa8.14□□□□□ -1.11
CS-231ENST00000552222 VAMP3Q15836 100 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-231ENST00000552222 HIGD2AQ9BW72 106 aa8.13□□□□□ -1.11
CS-231ENST00000552222 FABP2P12104 132 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-231ENST00000552222 C6orf99Q4VX62 202 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-231ENST00000552222 SMIM11BQ8TCY0 68 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-231ENST00000552222 SMCR5Q8TEV8 140 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-231ENST00000552222 Q9BRP9 147 aa8.12□□□□□ -1.11
CS-231ENST00000552222 TRBV7-6A0A0J9YX20 115 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-231ENST00000552222 UBE2V1Q13404 147 aa8.11□□□□□ -1.11
CS-231ENST00000552222 RPL13AP40429 203 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-231ENST00000552222 ELOF1P60002 83 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-231ENST00000552222 NAA38Q9BRA0 125 aaKnown RBP8.1□□□□□ -1.11
CS-231ENST00000552222 K7EP34 96 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-231ENST00000552222 COX7BP24311 80 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-231ENST00000552222 GTF2H5Q6ZYL4 71 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-231ENST00000552222 RETNLBQ9BQ08 111 aa8.09□□□□□ -1.11
CS-231ENST00000552222 ERC2-IT1O76042 136 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-231ENST00000552222 LYRM7Q5U5X0 104 aa8.08□□□□□ -1.12
CS-231ENST00000552222 SPRR4Q96PI1 79 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-231ENST00000552222 DHRS4-AS1Q9P1J3 65 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-231ENST00000552222 SPCS1Q9Y6A9 102 aa8.07□□□□□ -1.12
CS-231ENST00000552222 ANAPC11Q9NYG5 84 aa8.06□□□□□ -1.12
CS-231ENST00000552222 ZNF706Q9Y5V0 76 aaPredicted RBP8.06□□□□□ -1.12
CS-231ENST00000552222 H7C2G1 150 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-231ENST00000552222 FAM229BQ4G0N7 80 aa8.04□□□□□ -1.12
CS-231ENST00000552222 TRBV20-1A0A075B6N2 111 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-231ENST00000552222 A0A087X002 238 aa8.03□□□□□ -1.12
CS-231ENST00000552222 Q1RN00 199 aa8.03□□□□□ -1.12
Retrieved 100 of 20,778 RNA–protein pairs in 76.3 ms